G11021 (LOC107718733,LOC107555187)


Basic Information

Item Value
gene id G11021
gene name LOC107718733,LOC107555187
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030122.1
NCBI id CM030122.1
chromosome length 54868152
location 6735610 ~ 6744358 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU13652
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Function

NR:

description
PREDICTED: glutamate receptor ionotropic, kainate 1-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU13652 True 6968 lncRNA 0.45 2 6735610 6744358

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00016078 NA coding upstream 34724 6690753 ~ 6700886 (+)
AMCG00016080 NA coding upstream 56573 6670306 ~ 6679037 (+)
AMCG00016077 NA coding upstream 248093 6372399 ~ 6487517 (+)
AMCG00016076 NA coding upstream 1626618 5048208 ~ 5108992 (+)
AMCG00016066 stoml3b,stoml3,LOC103043838,LOC107556874,LOC108444492,LOC107720596,LOC103140675 coding upstream 2159191 4570191 ~ 4576419 (+)
AMCG00016092 hunk,LOC106595522 coding downstream 249638 6993996 ~ 7008772 (+)
AMCG00016104 NA coding downstream 302762 7047120 ~ 7053548 (+)
AMCG00016098 NA coding downstream 357843 7102201 ~ 7110849 (+)
AMCG00016102 dchs1,LOC103363423,LOC105909256 coding downstream 442827 7187185 ~ 7190116 (+)
AMCG00016099 arfip2b,LOC103365243,LOC108276920,LOC107718740,LOC107555180 coding downstream 621938 7366296 ~ 7396259 (+)
G10939 NA non-coding upstream 893789 5841228 ~ 5841821 (+)
G10853 NA non-coding upstream 1823192 4907806 ~ 4912418 (+)
G10794 NA non-coding upstream 2147973 4586548 ~ 4587637 (+)
G10798 NA non-coding upstream 2150124 4585234 ~ 4585486 (+)
G10737 NA non-coding upstream 2357947 4376307 ~ 4377663 (+)
G11052 NA non-coding downstream 208255 6952613 ~ 6956605 (+)
G11067 NA non-coding downstream 245769 6990127 ~ 6990569 (+)
G11069 NA non-coding downstream 246291 6990649 ~ 6990900 (+)
G11098 cunh21orf59,c10h21orf59,LOC107577665,LOC107691672 non-coding downstream 309602 7053960 ~ 7055721 (+)
G11168 NA non-coding downstream 735248 7479606 ~ 7481030 (+)
G10981 cct8,LOC107693911 other upstream 70062 6664086 ~ 6665548 (+)
AMCG00016079 NA other upstream 73942 6641658 ~ 6661668 (+)
G10739 foxo1 other upstream 2307551 4427146 ~ 4428059 (+)
AMCG00016030 NA other upstream 3923379 2759347 ~ 2812231 (+)
G10371 LOC105010782,LOC106603266 other upstream 4247859 2485542 ~ 2487751 (+)
AMCG00016091 NA other downstream 277789 7022147 ~ 7024851 (+)
AMCG00016103 NA other downstream 525497 7269855 ~ 7302042 (+)
AMCG00016101 trim3b,LOC108423836,LOC103363426,LOC107701140,LOC107720632 other downstream 702092 7446450 ~ 7478586 (+)
AMCG00016136 NA other downstream 2323923 9068281 ~ 9089033 (+)
G11509 NA other downstream 2355062 9099420 ~ 9100036 (+)

Expression


Co-expression Network