AMCG00017725


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00017725
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030131.1
NCBI id CM030131.1
chromosome length 33043351
location 20302000 ~ 20358625 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00017725
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>TU115645
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>TU115646
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Function

GO:

id name namespace
GO:0005509 calcium ion binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00017725 False 3232 mRNA 0.40 10 20306326 20345619
TU115645 False 307 lncRNA 0.34 2 20302000 20358625
TU115646 True 6622 lncRNA 0.36 2 20302000 20317431

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00017726 LOC102788851,LOC106608629 coding downstream 315385 19973418 ~ 19986615 (-)
AMCG00017727 ppp3ca coding downstream 347188 19948192 ~ 19954812 (-)
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AMCG00017728 NA coding downstream 432543 19868999 ~ 19869457 (-)
AMCG00017720 NA coding downstream 491872 19696553 ~ 19810128 (-)
AMCG00017731 nfib,LOC106608626 coding upstream 35252 20393877 ~ 20408258 (-)
AMCG00017729 NA coding upstream 99590 20458215 ~ 20482752 (-)
AMCG00017736 tmod1,LOC102782831 coding upstream 139642 20498267 ~ 20514665 (-)
AMCG00017734 LOC103364796,LOC106608959 coding upstream 161593 20520218 ~ 20550836 (-)
AMCG00017738 NA coding upstream 195042 20553667 ~ 20571410 (-)
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G92660 NA non-coding downstream 434364 19867418 ~ 19867636 (-)
G92657 NA non-coding downstream 435583 19865972 ~ 19866417 (-)
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G92608 NA non-coding downstream 688818 19612705 ~ 19613182 (-)
G92714 NA non-coding upstream 56681 20415306 ~ 20415612 (-)
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G92800 NA non-coding upstream 276047 20634672 ~ 20634880 (-)
G92822 NA non-coding upstream 313440 20672065 ~ 20676278 (-)
G92823 NA non-coding upstream 318034 20676659 ~ 20734422 (-)
G92591 nansa,LOC108416893,LOC108416857,LOC107723182 other downstream 882644 19412987 ~ 19419356 (-)
G92436 NA other downstream 1838824 18462784 ~ 18463176 (-)
AMCG00017675 NA other downstream 2512251 17781648 ~ 17789749 (-)
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AMCG00017780 LOC101079287,LOC106577738,LOC100690429,LOC105925506,LOC108244244 other upstream 2959468 23318093 ~ 23321954 (-)
AMCG00017819 NA other upstream 3906054 24264679 ~ 24270595 (-)
AMCG00017839 NA other upstream 4587470 24946095 ~ 24949136 (-)
AMCG00017844 frmpd1b,frmpd1,LOC107750435,LOC107570223,LOC107655878 other upstream 4638919 24997544 ~ 25018212 (-)
AMCG00017861 LOC103354863 other upstream 5586516 25945141 ~ 25957648 (-)

Expression


Co-expression Network