AMCG00016504


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00016504
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030122.1
NCBI id CM030122.1
chromosome length 54868152
location 23841062 ~ 23862739 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00016504
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>TU17307
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Function

GO:

id name namespace
GO:0016052 carbohydrate catabolic process biological_process
GO:0005829 cytosol cellular_component
GO:0004614 phosphoglucomutase activity molecular_function

KEGG:

id description
K11809 PGM2L1; glucose-1,6-bisphosphate synthase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00016504 True 7397 mRNA 0.44 17 23841062 23862739
TU17307 False 3160 lncRNA 0.46 1 23841062 23844221

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00016497 NA coding downstream 1755720 22077617 ~ 22085342 (-)
AMCG00016487 NA coding downstream 1820331 22017124 ~ 22020731 (-)
AMCG00016488 NA coding downstream 1888869 21949268 ~ 21952193 (-)
AMCG00016486 NA coding downstream 1919423 21910870 ~ 21921639 (-)
AMCG00016485 igsf11 coding downstream 2131373 21688811 ~ 21709689 (-)
AMCG00016512 NA coding upstream 30684 23893423 ~ 23902805 (-)
AMCG00016510 NA coding upstream 54204 23916943 ~ 23925716 (-)
AMCG00016514 NA coding upstream 65152 23927891 ~ 23931580 (-)
AMCG00016513 NA coding upstream 72164 23934903 ~ 23937234 (-)
AMCG00016511 NA coding upstream 82455 23945194 ~ 23951329 (-)
G13957 NA non-coding downstream 482248 23358371 ~ 23358814 (-)
G13956 NA non-coding downstream 483370 23357461 ~ 23357692 (-)
G13954 NA non-coding downstream 493350 23347440 ~ 23347712 (-)
G13952 NA non-coding downstream 493711 23347006 ~ 23347351 (-)
G13942 NA non-coding downstream 747226 23092287 ~ 23093836 (-)
G13990 NA non-coding upstream 18220 23880959 ~ 23882959 (-)
G14012 NA non-coding upstream 70270 23933009 ~ 23933843 (-)
G14013 NA non-coding upstream 71427 23934166 ~ 23934467 (-)
G14015 NA non-coding upstream 78579 23941318 ~ 23941538 (-)
G14016 NA non-coding upstream 79305 23942044 ~ 23943378 (-)
G13969 NA other downstream 140807 23699149 ~ 23700255 (-)
G13962 NA other downstream 385251 23455092 ~ 23455811 (-)
AMCG00016480 NA other downstream 3158038 20666142 ~ 20683024 (-)
AMCG00016479 NA other downstream 3204102 20616509 ~ 20636960 (-)
AMCG00016453 NA other downstream 3705515 20128908 ~ 20135547 (-)
AMCG00016505 NA other upstream 1842 23864581 ~ 23885258 (-)
AMCG00016531 NA other upstream 446517 24309256 ~ 24323458 (-)
AMCG00016538 smpx,LOC107721880,LOC107590224,LOC107663668,LOC107705278 other upstream 690953 24553692 ~ 24566956 (-)
G14305 NA other upstream 1018409 24881148 ~ 24882098 (-)
AMCG00016562 rnf6 other upstream 1145235 25007974 ~ 25015343 (-)

Expression


Co-expression Network