G18186


Basic Information

Item Value
gene id G18186
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030122.1
NCBI id CM030122.1
chromosome length 54868152
location 44623367 ~ 44714164 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU22536
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>TU22537
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU22536 False 3151 lncRNA 0.37 2 44623367 44667457
TU22537 True 4470 lncRNA 0.35 2 44662389 44714164

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00017084 NA coding upstream 145577 44468119 ~ 44477790 (+)
AMCG00017083 NA coding upstream 169873 44445621 ~ 44453494 (+)
AMCG00017082 NA coding upstream 212028 44388912 ~ 44411339 (+)
AMCG00017081 NA coding upstream 237381 44372888 ~ 44385986 (+)
AMCG00017080 camkv,LOC106582757 coding upstream 251859 44364606 ~ 44371508 (+)
AMCG00017096 NA coding downstream 1227 44715391 ~ 44739801 (+)
AMCG00017102 grm2,LOC106565576 coding downstream 153750 44867914 ~ 44876540 (+)
AMCG00017097 grm2,LOC105017167,LOC106565576,LOC106583186 coding downstream 167701 44881865 ~ 44891870 (+)
AMCG00017098 NA coding downstream 188302 44902466 ~ 44923634 (+)
AMCG00017103 NA coding downstream 218892 44933056 ~ 44934249 (+)
G18127 NA non-coding upstream 235418 44387443 ~ 44387949 (+)
G18125 NA non-coding upstream 246139 44376993 ~ 44377228 (+)
G18084 NA non-coding upstream 422329 44116966 ~ 44201038 (+)
G18077 NA non-coding upstream 519968 44102026 ~ 44103399 (+)
G17987 LOC107575789 non-coding upstream 1122891 43500170 ~ 43500476 (+)
G18255 NA non-coding downstream 271632 44985796 ~ 44986081 (+)
G18302 NA non-coding downstream 529320 45243484 ~ 45243983 (+)
G18316 NA non-coding downstream 812580 45526744 ~ 45527005 (+)
G18330 NA non-coding downstream 1068033 45782197 ~ 45782467 (+)
G18357 NA non-coding downstream 1305177 46019341 ~ 46021345 (+)
AMCG00017078 LOC106565757 other upstream 485436 44126214 ~ 44137931 (+)
G17697 NA other upstream 2225580 42391297 ~ 42397787 (+)
AMCG00016979 NA other upstream 5368877 39239073 ~ 39254490 (+)
G17193 NA other upstream 6119735 38496051 ~ 38503632 (+)
AMCG00016934 acly,aclya,LOC103369716,LOC108273769 other upstream 9419135 35158597 ~ 35204232 (+)
AMCG00017099 cav3,LOC107673475,LOC107749619,LOC107584510,LOC107577493 other downstream 234870 44949034 ~ 44961601 (+)
AMCG00017167 NA other downstream 4657858 49372022 ~ 49382218 (+)
AMCG00017173 NA other downstream 4688367 49402531 ~ 49403845 (+)
AMCG00017183 NA other downstream 4999303 49713467 ~ 49727567 (+)
G19113 NA other downstream 5837716 50551880 ~ 50552985 (+)

Expression


Co-expression Network