AMCG00017665


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00017665
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030131.1
NCBI id CM030131.1
chromosome length 33043351
location 17468605 ~ 17487497 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00017665
GTCGCAGCTCTTCTTGTGTGTTATGAGCTATTATTGTTCATGGATTTTTATTTACGTTTATTTATTGAGACTGGCTTAATTGGAGTTTTTATTGCACTTGTGTTTCTGAGGAGGTTGCAAAGATGGAAAATGACACAACACCCCAATAATGCATGGAATTGCTGTTGGGTTGCGTTATTTTTGATCTTGAATGGTTTTCCCCCTACATGTGAGAATACTGTGGCGAAAAATGTACtcttgaacaaaaaaaaagcgcTAGCGTTCATAATAGTACAACGTCTTAGAAATGCTGGGACGGCATTTTTGTCCTAAAATGCATGCCATACTcctaaaaaccaaaaaaaaaccctgaGGGGGAGAACCTATTACaaagaaaatgactgaaatcatgtgacaagATGCAAAAGCTGCAGGGGTGAATCTGAAGTCAGTGTAAAGCACAGAGCATTCCCAAATCCGAGACGCTGAAGAAAACCAGTTCAGGTCGCAAAGAGGAAGGATATCTTTGGAAAACGCGACTTGCTAGTGCATTCCATCCTTAAGTGACACAGGAGGCTAAATAAAGCAGCAGGGACGTGTGTTTTTCTGGTCTTTTGCCATGGCGGAACATCTCTCTCAGAGTGAGCTGGATTACCCCTTCAAACTGTTGGAGTATTTTAATGGCTTCAGAGTCTCAAAgGTGATCTTCTCTGCCTGTGAGCTGGGTGTCTTTGACCTCCTGCTTCAGTCCCAGAAACCCCTCAGTGCGGAGTGTGTATCTCAGGAGCTGCACACCAGTCTGGATGGCATGGAGCGACTCCTGGATGCACTGGTGGGAATAGAGATAGTGGATGTAGAAAAAACGGACGGAAAAGCATTGTACAGCAGCACCGATGTGGCCAACCTTTATTTGGCCAAAGCCAGTCCCAAGTCCCTGTTTGACATGATTATCTATCAGTCAAAGACTATCTACCCACTGTGGGGTAACATGGCTGATGCTGTTAGGGAAGGGAAAAACCAATATGAGAAAACCTTTGGACATTCATCAGATGAGCTCTTTGAAGCTGTATACAGATCTGAAGATGAAATGCAGAAGTTCATGGGACTGATGAACTCAACTTGGGTCATTGATGGGCATGATGTTGTGACTGCATTTGACCTTTCACCTTTCAAAACAGTAGTTGACCTTGGAGgctgcACGGGAGCTCTGGCACGTGAGGTATCCAAGGCCTACCCAGACTCCTCTGTCACTGTGTTTGATTTGCCGAAGGTGGTGGAGATGGCCAAGAAACATTATTTAGAAGCCGATGACACCATTAGTTTTCAGGAAGGTGACTTCTTCAGCAGCGAGATTCCAGCAGCCGATGTTTACATTCTCGCCCGGATTATTCATGACTGGAAGGAGGAGAGGTGCGTTCAGCTGCTGAAGAGGCTCCACTCACTGTGCCAGCCAGGTGGTGGTGTCCTGATCGTGGAGGCCCTCCTTTTTGAGAACAAGAGAGGCCCAGTCATGGCTCAGATCTTCTCCCTCAACATGCTCGTCCAGACGGAGGGCAAGGAGCGCACCCCCTCCGAGTATTTCCGGATGCTCTCTGCCGCGGGATTCAAGGATACCCAAGTCCGGAGAACGGGAAAGTCTTACGATGCAATTCTGGGAGTTAAATAAGCACCAGGTAGAACACAGGCCACAGCCATCCTGTGAAATCGTCCCGTAAGTGTGCATGCCTCGTGCTCTGTATTTATCGTAATGAGTTTGTTattagacacagacacagaagcaAAAAGCGTTTGAGACCACAAAATAAGATGGTTAATCCCGCCTGATAAATGTTTGCACTAGATCATGACaatcacaaaaaatatgtacaagACCTTTTAAAGGGTTAATCcacactgtaataaaaatgaaaatgtaaactcTTCCACCTTGCTGCTCTAAATGTATTTAGtcattgtatatgtttttgctCCAGAACATCTGCATAATGGCAACACTGTCAATCTCCCAAATCAGAATTCTCAGCGCCAGCCTTAGCCAGGAAAGATGACTTCTGTGTGTTGGCTTTGAATGTACCAGTGCATGCCCAATGTGGCATCGGGAAGCTCCTTGAACTCTGTAAATCCTCACTTGTCTGTGTGGGAGGTATCATGGTGGGGGCAAAATATATCTGCTGAATTCTTGTGCCCCCATATGGTTATGTGTGAGTTTGTAGATATCAATGCAGTTTATATGAAGCTTGAGTTGTTAATTGCTTAGAAAACAATTTCTCATCACCTTCAGTTCACACCTCCACTGTAGCTATAGCACTGAAATATGTTTGTCACACAGACAAATGCATTTGTATGTAGAGTTTAAGAGGCTTACATTCACTGTTACATGTGAACTTGAGGaacatgatttttttcttttttcttttctggctAAGAAGAGTACATGGAGAAGTCAGATTTGGTACATTGACAGTGTgaaaaatgtgacaaaatgcatttgaaccCGCAAGGTGGGATGGTTTATTCTTGCCTTTTGTCTCTCTGTAGAGTTGCACTAACCCACACTACTGTTTTTCTCATTGTACAAAACTAACTGACCCAGCTGGTCAGGATTTTTTTTGCTTCTGCCCTTATCTGTGATCTTACCCTGATGAACACAGGGGAAACACTGTTGACCAGCTTTTCTGGCTGTTGAGCGCGATAATTTGACACCCACTTGACAatctgctgtgctgtttttggCACATCGTATTCCGAAGTGTGttctacatttatataatcCTGCACTTGGTCCCTACACTGCAAACCTGGGACTTCCTTGCActtaatgcatgtttttaaaacaaacaaaaaaacaaaaagtaatttagACCTCTGATAAAATACCTGTTAATTTAccacttctactactaatatGAAATGTTGAGGaatatataaatgaacacaACATAACCATGAAAACCAAATAGACTGACTTATGCACAGTAAGGTTCAGGTGTTTTTAGGGTCTGGTGACATACGTCAGCTGCTCTGAAGCTGCTTGAAACGTTGATTGCAAGTTAGGTAGGCCTGAAAGGTCCTGGCTGTAAATATCTGCTGCTGTTTCAGCCTGTGCTTTCACTGTTTTTAGTTTCCATCTTACTGACCCTTTACTCTTTAAATCAGACTTACCACTCAGCTAAACTGAGGAGATAAATCACACCTTTTAAagagtttttaatgttattatgaagaataattgtatttatttttggcttcAATTGGATAGTATGCTgccaaacacacaaagacattgCTATGGTTAGCAGAATTGCTTGGCAAACCGCTATCCCCTACCATCCTTTGATTCAAATGCACAAAGCGTTGAAAGAACAAAAGGTCCAACAGAAATCACTCCATTGACCACAGTGCAAATCGAGGGGTTTACTATAAGTGTCCATAGTTTTTGTTATCTAGTCAGTTACTATTTTACCGGATTAACCTAATCAGTAGAGATTGCCATGGTTGTGCACAAGATCAGCTCCCAGGTTCAGGAACAACGAAGCACTCTATTACAGCCGAGTTAGATCCAGACTAGTGAAATGGTTTTGAAGAAGCATATTGCCTTCCTTGCAAATGTAAGATTTAGAATAAAGTTATCTAGGAAAAAGCTGTACAGCATTGGCAGAGCGGGAGGTAGCAGATGTGCGGCTGAATCTCTAATTGCAAAGGATGCAGAAGAGGTCAATAAAGCATCTGTTTTGGGAAACCCTCACATAATGTATGATTGCAGAGGCACAGTGTATGACTTAGACTTTATCAACTTTTATTTCTAATCGTCAACTAGACCAAAAGGAGGGAGGTTATAGTGCAAGTGATTAAAAGTATCTGCCTCAAAGCTTCTAATCCTATTTGTGTACAGATTGTACAGCTGTGGTTCACCCCTGTGCACCCCTGTAAGGATTGTAAGGTCCACCCTGGGGCCTTCTCGTGTTTTGCAGAGTGTAAACCACTGGTCCCATCCCTTTTATCACTCTCCATTTAGCAGGTGACAAGGTGCAGCAGCTTCCTAGTGGATTGGTGAAACCCATCTCTTTGTGCCCAGTTTCATTAACTGCTAATACATGTTCTTTTCAGTTgagaatgacattttaatttgtcttcCATGGATGCCCTACAGGGTCTACTGCATGGGATTCCTCATTCTCTTTCTAGCACAGTAACCCAGTGGCTGAAGTGAAGTTGGGTAGAGATCACATGACCAGGGATATTGGTAGCATACAGTGATTGCTTTTACTGAATGAACAGAGCATTTTAAGCAAGTATGATTGAAGCAGACTTATTGACCCTCCTTGTTAACCTCTGACTTGCAtaggaaaaaagtgttttctagCTTTTGCATGctaatttgtgttttctgtttcattgattttatgaagtatattgtttttttttaaacactgaatttaTTACTCTGAGCTATTCATAATTTATCTTAATTACAAAAAGTAGttgcattttgaatgaatttCCCAATCCAAACAATGTATTACAATTGTATGTACATTAATGCTTTAATGAATTAACAATTAatagtgtaaaaataaagtatgaaGGTGTCAAAACCTTGCATCTGTGGAAAATCTAGATTCGTTACCACATTTTTGTCTTGCTTCCTAAAGCAGACTTACAATTTCTGGCATTTCCTGACATACAAGGGTAATTACAGCAAGAATCGGGTTGCctttccaaatgtttttctgCCAGGACAATGTTTGTTCTTAAATATCATGAGGGACATTAAATGGCCATCCTTGCCAAAGAAAGGCAGCTACTCTGTTCAAGAATATTAATTTGATCCTTCATCCTATTTCTTGCCAGTCTTGTCATTTCAACAGTACTACAGCGTTTAAAGCTAAGAAAGTGAGTTCCCTGTAATTGATGTATAAAGTGGATTGATTTTAGAGGCCTAGttattttacagtgcattttcttttcttatccAGGTGTTCGTAAGATAATCTAAACAAATTTGTAAGATATTCTGAAGG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>TU115048
CTTATAGATGCTGCAACAGGGCATTCTCAGACAGTTGCTGCATGGCCCAGCCTGGGAGGGAATTGTCCAGCTTAATGGTGACTTCTTCAGCAGCGAGATTCCAGCAGCCGATGTTTACATTCTCGCCCGGATTATTCATGACTGGAAGGAGGAGAGGTGCGTTCAGCTGCTGAAGAGGCTCCACTCACTGTGCCAGCCAGGTGGTGGTGTCCTGATCGTGGAGGCCCTCCTTTTTGAGAACAAGAGAGGCCCAGTCATGGCTCAGATCTTCTCCCTCAACATGCTCGTCCAGACGGAGGGCAAGGAGCGCACCCCCTCCGAGTATTTCCGGATGCTCTCTGCCGCGGGATTCAAGGATACCCAAGTCCGGAGAACGGGAAAGTCTTACGATGCAATTCTGGGAGTTAAATAAGCACCAGGTAGAACACAGGCCACAGCCATCCTGTGAAATCGTCCCGTAAGTGTGCATGCCTCGTGCTCTGTATTTATCGTAATGAGTTTGTTattagacacagacacagaagcaAAAAGCGTTTGAGACCACAAAATAAGATGGTTAATCCCGCCTGATAAATGTTTGCACTAGATCATGACaatcacaaaaaatatgtacaagACCTTTTAAAGGGTTAATCcacactgtaataaaaatgaaaatgtaaactcTTCCACCTTGCTGCTCTAAATGTATTTAGtcattgtatatgtttttgctCCAGAACATCTGCATAATGGCAACACTGTCAATCTCCCAAATCAGAATTCTCAGCGCCAGCCTTAGCCAGGAAAGATGACTTCTGTGTGTTGGCTTTGAATGTACCAGTGCATGCCCAATGTGGCATCGGGAAGCTCCTTGAACTCTGTAAATCCTCACTTGTCTGTGTGGGAGGTATCATGGTGGGGGCAAAATATATCTGCTGAATTCTTGTGCCCCCATATGGTTATGTGTGAGTTTGTAGATATCAATGCAGTTTATATGAAGCTTGAGTTGTTAATTGCTTAGAAAACAATTTCTCATCACCTTCAGTTCACACCTCCACTGTAGCTATAGCACTGAAATATGTTTGTCACACAGACAAATGCATTTGTATGTAGAGTTTAAGAGGCTTACATTCACTGTTACATGTGAACTTGAGGaacatgatttttttcttttttcttttctggctAAGAAGAGTACATGGAGAAGTCAGATTTGGTACATTGACAGTGTgaaaaatgtgacaaaatgcatttgaaccCGCAAGGTGGGATGGTTTATTCTTGCCTTTTGTCTCTCTGTAGAGTTGCACTAACCCACACTACTGTTTTTCTCATTGTACAAAACTAACTGACCCAGCTGGTCAGGATTTTTTTTGCTTCTGCCCTTATCTGTGATCTTACCCTGATGAACACAGGGGAAACACTGTTGACCAGCTTTTCTGGCTGTTGAGCGCGATAATTTGACACCCACTTGACAatctgctgtgctgtttttggCACATCGTATTCCGAAGTGTGttctacatttatataatcCTGCACTTGGTCCCTACACTGCAAACCTGGGACTTCCTTGCActtaatgcatgtttttaaaacaaacaaaaaaacaaaaagtaatttagACCTCTGATAAAATACCTGTTAATTTAccacttctactactaatatGAAATGTTGAGGaatatataaatgaacacaACATAACCATGAAAACCAAATAGACTGACTTATGCACAGTAAGGTTCAGGTGTTTTTAGGGTCTGGTGACATACGTCAGCTGCTCTGAAGCTGCTTGAAACGTTGATTGCAAGTTAGGTAGGCCTGAAAGGTCCTGGCTGTAAATATCTGCTGCTGTTTCAGCCTGTGCTTTCACTGTTTTTAGTTTCCATCTTACTGACCCTTTACTCTTTAAATCAGACTTACCACTCAGCTAAACTGAGGAGATAAATCACACCTTTTAAagagtttttaatgttattatgaagaataattgtatttatttttggcttcAATTGGATAGTATGCTgccaaacacacaaagacattgCTATGGTTAGCAGAATTGCTTGGCAAACCGCTATCCCCTACCATCCTTTGATTCAAATGCACAAAGCGTTGAAAGAACAAAAGGTCCAACAGAAATCACTCCATTGACCACAGTGCAAATCGAGGGGTTTACTATAAGTGTCCATAGTTTTTGTTATCTAGTCAGTTACTATTTTACCGGATTAACCTAATCAGTAGAGATTGCCATGGTTGTGCACAAGATCAGCTCCCAGGTTCAGGAACAACGAAGCACTCTATTACAGCCGAGTTAGATCCAGACTAGTGAAATGGTTTTGAAGAAGCATATTGCCTTCCTTGCAAATGTAAGATTTAGAATAAAGTTATCTAGGAAAAAGCTGTACAGCATTGGCAGAGCGGGAGGTAGCAGATGTGCGGCTGAATCTCTAATTGCAAAGGATGCAGAAGAGGTCAATAAAGCATCTGTTTTGGGAAACCCTCACATAATGTATGATTGCAGAGGCACAGTGTATGACTTAGACTTTATCAACTTTTATTTCTAATCGTCAACTAGACCAAAAGGAGGGAGGTTATAGTGCAAGTGATTAAAAGTATCTGCCTCAAAGCTTCTAATCCTATTTGTGTACAGATTGTACAGCTGTGGTTCACCCCTGTGCACCCCTGTAAGGATTGTAAGGTCCACCCTGGGGCCTTCTCGTGTTTTGCAGAGTGTAAACCACTGGTCCCATCCCTTTTATCACTCTCCATTTAGCAGGTGACAAGGTGCAGCAGCTTCCTAGTGGATTGGTGAAACCCATCTCTTTGTGCCCAGTTTCATTAACTGCTAATACATGTTCTTTTCAGTTgagaatgacattttaatttgtcttcCATGGATGCCCTACAGGGTCTACTGCATGGGATTCCTCATTCTCTTTCTAGCACAGTAACCCAGTGGCTGAAGTGAAGTTGGGTAGAGATCACATGACCAGGGATATTGGTAGCATACAGTGATTGCTTTTACTGAATGAACAGAGCATTTTAAGCAAGTATGATTGAAGCAGACTTATTGACCCTCCTTGTTAACCTCTGACTTGCAtaggaaaaaagtgttttctagCTTTTGCATGctaatttgtgttttctgtttcattgattttatgaagtatattgtttttttttaaacactgaatttaTTACTCTGAGCTATTCATAATTTATCTTAATTACAAAAAGTAGttgcattttgaatgaatttCCCAATCCAAACAATGTATTACAATTGTATGTACATTAATGCTTTAATGAATTAACAATTAatagtgtaaaaataaagtatgaaGGTGTCAAAACCTTGCATCTGTGGAAAATCTAGATTCGTTACCACATTTTTGTCTTGCTTCCTAAAGCAGACTTACAATTTCTGGCATTTCCTGACATACAAGGGTAATTACAGCAAGAATCGGGTTGCctttccaaatgtttttctgCCAGGACAATGTTTGTTCTTAAATATCATGAGGGACATTAAATGGCCATCCTTGCCAAAGAAAGGCAGCTACTCTGTTCAAGAATATTAATTTGATCCTTCATCCTATTTCTTGCCAGTCTTGTCATTTCAACAGTACTACAGCGTTTAAAGCTAAGAAAGTGAGTTCCCTGTAATTGATGTATAAAGTGGATTGATTTTAGAGGCCTAGttattttacagtgcattttcttttcttatccAGGTGTTCGTAAGATAATCTAAACAAATTTGTAAGATATTCTGAAGGAGGTAATAAACTACCAAGGACATTTTTCATAGACAACTGCCTTGAAATGTTTTGTCACTGCCTTTGTCTATTTAACTTTTGATAATATTCTGTAAGTCACTTCCATGTGtgtcaaacaaaatgtgtataaaaatactaaatacgcT

Function

GO:

id name namespace
GO:0030187 melatonin biosynthetic process biological_process
GO:0032259 methylation biological_process
GO:0008171 O-methyltransferase activity molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00017665 True 5145 mRNA 0.41 9 17468606 17487497
TU115048 False 3913 TUCP 0.40 3 17468605 17474339

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00017664 NA coding downstream 6004 17425411 ~ 17462601 (-)
AMCG00017661 pcdh10,pcdh10a,LOC106604685,LOC104931883 coding downstream 670764 16785668 ~ 16797841 (-)
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AMCG00017660 tada2b coding downstream 2254860 15213497 ~ 15213745 (-)
AMCG00017648 naa15,LOC105908469,LOC108263533,LOC108434806 coding downstream 2388299 15075823 ~ 15080306 (-)
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AMCG00017671 abhd18,LOC107595739,LOC107653339 coding upstream 70947 17558444 ~ 17575772 (-)
AMCG00017672 NA coding upstream 101384 17588881 ~ 17599693 (-)
AMCG00017669 NA coding upstream 133405 17620902 ~ 17664785 (-)
AMCG00017677 NA coding upstream 195665 17683162 ~ 17697440 (-)
G92200 NA non-coding downstream 215975 17252430 ~ 17252630 (-)
G92183 NA non-coding downstream 306960 17161245 ~ 17161645 (-)
G92179 NA non-coding downstream 471101 16997220 ~ 16997504 (-)
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G92313 NA non-coding upstream 226406 17713903 ~ 17714182 (-)
G92375 NA non-coding upstream 366430 17853927 ~ 17855416 (-)
G92386 NA non-coding upstream 402845 17890342 ~ 17891070 (-)
G92401 NA non-coding upstream 617492 18104989 ~ 18105268 (-)
G92428 NA non-coding upstream 900308 18387805 ~ 18452812 (-)
AMCG00017663 NA other downstream 73556 17387484 ~ 17395049 (-)
G92129 NA other downstream 1437700 16030402 ~ 16030905 (-)
G92124 LOC101154678 other downstream 1600958 15866947 ~ 15867647 (-)
AMCG00017638 scoc,LOC103463814,LOC103132857 other downstream 2703773 14760068 ~ 14764832 (-)
AMCG00017631 NA other downstream 2983787 14433158 ~ 14484818 (-)
AMCG00017675 NA other upstream 294151 17781648 ~ 17789749 (-)
G92436 NA other upstream 975287 18462784 ~ 18463176 (-)
G92591 nansa,LOC108416893,LOC108416857,LOC107723182 other upstream 1925490 19412987 ~ 19419356 (-)
AMCG00017725 NA other upstream 2814503 20302000 ~ 20358625 (-)
AMCG00017780 LOC101079287,LOC106577738,LOC100690429,LOC105925506,LOC108244244 other upstream 5830596 23318093 ~ 23321954 (-)

Expression


Co-expression Network