AMCG00019480



Basic Information


Item Value
gene id AMCG00019480
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CM030124.1
NCBI id CM030124.1
chromosome length 51038645
location 23233270 ~ 23248099 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence


>AMCG00019480
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>TU43137
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>TU43138
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Function


GO: NA

KEGG:

id description
K15985 PKIA; cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00019480 True 3270 mRNA 0.34 3 23239676 23248099
TU43137 False 2979 lncRNA 0.33 3 23233270 23248099
TU43138 False 2925 lncRNA 0.33 3 23239650 23248099

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00019477 NA coding upstream 531234 22693692 ~ 22702036 (+)
AMCG00019479 NA coding upstream 544993 22670411 ~ 22688277 (+)
AMCG00019478 ropn1l coding upstream 576361 22644268 ~ 22656909 (+)
AMCG00019470 cct5,LOC107686714,LOC107695377 coding upstream 645136 22582760 ~ 22588134 (+)
AMCG00019469 sema5a,LOC108426609,LOC106578437 coding upstream 778741 22390170 ~ 22454529 (+)
AMCG00019488 NA coding downstream 318482 23566581 ~ 23575527 (+)
AMCG00019494 NA coding downstream 847196 24095295 ~ 24102633 (+)
AMCG00019493 NA coding downstream 860863 24108962 ~ 24149017 (+)
AMCG00019495 NA coding downstream 905398 24153497 ~ 24178723 (+)
AMCG00019499 NA coding downstream 932096 24180195 ~ 24182210 (+)
G34446 NA non-coding upstream 269272 22963457 ~ 22963998 (+)
G34445 LOC107590286,LOC107591257,LOC107701635,LOC108438556 non-coding upstream 303960 22929020 ~ 22929310 (+)
G34438 NA non-coding upstream 344531 22881180 ~ 22888739 (+)
G34436 LOC107686039,LOC107746909 non-coding upstream 414810 22818143 ~ 22818460 (+)
G34435 NA non-coding upstream 433552 22799400 ~ 22799718 (+)
G34509 zfhx4,LOC107705239,LOC107666618,LOC107586695 non-coding downstream 406328 23654427 ~ 23654645 (+)
G34510 zfhx4,LOC107586695 non-coding downstream 422483 23670582 ~ 23671043 (+)
G34581 NA non-coding downstream 897040 24145139 ~ 24145909 (+)
G34621 NA non-coding downstream 991317 24239416 ~ 24239813 (+)
G34632 NA non-coding downstream 1079341 24327440 ~ 24328019 (+)
AMCG00019481 NA other upstream 29020 23185816 ~ 23204250 (+)
AMCG00019475 march6,LOC105024238,LOC102207159,LOC101475102,LOC102312386,LOC104929871,LOC100690953,LOC102783154,LOC107746911,LOC107686038,LOC107732575 other upstream 590044 22615623 ~ 22643226 (+)
G34170 rpl7 other upstream 2622381 20607474 ~ 20610889 (+)
AMCG00019428 LOC107595150 other upstream 3778133 19451247 ~ 19455137 (+)
AMCG00019415 NA other upstream 3939062 19285536 ~ 19294208 (+)
G34511 zfhx4,LOC107590192,LOC107721891 other downstream 424026 23672125 ~ 23695801 (+)
AMCG00019492 NA other downstream 797590 24045689 ~ 24086481 (+)
AMCG00019496 NA other downstream 967778 24215877 ~ 24219991 (+)
AMCG00019535 NA other downstream 5365156 28613255 ~ 28710887 (+)
AMCG00019551 lsm5 other downstream 6052856 29300955 ~ 29305006 (+)

Expression



Co-expression Network