G17193


Basic Information

Item Value
gene id G17193
gene name NA
gene type unknown
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030122.1
NCBI id CM030122.1
chromosome length 54868152
location 38496051 ~ 38503632 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU21320
tggcaaccctgcGCTTCTCTCATGAACAGAGatcacagagcagagaacagtAACAGAGACCGCTGACCAATAGCTGCACTTCAGGTTCAGAGGTCGAAGGTTAGAGTTCGGTAAAGCATGATCATGGCCACGTCCCAAATCGTACCCTTgctcctacacccttcgacaagtgtacacttcgCGTGacgtgctgacgtcacagagtgtgcacttgagtgaggtgATGGGTGCCAAAACGTTTTgtggctgaactttctaatcatatatttaaatcatgattatataacaattttatattacactggacaacaaatattttgcttCTTGGACAGCTTTGGGTGTATCTTATAGATTGTTGGCTGCTGATCACAAAAATCAGCTTTAAATTAACCTGTCACgtaccattttatttaaatcttctATTTTTGCAATTTCTTGTCATATTTTAAGTCTATTACATTGATAtcagtttgtatgtattttaatgtgattgTTTCAAGGCATAGCATTGTCTAATGTAAGCTACGTAACATGTAAGCCAGTTATAGACTTAGGACGATTGCTGACATCTAAAATGTCTCGCTAATGCCGCAACAGCCGTGATACGTTCTACTACATTTGTGGTGAGTACATGCTTAAGCCTCAAAGATGCACCATGACTGGACTTGTTAAGAAAGCATATGAGCTGTACTTTGGTTTGAAAGATTGGGCTCCTCACATTTGTTGTGTAAGATGTGCTGTCGATCTTAGAGCTTGGCTCAGAGGAACTCGGAAGGCAATGCTGTTTGCTGTCCCGATGATATGGCGAGCACAGAAGGATCACATGACAGACTGTTACTTCTGTCTGACTAATGTCTCCAGCTTCTCtgctaaaaataagaaatcaactTATGCAAAACAGATGAAGATGCTGCAATGCACCAGCTGGGCACGGACAGTGACATTGATCTGGATTTTTAACCATGCATGTCTGGTGAACCTCATCTAATAACACTGTCAGAATTAAACGACCTGGTCAGGGACTTGGGTTTGGCGAAAGCAAAAGCAGAACTACTGGGTTCAAGACTGCAAGGATGGTGTTTGCTGTCAACAGCTTGTTCAATAGTGCCTTGTTTCGAGGTCAAGGGTGAGAGCCCATCTGCGCAGGAGCAAGTCACTCCGGGCTTGCTTTTTACAGGTGGGCCTGCACTGAGTGGAAATCAGCGCACACGAAAAGAGGAAACAGAGCATCAAGGACTTTCAGGGGAGATGCTAACACAAGTAATTGTGCAGTTGGGACAGCAAATTGGGGAATCTGTTGTTTCTCAGTTAGTTAATAATCAGACACGTCATCAATGACAAGCGGTTCGAAGATCTGTTAGTGGGGCCAGAGAAAATCACCTGGAAAGCATTCAAGGATGTTGTTGAGAATTTCCTTGGCAACTACAGAGCACCAAACTACATTTAAGCTGATTGACAAACTTCTTACAGCATACAAAACCATGGAGTACAACATGTCACTGAAGATTCATTTCCTGCATTCACACTTAGACTTCTTCCCCACAAATCATGGTGCAGTCAGCGAATAACATGGTGAAATGTTTCACCAGGACATTGCCACAATGGAAAAACGGTATCGGGGCAACTGGAATCCATCAATGCTGGCTGACTATTGTTGGACACTGCAACGCGATGGACCGGACACTGAGTACAAACGAAAATTGGGAGCAAAACACTTTTAGCCCTGTTGAACTTATGCAGCGTGTCAGAAACATTATGTGATTAAACACGTTATAGTcaattaaacttaatttcatGTTTCTGAAAATTCTTACCTGATACAGTCAatctgaaattatatttgtgttcactTTGAAGGGGTCTATCATAAtcagcaatttatttttcaggaagcaaatcttttgaaaaaatgtgttgtccagtgttatctatctatgtattttaatttccttgatgcataatttaacaatttctacaactgtctagctagcattacattacatttttatgcacCCGCCGTTGCAATATTTTCCCAattgacttgtctccgcctttaatgcaaagagttctgggacttcagcactAAAACACTTCTGCATAAGtgtgctcttttgtacactccgCTGAtgggagcattgaagggcacaaaaagctcgattaggctcccttcactcgctccctgagggattgggacaccccttaagatggccactgTAGAAAACTGCCCCACCAGGGAAGGGAACAAGGGCCAAGTGTGTGATTTGAGATGCAGCCCATGTATTTACAATAGCTTAAGAGCGTGCATTTGCAAAGAGGGGTGCTGTTTCTCTCATTTCCAAATTGCATTATCAATTGAATAAAGTCCATCTTGAAGCGGGGTTGATCGTGCATTTGTAATAGTAGTCTTTGTCCATACATTTACAATAGCAtttgacatttgcatttccattttgtgcAGAAAACTGCATAAGAGCTAGGACATTTATTTGCAAAGAGGGGTGCAGTTTTTTGATTTTCACTAATACAttatcatttgaataaagtccaccaTACAGCAGGGgaaggttttaaaaatgcaattgcaattggcttttacattaattaacattttaatattgtctgtgaatgtgtgtactAGTATATGAAAGTGCAATTTTCTCCCAAATAATGCTTGCATAAATGCAATGGATGTTCCACTTAGCATTACCATTTGAATTAAGTCCTCTATGTCAggggtcccccccccccatcacgGCAGAGAAAATAACGTCAAACTGATTCATCACAAGTTCAgtgtacattttgcttttatttaacatGTAGGTGTGTACATTTATACATCTGTAAATAATTGGCCAATGATTATTTAAGTACAGCAagctaaatgtatatttcatgttgttaacttaatatttgttttcctgcaatTGATTACTTAAGTCTTGTGTTGTTTGTCTCTGGCATGTACTTGAATACCTTACAGTAATGTGTTGTGCAGGCTATATAAAGCTTTAACCAACACTATTTAGGACTGGATGcatgtgtttaatgtgtttatgtaaaatGACACATTCAATATTCATACATAACATTCATAATGCTGAAACTCTGAAATAAAATGCCTTTTGcctcatttaaaatgatattcatATTtggtaaatatatgtaaacagaATCAAAACCTCACCCAAGAAACCTATAACCATTAGttcccaattaaaaaaaaaatatattaaaaaataataataatgggaggCTGGTGGTAGTAAAACCACAGTTTGGTTGAGGTGGTTTCTGTGAGCTTTGACTCAAAGTTTGGCATAAAGGGGTTACTAATCCGCTGAAGCTGCCTGTTCTTCAATGAGTTCAGGAAAATAACTTGAATTTCTGCCATCCCTGACAGGTGCATAGTCACCTGTTGTCTGACGGTATTGAAGTGCAGGTTCCTCTCTCCAATTAATGCATGCACCTGTTCAAGCATATCTGTGATTCCTGATGAGGCACAAGTTTTCCATAgttgtagttttcttttgaaTGCCTCAACTCTTTCGTGCTGTGtggtgttgtttgtgttgcacCCTGCATTGCTTTGTTGCTTGCTGCTTTCAGTGAATATGTCTGCAAGATAGCTGCAAGAGTTGAGCAAGAACTTGGCAGGATTTTATCTGACAAGAAGTTTTTCAGCTCCTCTCTTAAGCTAAACGTGTGTCAGCATCCGTCTGTGGGATAACCATCTTAGCACTGGGTACAGGAGCAAGGAGTGGTTTTCAGCGCCCACCTCTTCACAAAGGGCAGTGAATAATCTTGAGTTTGTTGCTCGTGCTTTGACAATGTTCACCGCAGTATCCAAAATGCGATGAAGCTTGAAAACAGTGTGTTGAAACTGCTCAACAACTTTAATTCTCTGAAACACTCTGGAGTGCCTGCCAGTCATCCCCGATGCTCCATCTGTGCACAACCCAATGCAgctgtttcatttgatttagTTTGATCTTATAAAATCATACAATGCCTCAAAAACTTCCTTTGGTGTCATAGTTGTCCTCAGctctttacaaaaacaaaaatcttccCTAATCTCCCTCTCCCATTCATAACTAACGTATGAgagtaaatataaaacaaaaacaattggagacaaaaataaataaataatggatttttttgaCTCATCAAagtagccaccttttgcagataACAGccattctttctacaatggaaatcaaatattgttcagaaagttcttcccaacgctgttgcagaagttcccacaaatgtgttgcacttgtaggttgaTTTGCTTTCACCGTTCTCTCCAGTTGATCCTAAACCAGCTCGATGGGGTTTAAGTCTGGAGACTGTGCTGGCCATTCCATGATTAGAATActgtcttgttcttttcttctaaggtacattatttttcagtttttggtaacatacttttttttttttttaacctctggcagtataacgcttacctttgtaccatttcaggttaccatttcactggacttgaactgcttacatttaaatgaaaactggaaaattgggggtgttctaaaacttgtGAGCGGTAGTGTAGGCCAGGACTGAAACCCCCTACAGTGAGATCAGGACAGAGGAGATGCATTTACAGTATACCTCACAGCTGCCTTAAATAGCTTGATGCTtttgattttcagtttctttaaattatatatatattccatttcTCTGTTGCCTACATGAATTTTCcttgtatgcatgtgtgttgttttttgaaaacattatttaaaaaatctgtccAGGGTTGTTAGTGATTTGGATACAACCATGACAAATTAATAAGAGGATATTCAGTGGCAATATATTAGTTTGTCAAGGGTATACACATTTCAGGAATGTAAAATATACTGcaagtaaaaaactaaaacaattctACCCCATTCATTTGTGATTCGtgtg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU21320 True 4944 TUCP 0.39 4 38496051 38503632

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00016973 NA coding upstream 4007 38479332 ~ 38492044 (+)
AMCG00016974 podxl2 coding upstream 24160 38468150 ~ 38471891 (+)
AMCG00016975 NA coding upstream 41387 38448608 ~ 38454664 (+)
AMCG00016972 mcm2,LOC106583719 coding upstream 80847 38400730 ~ 38415204 (+)
AMCG00016970 NA coding upstream 96764 38395699 ~ 38399287 (+)
AMCG00016971 lsm3,LOC107562728,LOC107676354,LOC100705055 coding downstream 9588 38513220 ~ 38524777 (+)
AMCG00016976 slc6a6,LOC106566182,LOC105006920 coding downstream 282718 38786350 ~ 38800821 (+)
AMCG00016981 NA coding downstream 767641 39271273 ~ 39294718 (+)
AMCG00016980 NA coding downstream 801648 39305280 ~ 39323121 (+)
AMCG00016983 NA coding downstream 871628 39375260 ~ 39396596 (+)
G17165 NA non-coding upstream 103979 38391677 ~ 38392072 (+)
G17089 NA non-coding upstream 360211 38135173 ~ 38135840 (+)
G17073 NA non-coding upstream 378796 38089801 ~ 38117255 (+)
G17064 NA non-coding upstream 403372 38062034 ~ 38092679 (+)
G17044 NA non-coding upstream 509394 37948232 ~ 37986657 (+)
G17214 NA non-coding downstream 32429 38536061 ~ 38536333 (+)
G17221 NA non-coding downstream 121894 38625526 ~ 38626023 (+)
G17230 NA non-coding downstream 250889 38754521 ~ 38805946 (+)
G17274 NA non-coding downstream 575783 39079415 ~ 39079897 (+)
G17361 NA non-coding downstream 1286457 39790089 ~ 39790567 (+)
AMCG00016934 acly,aclya,LOC103369716,LOC108273769 other upstream 3291819 35158597 ~ 35204232 (+)
G16550 NA other upstream 4395188 34100315 ~ 34100863 (+)
AMCG00016909 mien1,LOC107566883,LOC107755209 other upstream 4396455 34093276 ~ 34099596 (+)
G16546 NA other upstream 4448331 34047371 ~ 34047720 (+)
AMCG00016901 NA other upstream 4821690 33668593 ~ 33674361 (+)
AMCG00016979 NA other downstream 735441 39239073 ~ 39254490 (+)
G17697 NA other downstream 3887665 42391297 ~ 42397787 (+)
AMCG00017078 LOC106565757 other downstream 5622582 44126214 ~ 44137931 (+)
G18192 NA other downstream 6151020 44654652 ~ 44656098 (+)
AMCG00017099 cav3,LOC107673475,LOC107749619,LOC107584510,LOC107577493 other downstream 6445402 44949034 ~ 44961601 (+)

Expression


Co-expression Network