G14793


Basic Information

Item Value
gene id G14793
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030122.1
NCBI id CM030122.1
chromosome length 54868152
location 26626707 ~ 26633192 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU18381
TTGTTGTActataatactttaataaaatgtaatacatttatgcAATTTTATATCTTTTAGAAGTGAAACAATTTTCATAGTGTTTTATAGTATATACACAATGAGATCAACACCACTGTTTGTTAATGCTGCCCAAGAGGGATGTGACCAGGAGCTGAAATCCCAATATCGCCATGTTGTCATACCGACGCACATCGTCAATACATGATCAGGACACGTTCGAAAACATCGGACACCCCTGCTGGCCAAGGCTTTTCAGCATACAGCATCTTTTCACAGAACTCGTTTTTTCAAACACTGGATGCATGAGCTTACTGTAGCAAAGGGAACGAAAGGCAAGCAAGAGTCTCTTCCAGAGAtgccaaaacacaacacaagctgACCGAGAAGCAGCAGAAATTAGgcaggtttcttttttctttttaagctaAAACATGATATTTAAGAGCAGATCGAGAACGAGTTCTATTGTATACTTGTCCATGTATTTACCTtcgtgcgtatgtgtgtgtgtgatgtatgtgtacttataatgcattttcagaGAACTTCCATACCCCCAGGCCACTGTGGGACCCCCCTACCCTCCAATGCTGCCCCCTTGTGGTGCCCTGTGGGGGCCTAACAGGTGAGtcgaaagaaaataaactgctgGAGGCCAGACTACATCCTCCACCATTCTGTTCTGTGGCTTCCCTTTTGTATGCAATCAGATGTTTCCTTCTTTCGacgcattgttttatttacttactgaCTGATTAattgcttgattgattgattgattaattttgccaaaaaaggaagaaaaacaatgcaagCAGTAATATGATTGAAATGCATTCATGGTGTAGCCAGTAAAGCAATCCTGATGCCCTCATTGATCACTCTTTACCACAGCCTTGGAGGCCACAGCTGAATTCTGGAACCCTTGTGCTTATAAACTTAATTCCAGACACCTCCTCCCTCCCATCTCCCAGCTAAGATTCTGACACCACAAACATTGGCACTCAAGTTCGACATACAGTCCAGGCGATGTCCACCATCAGTTTTTTGGTACACGATGCCCCGCAGGCTCTCAGACCCAGCAAACCAGGACCGGCCGTCAGTGAGCCAAGTCCTGTATGAGCACTGCGTTTCAGCTCGACTGCGCGTATAAACACGCCCATGCTATATCCTCTATCCTTTTGGCTTATCTCTTGTTTTGGTACAGGTTCAATATTAAAACAGTGTACCAACTGGTGAAGTAAATACACGCTGTGTTTTGGTACTAGTGCCACACTTCCACTATGTGCCCAACTGGGGCACACCAGCTTAGGTGCTTACTGGCCACTGAGCGTGGTCAGTgacatgtatttctttgtgtttattgtCGTTGTGTTTTCTGGTAACATTCAGCACAACAAGGACTCCTGCAATGATAAATGTACTTGTGATTGGTTCACATATTCAAGTCAAAGATTTAAGGATATATTCAAGTTATGCTTCTTTtgttgcccccctcccccatgttaaatatataaatccaccAATCTACGCTtatctgtatttgtaatttaacgacaccccaccccaaaaaaatTATCATATAAACTCAGTGTGAGTTTCGCACcagcagggagggggttaaggCCGCTCTTTGGCTTTAGACAGTGACTTTTGTGGGTCTTTTTTTgcgtgtttttaattttctctgcaCACAGATTTACAGTGGCTTCACACGGCACGGCACGACTGCTCACATCTCTCTCCCAGCTCCACTGACTATAgtatatatacaatactgtTGATATGTGGTGCCAAATCCTAATTAGAGCACTTAGTCTACAATGGAAACCCCTTGTCTCTTCAGCCCCTTGGTCCAATACATGCAGGAGTCAAAGCTACGAAGGGCAAACTGCAGCTTCTTCACTCCATAGGCAGTTTGCTTCATTCATTCGCTTCTGAAGCAAATCACAACTttgataaaaaaacacacacacacacacatatatatatatatatatatataaacatcactCTTTGTGTTTCCAAAGCAAGGATAAGCTACAATATCACAGTTATATATGGTGCTCCAATAATACAACAGCCATGAGTATACTATCATTTCCAATATAGGTTTTATACACCTTCCCTCTTTACTTTTGATGATGATGCTCTTAACGGCTATCCTGTCAATACAATTGAGAATTTGTCAATTAGGTTTATGCTTAAACCAAGATTcaagtttatttataataaaaaaaatatatcaattaaataaaagtaaaaagtgcATCTTGTGACCACAATGCTGAGAGAAGCAGTGGTGTCTAAAATCAGGCTTCTCTTTGACGTGTTCCTGACATTTCTCTTACATTGTCATTTATTGGGAttctcatgtttgttttaattgcaaagcACTTATAATCATTGGAGCTTGCCCCCTCCCCCAAATGGAGTTCAGATCAGTTCAGGTTAATCTGTGAGGAAATCTCTGGAGGCAGGGTAAGGGGGCAGTTGCTGGTGCTGCCCTCTGTTGGTTACATACAGCACTGCACCCAAACTCTGGTCTTATTTGTGCTTTTAACTGCCACAGCCAACGGGAAGCCAattcacagtattttaaaaaaatcacattgcTTCCTCTAAAGCGATTGCCTGTGCTTTTGGATGTTAATAAGTTGCCACTTGGTTTATAGCATTGGATATGACTTCAGTTGAATGTTGATGACACACAAAAGACCACACGTATTCATGTCACTAAAGTGTAGCTGGTTTTCCGTACGCTCATTCTATTGCATTAACACAGTATTTATATCTaaggaaagtgttttggatCACTACAAATCGCACTGCCCTTGATATAACTGTCCCCCACTCTGGGTCGCTCCACCGGTCTCTTCTATAAAGGTTTCTAGGGAATCGGACGTTTAAAACCATTTTCGATGACACACAATTCAACGTCCATCATAGCTCCCCACCTGCTTCAATGTGCAAATTAcagaaaggaataaaaaacGGTGCAAATAAGTAAAAAACTAATAGCAACAAAGTACACAGCCAGccaggtgtgtgtgagagatgcatgcacacacatgtgtGTGGTGCTTGTGCATAGAacgtatgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagagacacaggtAACCAATGGACAGTGTTGCTGCTTACTCTGAAAGCTCTGGGGAATCAGCTTGCAGGTCCTGCAGGTTGGTCGTAGCAGCCATGCTTCTAAGTAAAACGTTGAACTTAGTAGCTGCCAAAATCATCCATTCTTGTAGGAGATGCTGACCTTGACTACGCTGGCATTCAGATCTGAGCAGCAAGACTAAACAGGAAATGTTCTAACTGATACGAGCTGAGAAAAGCAGCTCaagagtgggtgggggggtggaatgTAGCCCataacagaaataatacaaattcctttacttaattttttttccattttgtttgttttttcagtgtttctgtCATTTTCTCCTTTCACATCCTGGTGGCGATCAAACCGTTTATGAACATGtccaagaaagaagaaaaaaggacagTTCATAGTTATCATGAATTTCCAGGGTACGCCTCAGCTTTTGGAACAGCTCAAACTGCGCTGATCAAGATCAGTTTCCGGAggtggtgtgtgggggggggttgtgtagAGAGGGGGgacggcacacacacacacacacacacacacacacccagcttGACTGTAAGGAGGAAAGGATCCAGCTCGGTTCAGGGGCTGTTCTCCCGTCTGCCTGTTTCAGAAATTACTGGCAGATCCACAGGCCTGTACAGAAGGCACCCCCTTCATGGGCCCTTACTGTCCGCTGTCCGAATGTTGTGTTTGACACATATCTGTAGaacattaaactgtaaaatatgtattttatttatttatgggttctttttacataaataatttcattttactCCATGAATGAAACGTTGCCAGTGCAGATTGAGATTAATGGCCTCTGAATACACATGAAGAGAAAGCTGTTGCTTTAACCCAGCTCCTAAACCAGACCTATATTGGCACTCTGTGATTCATTTCTTTCCCTCAGAATATGAAGCTGAAGCTGCACTACGGACAATACGCAGCCTCTAGCAACCGAACAGGGAGAGACACACTGGGATCTGTGTTTCTCCCCTTTCGTTTCAAGACCTGCCAACGCCGTTCTGAGCACCGAGCTCGAAACAGAATAGCACCAGTATCAATATCATGCAGCACAGTGAACCAGAAAAAAAAGCCCCCAAAAAGTttagaaacaaagacagaaagaaaaaataaagtctaCTTGAGAACAGAAGCAGTTTCCTAGCCCCTTGGCTTCTGCTGTAGTAATAAGATTAGCCCTATCAGCATTGAGCAGTGTTCCCAGCTCAGAGGAGAAAAGCGATTATACAGAGAGCCCCTCGAGTGCGAATAAGAGAGCGGAGAGCCAGCGAGCGGGGGTGCGAGAGGCAGAGATAAAGCCCATCTGCTCTGGGATTTGTCTCCTCTGAAGTGGAGTTTCTGCCTTCAAAGTATAATCAGTTTTTGCTTCCAAGTGCACTGGAAATCTGCAGCTTATGATCCTtggcaattaaatacatattcctCTCACAAGACACTAGCAGTGCTCAGACTGCGGCTGAAGAGCTGAACACTGCGGTGATGTGAGCAGGATTGATTTAAAGCatatacaaaaatctaaatattaataacaacaacaataataataataataataataataataataaaaaatagcttAAACATAAGAGAGGATGTGCAAATAAACTCAAGTCAACAAGCCGCCAAGGACACTTCTTGGTGACATTTAccaattaaatcatttaatcTTGAAATATCACTCTGTCTTTGAACTTCATTAACACAACTACCAAGCCTTATGATTTGGaataggatttaaaaaataaaaaagtgaaagaatTGCATTGCTGTGTTTTGGTAAAATTCACACTGATCTGCTTTACAAAGCAATT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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU18381 True 6435 lncRNA 0.42 3 26626707 26633192

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00016646 NA coding upstream 43041 26583454 ~ 26583666 (+)
AMCG00016637 NA coding upstream 54350 26559807 ~ 26572357 (+)
AMCG00016639 NA coding upstream 105100 26517843 ~ 26521607 (+)
AMCG00016641 NA coding upstream 112420 26509041 ~ 26514287 (+)
AMCG00016632 NA coding upstream 158705 26462323 ~ 26468002 (+)
AMCG00016636 NA coding downstream 32253 26665445 ~ 26667680 (+)
AMCG00016647 NA coding downstream 50450 26683642 ~ 26700201 (+)
AMCG00016650 NA coding downstream 224526 26857718 ~ 26869181 (+)
AMCG00016654 NA coding downstream 260087 26893279 ~ 26897534 (+)
AMCG00016655 NA coding downstream 278776 26911968 ~ 26918768 (+)
G14781 NA non-coding upstream 180945 26442152 ~ 26445762 (+)
G14768 NA non-coding upstream 228780 26397649 ~ 26397927 (+)
G14755 NA non-coding upstream 244287 26380051 ~ 26382420 (+)
G14703 NA non-coding upstream 322365 26234326 ~ 26304342 (+)
G14800 NA non-coding downstream 71805 26704997 ~ 26705204 (+)
G14802 NA non-coding downstream 79039 26712231 ~ 26713129 (+)
G14803 NA non-coding downstream 82377 26715569 ~ 26715801 (+)
G14992 NA non-coding downstream 629698 27262890 ~ 27274297 (+)
G15005 hoxb7a,hxb7a,hoxb7,hoxb7ab non-coding downstream 648232 27281424 ~ 27282569 (+)
AMCG00016638 krt222 other upstream 78495 26527319 ~ 26548212 (+)
AMCG00016640 NA other upstream 127465 26489938 ~ 26499242 (+)
AMCG00016633 NA other upstream 193051 26427339 ~ 26433656 (+)
AMCG00016625 mllt10,LOC106942732 other upstream 324193 26285802 ~ 26302514 (+)
AMCG00016607 NA other upstream 676531 25940528 ~ 25950176 (+)
AMCG00016663 NA other downstream 333105 26966297 ~ 26993948 (+)
AMCG00016683 NA other downstream 909294 27542486 ~ 27553120 (+)
AMCG00016691 NA other downstream 955287 27588479 ~ 27604879 (+)
AMCG00016690 NA other downstream 979913 27613105 ~ 27626090 (+)
AMCG00016699 LOC106607176 other downstream 1144235 27777427 ~ 27799126 (+)

Expression


Co-expression Network