G74160


Basic Information

Item Value
gene id G74160
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030128.1
NCBI id CM030128.1
chromosome length 42883965
location 38597368 ~ 38644538 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU92593
CTCCCTGTAGGACCCTCACCTTGAACTCCTTCCCCGGCTGGAAGGGGAAGTTGGTCTCACGCTGTTCCTGACCCCAGCTCCACTTCTGCCTTGAGTTGAGCACAATGTGACTCCCTGAGAATCGAGGGTTGAAGTGCAGTGCCAAGTCTTCATCAGAGTGCCCAATCTCAATGGCAAAACCTGAAGGCACCTAGAGGGATATACCCTCTGATTGTCATGGTTTCTCCTTTCCTGAATGTCTGCCTTTGCTCAACATtctgcacacaaaaataaataaaactaaaatgtattattcagcaTCTCGGCTAACTTCACTGATCTGAATCTTGGTTCAGTTAGTGGAGACAgggatattaatttaatatgcaaaaatgtgcttttctatAGAAAACTGAAGACTCTGTGGACCTCTGGGACCGAgggcctgattaaatcaaaactttgacccacccactaatagaaaactatacAGAATTGtgctcagttgcggcttcatttttagtaagatgacactttcttctaatcagaaatgtaaccgctatgatgtacaggtttgtagtttgccgACTTTGTGAACACTGCTGTAGCTCAGAggtcagtacagtacagcagggatctccgtcaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacatcgttagcacataatatttatttcttggcagacgccgtTAACCAGtgcgacttacaaaacaaactTATGAATTAACAGAAGATTATTTCTTGTGGGATATTTTTCTACACATGCTGCACGAAGCACTTTCAATGTAATCAATCGCTTTACATTTGCAAGTGAAATTTGGTTGTGAATGCACTGAAGGATGTTTGACCTAGCCATTTCACATTACACTGTTTTACCAACTAAGGAATTGATGCAAAGTACTGCAAAAATCTATGATTCAGTAAAGTTTGATTATGTTAAAACATTtctcacacacatttcaattacCGCTTTCCATGTGATAGGCATGTCAAATGCGTagtgtttgttaatgttttatatttttctatgtaaTAAACTGATATTTGGACACGAACGTTTTCTACGCGCGCTGACAAAACAGCACTCACATCGCCTGCGCAGCGGCGGGACAGagccagcagcagcacagccgTCACAACCCGAGGTGCAGTGAGTGAGGCGCGGCCTCCCAGGCCGAggcgccgccgccgccgctgtCCATCTGTCCGCAGCCCCGGAGTCAACACATCAGTCCCGCTCCTCATATCAGCTGGGCAGggcttttaaacttttaaataataaaaccaaacgAACAAATAATACTACTGATAATCACGGTTTACATAGAAGTCCTGTTTATGTGTAAGTTATTAAAGTGTTTCCGAATTAATGAGATCGATATGTAAGCCTTATGTTGGATATATACTCTTTGCACAATACAACAATGCTCTATCGACTCTCTCTAATGGCATCCGACTGCGTGTAACGTCAGCGGCGCACAGTACCAGCGCGCACTCATCACACCCGACTCTGGACAGGCGATTCCTCAGTCATGTGACTCCGTTCGAGACAGGCGTTTATTCTTAGTGTGGTGTcgtgtgttttttcattggtAAACGGCGCTATATCATATGCAGTGGTATATAGAGGCACAGGTGATGAAGCCATTCAAGTTTAAGTTACTTattgtgagggagagagagcgccAAGACAACCCCTGTTGTTTGTCACATGATAAACCCAAACCCACCTCTTTGACGCAGTGTGCGGGGATGAGTTTtagctgtgtatgtgtgtgtattttcgATGTGTGTTTATACCCTGTGTGGGTGCGAATGCGcacaattgtgtgtttttatatgcatttaggaaacttaaaaaagcaatacaaacaaatcaataaaaaaagaccCAGGAACGGTTACACAAGAGAACTTTTAATAGTAAATAGAACAGTTGAGAAATGGGACTGCAAAGCAAACAATACTGATTCCTTTAGTTTTCCCTGTGGATATGAATAGCTGATGGGGATTTCTAGGTATTGCAAGGTGNNNNNNNNNNgggggggggggggggggggggggggggggggggcagactCTGCATTGAAGCAAAGCAAAAGAACAGACCAACCAATTAAAAAGCTATACTAGTGTTCAGCTGCAGATTTCAGTGGTGATGAGATATCTGTGTGACCCCATCAAATAACAGCAGTGTGAAGAGGTTAGCATTTTTGTCCACTGCAGGTAAGTTGAAGATTACAGAGCTATTGgtaagtgtgtgagagagcatgCTTGTGTGAGTAccagtgtgtgtacatattCTATGGTCGTGTGTGGTCCTGGGTGCATGTGGACACACAAAGAACATAAAGACTAATTTAAACAGTACTCAAGGTTCTAAGGATTTTAAGCAGCACTCTAGCACCAGACCCCAGTGACTTGTGTACCAAGTGTAAGTATGTGCACTCTTCCTGTGTAAAACAGTCTAACGTTCAGGACAGTGTTTTCACTGCAATCTGGAGATAGATATTACTATGCTTTTATATAGGCGAAGGTCTGTGACTGATAGATATTAGAGTCAGTCTGCAAATGTTGTGCTTccaaaggaagagaaaaatacCCAACCTCTGTACTCAGTGCTGAACCCTGGCAGACCCCTTATTTGATATGGATGGACACAAGCTGGACTTCGCCTTCCAGCTGCATGTACAGGAACTGGTCGTCTCCCAGGCGATTGGGGAAGTGGATCACAGAGCCGTCAGAGAGCTTCACCTCGAATGAGTCGTTGTTGTGGGTGATGTAGACCTGAACTCCTCCCCCTGCTGGAAGGGAAATGAAGACTCTCTCTGCTCGCTGCCCCAGGCCCCGCCCTGCCGAGAGTTCATTACGATGGTGCGCAAGTCACCGTGGGCGTCGAAGCGGGGGTTAAAGTGCAGAGCCACATCATTCTCTGAGTGACCCAAGTTGATGGCAAACCTGCAGGAGAACGAGGGAGGGATTCCTAGTTGAATTCACTGGTTCTTAAAAATTGCAGTTTCAACCACAGATGCCCACCATAACAGGAA
>TU92594
CTCCCTGTAGGACCCTCACCTTGAACTCCTTCCCCGGCTGGAAGGGGAAGTTGGTCTCACGCTGTTCCTGACCCCAGCTCCACTTCTGCCTTGAGTTGAGCACAATGTGACTCCCTGAGAATCGAGGGTTGAAGTGCAGTGCCAAGTCTTCATCAGAGTGCCCAATCTCAATGGCAAAACCTGAAGGCACCTAGAGGGATATACCCTCTGATTGTCATGGTTTCTCCTTTCCTGAATGTCTGCCTTTGCTCAACATtctgcacacaaaaataaataaaactaaaatgtattattcagcaTCTCGGCTAACTTCACTGATCTGAATCTTGGTTCAGTTAGTGGAGACAgggatattaatttaatatgcaaaaatgtgcttttctatAGAAAACTGAAGACTCTGTGGACCTCTGGGACCGAgggcctgattaaatcaaaactttgacccacccactaatagaaaactatacAGAATTGtgctcagttgcggcttcatttttagtaagatgacactttcttctaatcagaaatgtaaccgctatgatgtacaggtttgtagtttgccgACTTTGTGAACACTGCTGTAGCTCAGAggtcagtacagtacagcagggatctccgtcaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacatcgttagcacataatatttatttcttggcagacgccgtTAACCAGtgcgacttacaaaacaaactTATGAATTAACAGAAGATTATTTCTTGTGGGATATTTTTCTACACATGCTGCACGAAGCACTTTCAATGTAATCAATCGCTTTACATTTGCAAGTGAAATTTGGTTGTGAATGCACTGAAGGATGTTTGACCTAGCCATTTCACATTACACTGTTTTACCAACTAAGGAATTGATGCAAAGTACTGCAAAAATCTATGATTCAGTAAAGTTTGATTATGTTAAAACATTtctcacacacatttcaattacCGCTTTCCATGTGATAGGCATGTCAAATGCGTagtgtttgttaatgttttatatttttctatgtaaTAAACTGATATTTGGACACGAACGTTTTCTACGCGCGCTGACAAAACAGCACTCACATCGCCTGCGCAGCGGCGGGACAGagccagcagcagcacagccgTCACAACCCGAGGTGCAGTGAGTGAGGCGCGGCCTCCCAGGCCGAggcgccgccgccgccgctgtCCATCTGTCCGCAGCCCCGGAGTCAACACATCAGTCCCGCTCCTCATATCAGCTGGGCAGggcttttaaacttttaaataataaaaccaaacgAACAAATAATACTACTGATAATCACGGTTTACATAGAAGTCCTGTTTATGTGTAAGTTATTAAAGTGTTTCCGAATTAATGAGATCGATATGTAAGCCTTATGTTGGATATATACTCTTTGCACAATACAACAATGCTCTATCGACTCTCTCTAATGGCATCCGACTGCGTGTAACGTCAGCGGCGCACAGTACCAGCGCGCACTCATCACACCCGACTCTGGACAGGCGATTCCTCAGTCATGTGACTCCGTTCGAGACAGGCGTTTATTCTTAGTGTGGTGTcgtgtgttttttcattggtAAACGGCGCTATATCATATGCAGTGGTATATAGAGGCACAGGTGATGAAGCCATTCAAGTTTAAGTTACTTattgtgagggagagagagcgccAAGACAACCCCTGTTGTTTGTCACATGATAAACCCAAACCCACCTCTTTGACGCAGTGTGCGGGGATGAGTTTtagctgtgtatgtgtgtgtattttcgATGTGTGTTTATACCCTGTGTGGGTGCGAATGCGcacaattgtgtgtttttatatgcatttaggaaacttaaaaaagcaatacaaacaaatcaataaaaaaagaccCAGGAACGGTTACACAAGAGAACTTTTAATAGTAAATAGAACAGTTGAGAAATGGGACTGCAAAGCAAACAATACTGATTCCTTTAGTTTTCCCTGTGGATATGAATAGCTGATGGGGATTTCTAGGTATTGCAAGGTGNNNNNNNNNNgggggggggggggggggggggggggggggggggcagactCTGCATTGAAGCAAAGCAAAAGAACAGACCAACCAATTAAAAAGCTATACTAGTGTTCAGCTGCAGATTTCAGTGGTGATGAGATATCTGTGTGACCCCATCAAATAACAGCAGTGTGAAGAGGTTAGCATTTTTGTCCACTGCAGGTAAGTTGAAGATTACAGAGCTATTGgtaagtgtgtgagagagcatgCTTGTGTGAGTAccagtgtgtgtacatattCTATGGTCGTGTGTGGTCCTGGGTGCATGTGGACACACAAAGAACATAAAGACTAATTTAAACAGTACTCAAGGTTCTAAGGATTTTAAGCAGCACTCTAGCACCAGACCCCAGTGACTTGTGTACCAAGTGTAAGTATGTGCACTCTTCCTGTGTAAAACAGTCTAACGTTCAGGACAGTGTTTTCACTGCAATCTGGAGATAGATATTACTATGCTTTTATATAGGCGAAGGTCTGTGACTGATAGATATTAGAGTCAGTCTGCAAATGTTGTGCTTccaaaggaagagaaaaatacCCAACCTCTGTACTCAGTGCTGAACCCTGGCAGACCCCTTATTTGATATGGATGGACACAAGCTGGACTTCGCCTTCCAGCTGCATGTACAGGAACTGGTCGTCTCCCAGGCGATTGGGGAAGTGGATCACAGAGCCGTCAGAGAGCTTCACCTCGAATGAGTCGTTGTTGTGGGTGATGTAGACCTGAACTCCTCCCCCTGCTGGAAGGGAAATGAAGACTCTCTCTGCTCGCTGCCCCAGGCCCCGCCCTGCCGAGAGTTCATTACGATGGTGCGCAAGTCACCGTGGGCGTCGAAGCGGGGGTTAAAGTGCAGAGCCACATCATTCTCTGAGTGACCCAAGTTGATGGCAAACCACTGCAGCCTGATTTGGGTTTCCCCTTCACCTTCAGGGTCTGCCCTGCTCTGAAGGCCAGGTTTTGCACCTTAACATC
>TU92596
CTCCCTGTAGGACCCTCACCTTGAACTCCTTCCCCGGCTGGAAGGGGAAGTTGGTCTCACGCTGTTCCTGACCCCAGCTCCACTTCTGCCTTGAGTTGAGCACAATGTGACTCCCTGAGAATCGAGGGTTGAAGTGCAGTGCCAAGTCTTCATCAGAGTGCCCAATCTCAATGGCAAAACCTGAAGGCACCTAGAGGGATATACCCTCTGATTGTCATGGTTTCTCCTTTCCTGAATGTCTGCCTTTGCTCAACATtctgcacacaaaaataaataaaactaaaatgtattattcagcaTCTCGGCTAACTTCACTGATCTGAATCTTGGTTCAGTTAGTGGAGACAgggatattaatttaatatgcaaaaatgtgcttttctatAGAAAACTGAAGACTCTGTGGACCTCTGGGACCGAgggcctgattaaatcaaaactttgacccacccactaatagaaaactatacAGAATTGtgctcagttgcggcttcatttttagtaagatgacactttcttctaatcagaaatgtaaccgctatgatgtacaggtttgtagtttgccgACTTTGTGAACACTGCTGTAGCTCAGAggtcagtacagtacagcagggatctccgtcaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacatcgttagcacataatatttatttcttggcagacgccgtTAACCAGtgcgacttacaaaacaaactTATGAATTAACAGAAGATTATTTCTTGTGGGATATTTTTCTACACATGCTGCACGAAGCACTTTCAATGTAATCAATCGCTTTACATTTGCAAGTGAAATTTGGTTGTGAATGCACTGAAGGATGTTTGACCTAGCCATTTCACATTACACTGTTTTACCAACTAAGGAATTGATGCAAAGTACTGCAAAAATCTATGATTCAGTAAAGTTTGATTATGTTAAAACATTtctcacacacatttcaattacCGCTTTCCATGTGATAGGCATGTCAAATGCGTagtgtttgttaatgttttatatttttctatgtaaTAAACTGATATTTGGACACGAACGTTTTCTACGCGCGCTGACAAAACAGCACTCACATCGCCTGCGCAGCGGCGGGACAGagccagcagcagcacagccgTCACAACCCGAGGTGCAGTGAGTGAGGCGCGGCCTCCCAGGCCGAggcgccgccgccgccgctgtCCATCTGTCCGCAGCCCCGGAGTCAACACATCAGTCCCGCTCCTCATATCAGCTGGGCAGggcttttaaacttttaaataataaaaccaaacgAACAAATAATACTACTGATAATCACGGTTTACATAGAAGTCCTGTTTATGTGTAAGTTATTAAAGTGTTTCCGAATTAATGAGATCGATATGTAAGCCTTATGTTGGATATATACTCTTTGCACAATACAACAATGCTCTATCGACTCTCTCTAATGGCATCCGACTGCGTGTAACGTCAGCGGCGCACAGTACCAGCGCGCACTCATCACACCCGACTCTGGACAGGCGATTCCTCAGTCATGTGACTCCGTTCGAGACAGGCGTTTATTCTTAGTGTGGTGTcgtgtgttttttcattggtAAACGGCGCTATATCATATGCAGTGGTATATAGAGGCACAGGTGATGAAGCCATTCAAGTTTAAGTTACTTattgtgagggagagagagcgccAAGACAACCCCTGTTGTTTGTCACATGATAAACCCAAACCCACCTCTTTGACGCAGTGTGCGGGGATGAGTTTtagctgtgtatgtgtgtgtattttcgATGTGTGTTTATACCCTGTGTGGGTGCGAATGCGcacaattgtgtgtttttatatgcatttaggaaacttaaaaaagcaatacaaacaaatcaataaaaaaagaccCAGGAACGGTTACACAAGAGAACTTTTAATAGTAAATAGAACAGTTGAGAAATGGGACTGCAAAGCAAACAATACTGATTCCTTTAGTTTTCCCTGTGGATATGAATAGCTGATGGGGATTTCTAGGTATTGCAAGGTGNNNNNNGGGTGAGGTGGGGTGGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU92593 True 3045 lncRNA 0.44 3 38640676 38644538
TU92594 False 3035 lncRNA 0.44 4 38640165 38644538
TU92596 False 2052 TUCP 0.42 3 38597368 38644538

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00014889 NA coding downstream 173527 38415402 ~ 38423841 (-)
AMCG00014888 cacng2,LOC103372897,LOC102214005,LOC101463732,LOC100710835,LOC108237679 coding downstream 194574 38363902 ~ 38402794 (-)
AMCG00014886 syngr1,syngr1a coding downstream 258005 38330131 ~ 38339363 (-)
AMCG00014885 NA coding downstream 280351 38303052 ~ 38317017 (-)
AMCG00014883 NA coding downstream 333884 38261530 ~ 38263484 (-)
AMCG00014895 NA coding upstream 31871 38676409 ~ 38688061 (-)
AMCG00014897 NA coding upstream 84451 38728989 ~ 38836352 (-)
AMCG00014902 NA coding upstream 494285 39138823 ~ 39176661 (-)
AMCG00014901 NA coding upstream 560509 39205047 ~ 39217098 (-)
AMCG00014903 NA coding upstream 618603 39263141 ~ 39270244 (-)
G74137 NA non-coding downstream 21400 38506192 ~ 38575968 (-)
G74128 NA non-coding downstream 108889 38488262 ~ 38488479 (-)
G74093 NA non-coding downstream 257152 38309085 ~ 38340216 (-)
G74052 NA non-coding downstream 313851 38281437 ~ 38283517 (-)
G74030 LOC106607450,LOC105029658,LOC103393291,LOC102224681,LOC103147375,LOC101072687 non-coding downstream 416770 38177974 ~ 38180598 (-)
G74167 NA non-coding upstream 4384 38648922 ~ 38649290 (-)
G74174 NA non-coding upstream 17600 38662138 ~ 38662455 (-)
G74206 NA non-coding upstream 78066 38722604 ~ 38750977 (-)
G74221 NA non-coding upstream 131166 38775704 ~ 38776755 (-)
G74223 NA non-coding upstream 143423 38787961 ~ 38788273 (-)
AMCG00014891 NA other downstream 104414 38488619 ~ 38492954 (-)
G74115 NA other downstream 164493 38432263 ~ 38432875 (-)
G74107 NA other downstream 184137 38412160 ~ 38413231 (-)
G74087 NA other downstream 247077 38343322 ~ 38350291 (-)
AMCG00014865 NA other downstream 732885 37802094 ~ 37864483 (-)
G74247 LOC100136012,LOC107575789 other upstream 253557 38898095 ~ 38920353 (-)
G74375 myh9,LOC100380669 other upstream 613524 39258062 ~ 39260360 (-)
AMCG00014906 NA other upstream 733637 39378175 ~ 39379153 (-)
AMCG00014914 ankrd54,LOC107563363,LOC107728844,LOC107559232,LOC107670919,LOC107719341 other upstream 945958 39590496 ~ 39591658 (-)
G74477 NA other upstream 993361 39637899 ~ 39638957 (-)

Expression


Co-expression Network