G38152


Basic Information

Item Value
gene id G38152
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030124.1
NCBI id CM030124.1
chromosome length 51038645
location 50845977 ~ 50850167 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU47593
GGGACCATGCAGGCAGAGTCTCCCAACACTGCCTGGGGCTTCCATGCCATTGCTGAGAATCAGGGGGTGGGGTCATAGGAACAGAGACCCACATACTGCAGCCTCCAATTAAAGAGCTTGGACAGATCCTGCCCTGACTCCGCCTGATGAGGCCCTATCAATATTACAGGAGATCTGATGAACCCATGGTGGATATACTGCATCCAGAGGGCTAGTTTGGTGGTTAACCCTTGAAAAAACAAGCTGACATGATATAAAAAGCATAATTCCCCATTAATGGATGATGAGTAACCACCtataaaagcatatatatatattatcagaGAGCAGATGTTGTAACTTGGACTGCAAAACTGGCACAAGCTTACATATGAAGCATTATAATGAGGTAACTAACACGGGTGCGAAACTGTATTACTGATGCTTTAAGGTCGCTATGGCCCCTTTCACACTAGCAATCCAACCTGGGTTATGACTCACTTTTTGAGCAAACTGGGTGATGATTTTCCTCCGGATCAAGGGCCACCCGCCCAAGCCAGCCAGCACTGACCCGGGTCAAGTGAGACGAAGGGCATTGCGATTGTAGATCTGAGCTGCTTATTGAACCTGTAGTGTGACCGCAAGTACCCGACCCACTGGACTCGGCTGCTAATGTGAAAGGGGCTTATTAATGGTTTATAGACTGGTTATGTACTGCTATTTGAGGAACCTGATTGATAAATGTTACAGCCTGGTTTATAGAAAGATTCAGAGGCAGCAGACATTTGTTGTGCCCTCCTGTAGGGGGTGCTGAGCAGTTTGGCTGGACCATAGTGTATGCTGTCAGGGCCTGTACCCTATAGAGGACATTTTTACCTTTTATCACGGAAAAAAGACAAACTATGTAGTATTCTATTGTGGCTTCAGAGTTGCCTTCGTGGCACATGTAGCTTATTTAtgacttgcattttatttaagcaatatatatgtatatacattttagcatttatatatacatatatacaaatattttttttaaacgtgtATTGATATACTGTAGATCAACAGAGTCACGCTATGGAGTTCAGTTTAAGGTTTCTTGTGTTTCCAGGCTGGGGGTGGAGTGAGCAGTGAAATGGCGCTAGATTATCGAGTGCTCTTCCCAGCGCGAGGGGTTGCGTTCACAGCACATCCCTTTTTGCAGCAGTCACTTCTGGGGAGCTGCATGGCTGCTCCATTTTGTAATCCGGTTACAGTGTACGCCTGCCATTCCTCACTCTTCCTCacccgtgtctgtgtgtctgtgcgagTGGCTGAGAGTGCGTCCGCTTTTGTTTCATGTTCCTCTGGGTCTGTAACTAAAATAGCCAGCTTGAAAGCAACCCGTCGGCCGTCTGTTGTCCGGAGTCCCATTACAGTAACCAATCCCTCTGGCTCTGACAGGAACACCCCTGCTGACCAgctgctttctctttttttaattttatttgttatgaCTTGTATGCTTTTTAACCGCTGTGTGTTTTAggattaaatgtatttccaacAGGAGAGAACTCCAAACACAACTGCCCACTTCAGTGTCTTTTATCTTTACACTTACAACTGCtacaagattattttttttaagagaagggaaaaacttttttttattgcttattttaatggtttatttattgtgagGTACCAAATGTGTAAACCTGTTTTACTCCTATACCATCCAGCATACctgcatttaattatatagagagagtatatatattaaaataaagaggtTAAGGTACATGAGTCCATTAAACGGTCGCTGACAGACTTTTCTTCTCCTTGAAAGTGCACTATGATACAATATCTAGTTTTGCAGCTGCTAATCAATAGTGTGACGACCGTGCTTTGCAATGGAGACataaagacaacaaaaacacaaagtaacACGCTGAGGAAGGTTGTATACTTTATGAAGCTGCTTACAATACACAATTTCAGCCAGTACTGCCATTTTACTGAGGATATACAATTGCGCTTGTGGGTCACTTGAAGGCGTCCGTCTCTAAGCGCAAGACTGAGACAGAGACTGATGCCGTGGACGCCTTACGCACACAAGTTTTTGCTGCATTTTCTTGCAACGGCCAAGAAGACAAAACCAAGATCTGATCTATAAGTAAAGTCTGTGGTAAACGgagcctttgttttgtttgtttgtttgaagtaTAAATTAATGATAAAGACTGGCATGTTTGACATTTCATCTTGCAGATATCACTGTGCACCGTGATTGGAGCCTAGAGGACACCTCCCTTTGTGTGCTTTGGGATagctgtttttgattttgtctgtctgtcctggACATTGTTGGACACGCAGagagaaatggaaagagaaacCTAACAGAGAGATGTTTCTGTACATAAAAGCCTGGGGATGTGGACTTGTGGATTGGACTGTGGAAACGGAGACTTCCGAAGCAAGGGACTCTGTAAGCCCAGAACCCAGTTTCCGCTGTACCCCATATGGTGCcgtttctttttcttaaaattTTTCATTAAGTTGACCCTTGTAAGTTGTTCTGCAGGAGGTTTGTGCCTTCTTACTGAGGAAGCAGGCGGGTCCACAGTGATATTGTGGGGAGATTTTTTGCTTCCTTCACGAGGCAGGGTTTACACACTGATGAAAGGAAGAAGAAACGTGAGGATCTTGTGGATATTTGATTTGCCATTGACTTGATTTGGTCTTGTTTCGCGAAGAGACGAGCCATAacttctctcctcttccctgCTCTCGTCTCTTGGATAGTGTGACATTTGCATCCCTTTCTAAAAGCAGAAGTCGAGAGAGATAAGAATGATAAAGCGCTTAGGTTGAACGTGCGGAGCAGAAAGTAAGGATTGTTAAACGAACACCGGATCACAGAAACAGAAGGTCAATGCGTACACATGTTTCAGCTGTACTTGAGAAGTATGAAACTTGTTTTCCCATTTCCCATTCTTCTCATTTTTCAGCCCCATTATTTGTTGACTAGTGAAAAACATAACCTGAATCTGCTGTCACACCTACGTTTAGCCTTAATGAGGTCTTTCTTCCCTATATGATGCATATGATTattcaaacatgtttttgttttatttagttttttgtttttggaaaacttTAATCAAGTGATTGTGACAGATTATATCCTATCCCAATGTTTTACTACCATCTGTCTAGCTAACCATGCCTTTTATGCAAATAAGAGCACAAACTAACAGCATTTTCACCTTATAAAGTTTCTGTGTTGATTTGGCTATTTATCCATTTTAGAAACGGGCCCTattctgaaatatgaaatacctTCCTGAAGCTAAGGAGATtataaaacattcacacacTCCCAACACGAGTTCAGTCACTCAGTATGCGAACGATAAGTAACAAATAGTTTAACATTGTTTCCAAAGTGTTAAAgtgaaacatgcatttatttttttccagatgtCTGTGGTCTAAAGTCTTTCTTTTGTCAAGTCTGTCTCTCCATTAGAGATGCAGAAAAGACTAACTTGATAtccattcacttttttaatgGTTGTATGAATTAGAATGAGtttaatatggaaacaaaataccTACTACTGTGTTTAATATTGTCCCAGTTTCAATTTACACATTATAAGATTCCCCTGTTCCATAGTTGATGGCTCTTAGATTTCCTTGCCCTTTCTCTCCTGAACACGGCTGGAGCAGTTTATGAGTGCTGACTGGACAGGGCTGACGATCTTCAggcagaagaaagaaagaaaaacatttgttcaaCAGCCGAATGGGTGAATGACTTGGGATTTCCTTCACATCACCACAGGTTATTTCACATTGTGGCAATAGAGTTGGGGTCAATTGCAGTTCAATTATGGACTCGGAATAGGAGCTGAAGGCATTAGGGTTGTGGGACTGGAAATGACTGGATTGACTTGAGGTGGAATTGAAGAAGAAAAGAGCTGGCCTTGTGGTTGTGTTCTGAATAATCATCTCTGtaatattcacttttttttaatggtaaagCAACTCTTATTTTGCCTCATGATTCCTGTCATTGTATATTTCTAACTTAAACCTCCATATAAGAAAGCGATTAATTAATGTTGTCAGTGTCTTATAAACTATAAAGAACTTAATCTCAGCCTTTACATTAGAATGTGGTTctctttttattatgatttatttatcttctgATTATAG
>TU47594
TGGACTGCAAAACTGGCACAAGCTTACATATGAAGCATTATAATGAGGTAACTAACACGGGTGCGAAACTGTATTACTGATGCTTTAAGGTCGCTATGGCCCCTTTCACACTAGCAATCCAACCTGGGTTATGACTCACTTTTTGAGCAAACTGGGTGATGATTTTCCTCCGGATCAAGGGCCACCCGCCCAAGCCAGCCAGCACTGACCCGGGTCAAGTGAGACGAAGGGCATTGCGATTGTAGATCTGAGCTGCTTATTGAACCTGTAGTGTGACCGCAAGTACCCGACCCACTGGACTCGGCTGCTAATGTGAAAGGGGCTTATTAATGGTTTATAGACTGGTTATGTACTGCTATTTGAGGAACCTGATTGATAAATGTTACAGCCTGGTTTATAGAAAGATTCAGAGGCAGCAGACATTTGTTGTGCCCTCCTGTAGGGGGTGCTGAGCAGTTTGGCTGGACCATAGTGTATGCTGTCAGGGCCTGTACCCTATAGAGGACATTTTTACCTTTTATCACGGAAAAAAGACAAACTATGTAGTATTCTATTGTGGCTTCAGAGTTGCCTTCGTGGCACATGTAGCTTATTTAtgacttgcattttatttaagcaatatatatgtatatacattttagcatttatatatacatatatacaaatattttttttaaacgtgtATTGATATACTGTAGATCAACAGAGTCACGCTATGGAGTTCAGTTTAAGGTTTCTTGTGTTTCCAGGCTGGGGGTGGAGTGAGCAGTGAAATGGCGCTAGATTATCGAGTGCTCTTCCCAGCGCGAGGGGTTGCGTTCACAGCACATCCCTTTTTGCAGCAGTCACTTCTGGGGAGCTGCATGGCTGCTCCATTTTGTAATCCGGTTACAGTGTACGCCTGCCATTCCTCACTCTTCCTCacccgtgtctgtgtgtctgtgcgagTGGCTGAGAGTGCGTCCGCTTTTGTTTCATGTTCCTCTGGGTCTGTAACTAAAATAGCCAGCTTGAAAGCAACCCGTCGGCCGTCTGTTGTCCGGAGTCCCATTACAGTAACCAATCCCTCTGGCTCTGACAGGAACACCCCTGCTGACCAgctgctttctctttttttaattttatttgttatgaCTTGTATGCTTTTTAACCGCTGTGTGTTTTAggattaaatgtatttccaacAGGAGAGAACTCCAAACACAACTGCCCACTTCAGTGTCTTTTATCTTTACACTTACAACTGCtacaagattattttttttaagagaagggaaaaacttttttttattgcttattttaatggtttatttattgtgagGTACCAAATGTGTAAACCTGTTTTACTCCTATACCATCCAGCATACctgcatttaattatatagagagagtatatatattaaaataaagaggtTAAGGTACATGAGTCCATTAAACGGTCGCTGACAGACTTTTCTTCTCCTTGAAAGTGCACTATGATACAATATCTAGTTTTGCAGCTGCTAATCAATAGTGTGACGACCGTGCTTTGCAATGGAGACataaagacaacaaaaacacaaagtaacACGCTGAGGAAGGTTGTATACTTTATGAAGCTGCTTACAATACACAATTTCAGCCAGTACTGCCATTTTACTGAGGATATACAATTGCGCTTGTGGGTCACTTGAAGGCGTCCGTCTCTAAGCGCAAGACTGAGACAGAGACTGATGCCGTGGACGCCTTACGCACACAAGTTTTTGCTGCATTTTCTTGCAACGGCCAAGAAGACAAAACCAAGATCTGATCTATAAGTAAAGTCTGTGGTAAACGgagcctttgttttgtttgtttgtttgaagtaTAAATTAATGATAAAGACTGGCATGTTTGACATTTCATCTTGCAGATATCACTGTGCACCGTGATTGGAGCCTAGAGGACACCTCCCTTTGTGTGCTTTGGGATagctgtttttgattttgtctgtctgtcctggACATTGTTGGACACGCAGagagaaatggaaagagaaacCTAACAGAGAGATGTTTCTGTACATAAAAGCCTGGGGATGTGGACTTGTGGATTGGACTGTGGAAACGGAGACTTCCGAAGCAAGGGACTCTGTAAGCCCAGAACCCAGTTTCCGCTGTACCCCATATGGTGCcgtttctttttcttaaaattTTTCATTAAGTTGACCCTTGTAAGTTGTTCTGCAGGAGGTTTGTGCCTTCTTACTGAGGAAGCAGGCGGGTCCACAGTGATATTGTGGGGAGATTTTTTGCTTCCTTCACGAGGCAGGGTTTACACACTGATGAAAGGAAGAAGAAACGTGAGGATCTTGTGGATATTTGATTTGCCATTGACTTGATTTGGTCTTGTTTCGCGAAGAGACGAGCCATAacttctctcctcttccctgCTCTCGTCTCTTGGATAGTGTGACATTTGCATCCCTTTCTAAAAGCAGAAGTCGAGAGAGATAAGAATGATAAAGCGCTTAGGTTGAACGTGCGGAGCAGAAAGTAAGGATTGTTAAACGAACACCGGATCACAGAAACAGAAGGTCAATGCGTACACATGTTTCAGCTGTACTTGAGAAGTATGAAACTTGTTTTCCCATTTCCCATTCTTCTCATTTTTCAGCCCCATTATTTGTTGACTAGTGAAAAACATAACCTGAATCTGCTGTCACACCTACGTTTAGCCTTAATGAGGTCTTTCTTCCCTATATGATGCATATGATTattcaaacatgtttttgttttatttagttttttgtttttggaaaacttTAATCAAGTGATTGTGACAGATTATATCCTATCCCAATGTTTTACTACCATCTGTCTAGCTAACCATGCCTTTTATGCAAATAAGAGCACAAACTAACAGCATTTTCACCTTATAAAGTTTCTGTGTTGATTTGGCTATTTATCCATTTTAGAAACGGGCCCTattctgaaatatgaaatacctTCCTGAAGCTAAGGAGATtataaaacattcacacacTCCCAACACGAGTTCAGTCACTCAGTATGCGAACGATAAGTAACAAATAGTTTAACATTGTTTCCAAAGTGTTAAAgtgaaacatgcatttatttttttccagatgtCTGTGGTCTAAAGTCTTTCTTTTGTCAAGTCTGTCTCTCCATTAGAGATGCAGAAAAGACTAACTTGATAtccattcacttttttaatgGTTGTATGAATTAGAATGAGtttaatatggaaacaaaataccTACTACTGTGTTTAATATTGTCCCAGTTTCAATTTACACATTATAAGATTCCCCTGTTCCATAGTTGATGGCTCTTAGATTTCCTTGCCCTTTCTCTCCTGAACACGGCTGGAGCAGTTTATGAGTGCTGACTGGACAGGGCTGACGATCTTCAggcagaagaaagaaagaaaaacatttgttcaaCAGCCGAATGGGTGAATGACTTGGGATTTCCTTCACATCACCACAGGTTATTTCACATTGTGGCAATAGAGTTGGGGTCAATTGCAGTTCAATTATGGACTCGGAATAGGAGCTGAAGGCATTAGGGTTGTGGGACTGGAAATGACTGGATTGACTTGAGGTGGAATTGAAGAAGAAAAGAGCTGGCCTTGTGGTTGTGTTCTGAATAATCATCTCTGtaatattcacttttttttaatggtaaagCAACTCTTATTTTGCCTCATGATTCCTGTCATTGTATATTTCTAACTTAAACCTCCATATAAGAAAGCGATTAATTAATGTTGTCAGTGTCTTATAAACTATAAAGAACTTAATCTCAGCCTTTACATTAGAATGTGGTTctctttttattatgatttatttatcttctgATTATAG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU47593 True 4191 lncRNA 0.41 1 50845977 50850167
TU47594 False 3850 lncRNA 0.40 1 50845977 50849826

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00019862 actr3b,LOC107550018,LOC107664653 coding downstream 336110 50494102 ~ 50509867 (-)
AMCG00019863 NA coding downstream 494733 50345149 ~ 50351244 (-)
AMCG00019860 NA coding downstream 783853 49998081 ~ 50062124 (-)
AMCG00019859 htr5a,LOC106578632 coding downstream 995258 49848558 ~ 49850719 (-)
AMCG00019857 insig1,LOC107094588 coding downstream 1138594 49699238 ~ 49707383 (-)
AMCG00019871 NA coding upstream 70099 50920266 ~ 50921526 (-)
AMCG00019868 kdsr,LOC107681813,LOC107727538 coding upstream 77113 50927280 ~ 50943520 (-)
AMCG00019870 vps4b coding upstream 95705 50945872 ~ 50952372 (-)
G38145 NA non-coding downstream 2337 50830633 ~ 50843640 (-)
G38139 NA non-coding downstream 59961 50784990 ~ 50786016 (-)
G38135 NA non-coding downstream 78568 50766797 ~ 50767409 (-)
G38130 NA non-coding downstream 96519 50748753 ~ 50749458 (-)
G38053 LOC105030512,LOC106573797 non-coding downstream 356680 50486380 ~ 50489297 (-)
AMCG00019866 NA other downstream 133834 50705840 ~ 50712143 (-)
AMCG00019865 LOC102778867,LOC107557236 other downstream 147814 50596196 ~ 50698163 (-)
G37806 LOC100846954,LOC107575789 other downstream 2322275 48522668 ~ 48523702 (-)
AMCG00019824 NA other downstream 2944044 47892203 ~ 47901933 (-)
G37492 NA other downstream 4452879 46365338 ~ 46393098 (-)
AMCG00019869 NA other upstream 113246 50963413 ~ 50966929 (-)

Expression


Co-expression Network