G115279


Basic Information

Item Value
gene id G115279
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030135.1
NCBI id CM030135.1
chromosome length 28454832
location 5750092 ~ 5754022 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU144387
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>TU144388
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>TU144390
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU144387 False 3637 lncRNA 0.37 1 5750285 5753921
TU144388 False 3738 lncRNA 0.37 1 5750285 5754022
TU144390 True 3830 lncRNA 0.37 1 5750092 5753921

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00018262 cops3 coding downstream 4388 5741029 ~ 5745704 (-)
AMCG00018258 NA coding downstream 137617 5608590 ~ 5612475 (-)
AMCG00018250 tmem11,LOC106600685 coding downstream 395169 5349638 ~ 5354923 (-)
AMCG00018252 dhrs7b coding downstream 407108 5332241 ~ 5342984 (-)
AMCG00018253 NA coding downstream 427777 5311157 ~ 5322315 (-)
AMCG00018264 rasd1,LOC107653935,LOC107720458 coding upstream 29054 5783076 ~ 5784900 (-)
AMCG00018265 NA coding upstream 40495 5794517 ~ 5808843 (-)
AMCG00018263 NA coding upstream 127524 5881546 ~ 5886000 (-)
AMCG00018274 clec16a coding upstream 314281 6068303 ~ 6124832 (-)
AMCG00018289 NA coding upstream 374691 6128713 ~ 6155791 (-)
G115278 NA non-coding downstream 49 5749783 ~ 5750043 (-)
G115277 NA non-coding downstream 1733 5747458 ~ 5748359 (-)
G115243 NA non-coding downstream 142023 5607833 ~ 5608069 (-)
G115219 NA non-coding downstream 400462 5345762 ~ 5349630 (-)
G115202 NA non-coding downstream 404958 5344487 ~ 5345134 (-)
G115332 LOC100136012 non-coding upstream 292008 6046030 ~ 6046618 (-)
G115395 NA non-coding upstream 463506 6217528 ~ 6219216 (-)
G115534 NA non-coding upstream 1247780 7001802 ~ 7002005 (-)
G115577 NA non-coding upstream 1980075 7734097 ~ 7734384 (-)
G115579 NA non-coding upstream 1987952 7741974 ~ 7742210 (-)
AMCG00018251 natd1,LOC107745813 other downstream 383338 5356846 ~ 5366754 (-)
G115183 NA other downstream 445663 5300107 ~ 5304429 (-)
G115174 NA other downstream 462219 5286386 ~ 5287873 (-)
AMCG00018220 NA other downstream 1098451 4646147 ~ 4651641 (-)
G115020 NA other downstream 1161795 4586062 ~ 4588297 (-)
G115320 NA other upstream 196399 5950421 ~ 5951055 (-)
AMCG00018291 NA other upstream 856611 6610633 ~ 6652773 (-)
G115581 NA other upstream 1989196 7743218 ~ 7773892 (-)
AMCG00018344 NA other upstream 2887874 8641896 ~ 8648807 (-)
AMCG00018339 NA other upstream 2912715 8666737 ~ 8676808 (-)

Expression


Co-expression Network