AMCG00019676


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00019676
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030124.1
NCBI id CM030124.1
chromosome length 51038645
location 37178359 ~ 37213519 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00019676
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>TU45128
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
K24246 EMILIN; emilin

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00019676 True 8641 mRNA 0.41 13 37178359 37213519
TU45128 False 1680 lncRNA 0.37 2 37201924 37204962

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00019677 NA coding upstream 9072 37091023 ~ 37169287 (+)
AMCG00019670 tyms coding upstream 977168 36197051 ~ 36201191 (+)
AMCG00019669 NA coding upstream 987563 36187052 ~ 36190796 (+)
AMCG00019660 NA coding upstream 1446101 35716345 ~ 35732258 (+)
AMCG00019653 NA coding upstream 1804076 35351443 ~ 35374283 (+)
AMCG00019680 myl12.2,LOC104925296,LOC105894777,LOC107732590,LOC103037289,LOC107746904 coding downstream 152455 37365974 ~ 37371256 (+)
AMCG00019681 NA coding downstream 158860 37372379 ~ 37378679 (+)
AMCG00019689 NA coding downstream 186081 37399600 ~ 37406431 (+)
AMCG00019691 NA coding downstream 196249 37409768 ~ 37419547 (+)
AMCG00019693 NA coding downstream 390994 37604513 ~ 37606380 (+)
G36106 NA non-coding upstream 117715 37060418 ~ 37060644 (+)
G36098 NA non-coding upstream 231861 36946101 ~ 36946498 (+)
G36094 NA non-coding upstream 266380 36911541 ~ 36911979 (+)
G36088 NA non-coding upstream 550289 36627690 ~ 36628070 (+)
G36054 NA non-coding upstream 951010 36226038 ~ 36227349 (+)
G36130 NA non-coding downstream 25370 37238889 ~ 37240494 (+)
G36189 NA non-coding downstream 174809 37388328 ~ 37389962 (+)
G36370 NA non-coding downstream 1642320 38855839 ~ 38857856 (+)
G36454 NA non-coding downstream 1868591 39082110 ~ 39082411 (+)
G36464 LOC103376870 non-coding downstream 2044512 39258031 ~ 39258546 (+)
AMCG00019671 adcyap1,paca,LOC106578701 other upstream 878812 36292346 ~ 36299547 (+)
AMCG00019662 hacd1,LOC105890814,LOC106590135,LOC106578705 other upstream 1114509 36046477 ~ 36063850 (+)
AMCG00019641 NA other upstream 2327036 34840316 ~ 34851323 (+)
AMCG00019638 LOC107757182 other upstream 2599919 34454209 ~ 34578440 (+)
AMCG00019609 NA other upstream 4785383 32324400 ~ 32392976 (+)
G36212 NA other downstream 300468 37513987 ~ 37516027 (+)
AMCG00019708 vps41,LOC102790284 other downstream 1364797 38578316 ~ 38632178 (+)
AMCG00019747 tubb6,LOC108431516,LOC100711323,LOC107688430 other downstream 5343021 42556540 ~ 42572080 (+)
AMCG00019751 NA other downstream 5411211 42624730 ~ 42627105 (+)
AMCG00019755 NA other downstream 5747137 42960656 ~ 42962658 (+)

Expression


Co-expression Network