AMCG00020423



Basic Information


Item Value
gene id AMCG00020423
gene name NA
gene type coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CM030127.1
NCBI id CM030127.1
chromosome length 42978078
location 18438204 ~ 18454657 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence


>AMCG00020423
gactgatcatttctttgtcagtgggaaaacgtacaaaatcagcaggggatcaaatactttttcccccactgcaTATAGGCAAAATAAGAGAAGTGGCCACATCTGGCTGCTGTCCCTGCACACTGACAGGTGCTAAGAAGGCAGACAGATCTGTACATGCCTGCCAAAATAAAGCGGCCTCTTCAAAGTCTGACAAATGTCCACATCTGTGTCTGCATCAGTCTATAGCTGGTAGCTCTGTTTTATACACCATGCAATGGCAATGCTCTAACATTTCAGATATTAACAATAAGACAACCCACATGGTTTATAACAAGGGCTGCAGGTTATCTTTATCAATTTGTGTCTCCAACATGTATACCTCATTTGGGGCTATTTTGTGACTCATAGGtctaaaagcagtagatataaCTGAAAGTGATACTTTGAgattgtgtaattaaaaataaataagtaaccaAAGCCATGATTCTACATCTTTACTAACACTGTATTGTCAACACTGAGAGAAAGGTAAATGAGTCAACCTCCGTATTATAAAAACCAGAGGGCATGAACTTTAATTTCTGGCTAACATAGGGAGCTCAGGAATGAGAAGCAGCCTGAGTGTCAACACTGCTACAGCAGGTTAACCTCAGCTGAAGGAGAACTGGAAATTGATGTGTAAGCACGGACATCTCAATATTAGTCACTTTGTCACTTATTTCTCAGTCCTTGTATACATCTGCTCCCCCAGTTTAACCAACATGCTAATCAATCCAATGCAGTTATACTTCATTAAATAATGGGGGAAGTCCTGCTGTAGCAAAATTAGCAAACTTGATCGACAGAGATAATGTTCCATGCAACACAAGAACACTGCAGATACAAACACCATCTGTTATCAGGTAGCTTGGCCTTGGCAGTGTGCAGGGCttggcacagacacacatgcaaaagTCTGCTGCTATTAGTACCATGCATGGAAAATACAGAACGAAAAATTGGGCTTTGTTTTGGCTATAGTATGGCTGTGtgcattttaagattaaaaaggCATGAACTACACAAGTACAAGTCGAGAATCTGGGAACTTCGTGGAAAGTTATGtccttttaaagttgtttttctaCGACGTTCATGGCACCATGGTCcagtttataaaacataaactCCTACAGTCAGTACCTGAGGCTAGTGCTGAGCCCTACACATTTCAACCTTTGGAAATATCAGCACAATTGCTTTCATGACATCGCAGCATTACCCTGTACAAGACATCAATATATATgagtgaaattaattttgtcCTTTGCTCTGCACATAGAGTCTGCTCTTATTTAAGAGGCGGTGTTGAAATAAATGAGCACATACACAGGGAATGCAGTGTAAAATTCGTTTGTGTTAGGCAGCCTCATTGCATAATTAACATGCCTCTGTGCTTGCTAGAAAAGAGGTAGAGcttgtttcagtgtttatttttgtaatgctacAAAAGTCTATTATAAAAACTGAtattactgttttctttttttatgtggaCTGTgacatgtaaaaaaacaaaaattggagCAGAATAACAATCATGTACAGTGGAAGTAGATGACtggaaatattgtttttatcgTTTTTACCCTTTAATGTAGGCTATTGACCAATTCACTGAATACTTCAGTTCAGtgattaattgttgttttttcttatacATTTAGATTTGAATGAGTCCACAATAATGTCTATTTTAGGTGTGCCCCGTCTGACCTTGATGTTTAGACAGCTAGAACATGTGTGTGGGGGTGATAAAGTAATTTTGCATGTGTTCATGAAGGCTCCAGGGGGTAGATTTGCATTCTCATGTGTGTCCTGACTCATATATGACTAGTCCTGGTACTCAACAATAATTAATACCACTTAGGGATACTGAACTTCATTACTTGTCCAATCAACCCCAATGTTTTTGCCCCCTTGATAGAGACAAGgattaaaagtaaacaaaattcAGTCAGATTCACATTGGGGACTGGAGATAACATCCCATTATCTTCACTGATCCTCTTACTGGTTTTAAATGAAGCCTCTCATTCAGTCTTCTTCCACAAAAACATTGTGCTAGAGTATCTGACAGAACCAGGAATGAAAGAGACAAGgggtcagattaaatcaaaactttgacccacccgctaatagcaaactacaaacctgtacatcataatggttacatttatgattagaagaaagtgacatcttactaaaaatgcagccgcaactgaatatagttctgtagttttctattagcgggtgggtcaatggcttgatttaatccggcccaaggTTAAAGCATTCCTTAAGACTCATATAATAGTCCAGCACATACTCAGGGGTTTACGCAGAGTTATTTCTCATTGCCCATAAGTTTTAGCAGAGTAAACCTTGATCTGAAGAGATGTGGCAGGTCACGATGCGTTAGGGCTAGTGTCTGTTGGCTTGGCCACAGGCTGCAAACATAGACTTTCACAAAGCAGTGGTGATGCAGGCAAAGTTACAGCAAGAGATAACTGTCTTTCCTTTTTAAGGTTCTAGATAtgcaaattcaaaatattttggtaTTAAGAGCCTTTGctgaaatgtctttttaaaatagttagcAGTTAACTAGTATTTGTGCTGTTGTGCAGATTTTCAGCTACATAAACTATTAAATATATCAGACTTGCTGATATGGAAGTGTAAATTGCCAATTTGTGACTGGTAATTGGGAACTAATCATTACTGTACCACATTCATTGGATATAAATGGCTAATTCTAGAACATTTTAATAGagtaaaaactggaaaagcATCGTGTTAATGGAAGTACTGTACTGTTGCTGATCTGGAACGTACTAATggtctgtgactgaagctccagACAAGTTTATAGGGTTGTAAAAAAATGACTGAAGCAAGACTGAGTTATATGGTTGTACATCATTCACAGTCAACAATGAACCGCACCCAATTTACAGCTACTGGaagtaaacaaagaaaatattgactcatttttattctcattgaatattattattcaccCCAAACACAAAATCTACCATACAGTGAACTAGACATCTGTTCAATTTAGATGACCCTTTTGTCTATCGTATGAGAAAAGGCGGTACAAATTTGCCattgctctttaaaaaaaatggtagaaagaaatacaaacctgattttattttctttcgctcttgaacagttttgcaccattgtatagttttgtctttctctgtcaGTCTCTATGATACCAAACCCCCTAGCTGCCTATTTGAATGCCTGTCTAGACTTGCCAGTATAATGGGGAAGGTCTGAATATgtgaggtttgttttttttgttagagGAATTCACCAAGGGAGTCAGTGTCGCAACCTGAGGAAATTACAGTAGGAGTGACATTTTGTGTCTCTGAGTTCTGGTACCTGGCTTACATTGATCTGCAATAACAACATCTGATCCGAAGGGGATATTATGTCCAGCATAAAGGGATGAGGATGACCATTTTGATCATTTGGTTATGGTAGGCCAATTGTATCTATGAAAGCATTATCTTTTATTCGTTTAGCTTTATCCTTAGATTAATGTAATGTCAGacacatatacattaatgtTAAGATTAATTGTGGATACTATTACACTACAATTACgcatttaaatgttgcttaAGAAATAAAGAGGAAGGTTGTTAATATCTTCCTGAATAGTGGTATGGGTTAACAGAACACATGAAATGgaattgtaaaatacagatCATAATTTGTGTTGAGAGAATTCTATTTCAGATAAATTATTTTGCTTCTGTATACTCAGATATTCCttcattcaaaaagaaaatgactgcaAAATAATGTCATCCTTATGGGAAAAAGGGCTATAATGTAGTAAAAATACAGAATGGACATGTATTGCATTAGTGGTAACTATATATCAAATatgtaagacatttaaaatgctattaATTGTAAACCCCacagatatttatattgttaatagTAACCACCAACATCAACACTATCATATGCATCCCTTCTCTCTTTCAACACTGAAATGTCGTGAGATGTAGGGCTCTGAATGTAGACGGGCctcatgtatgtatgtggttCCTTCTTCCTGCTGTGGTGTGTCTGCTTCAGCATCAGCATGAATAAAGCATATTACAATACGcaagagagagactgaggaaccAAAAAAATTGTACTACATGGGATTTGACGGAGTATTGGGGTAACCTTTTACCCTAACCATGTACTGTTTTGCTGAATCATTTGTTGGTGTGTGGGCTGCAGACACAGGCATTCACGTTTCACTTAAATGGCGAAACTAAGAATTCAACCTATAACTCATAGCATTAGAAATATGCAAACCAATGTCAAACCACTATAATACTGGCTATATGTATTCAGTGGAAACCAGTGTCTGCGACGAGGTTTACATTTTCAGGAACTAATAACCTAATGACATCATCAGTTCTTACGATAATAGTGATTGACAAAGTGCGAAtgcaatatacttttttttaaaaacaccagacacaaaatattgcacaatacaaactgaaaatgtatccatttcATTTGACAAATTATAAATTCACATCTAATTTCACTTCAAGGGGAAACCTTGCAGACATTTTAGGAAAAACTTGAAGATGATggaataatgtaaaaatgaacCAAATCACCAAACTAGATACTTTTTAATTGGAATAGTGTATGcacttttttcagattttcagcCATATAAACTCATATACACATAGAATACCTTCAGGTTGTTGCCCTGCTATAATCCTGCTAATTCTACTAATCTGTGCTTCTCTTTAGACTACGTactttattaataacaatagtCCATaaagtcccagatcgctacattATGCAcgttgaaaaaacaaatacattaataaataaatgtcctatgatgtttttttcatgcatttccacttttgtttattacaatacaattatttttgcaattgtgtATGGAATATCCTTGATACCAGTTCAAAACCATCATATGATTTCCTCGATGAGGCGCTGACAAGCAGGGCACAGGTAGGTCGCACGTCCTAACCGCTCGGCTCTCTGGTCCGGCGCACTGGGGCTGCACGGGTCTCACGCCTTGCTGCTCAAAACTGAGCGTTTTGACGTTTGACGTTTTGAAAACGGAAGAGTGCAACCGGTGTTCCGTATCATGATGTTTCATCTAGGGTcgggattaaattaatttaaaactaagaACTAGAAGCAGACGCATCTGCGCATGTCTGAGAATGGAAATCGCGCCGCTGAATATCGCGGTATTCAATCTGAGCATTTGCGCCGCAGAACCGCCGTCTCGCGGCTCGCTCTCGCACAGGCGCAGCTCGGGTTGGCAGGTCGCGGCTCTGTGTGCAGGGCGGGAACGAAACAcatgttgcctattgttcgtgcacagttagaaaatatgttgttattgaatgtcattttatatcaGTGGCGGCGCTGGACCCACGACAAAataatccaagaatgaagaagcaGCTCCGCAAAACACCGTCAGCTCCATCGATCCTAGACAGTGTTTCCTAGCCCCCTAAACCCTGAAGTCTCCAACCGCCCCTGTTTTACACTATGTTTTGTTCAGTACTGTGTCAGTGTTCCTTTGGGTTTTGCTTTTTTACGTATTTATTCGTAAAAGGTGTACAGTTTTACACGtaacagaaaggtgggctgtgttcctttccattttaaaatgagaaaatgcccTCACCAGTGGCTTATTGCAGACGGGTATATCCAACATAAGGGCAAAGGTAATGCCGGCCAGTATCCGTGTATATTAGGTTAGCAGACATTGTTGTTCAAATATATCAGCATTACAGCAGTTCACGAGTTGAGcttcactgtcactcacatccagatacagcCTAGAAACCCGTAAGTCTCCTTTCTTAGTGCATCTGTACCCTAGAAGCCCGTCCAGTAACGCACTCACTgcagattgaatgtgtatttaatgtgtatCTAACCTGTATCTAATGATTGCAATTTGTAATCGACATGCGGACatatcaggttttcaataaCTGATGCATCTCTGCATCGAGTGACGCTGCTGTCAAAGCGGCTGTAGcctaaacatacagtataattgcagttattcatatttacacgaataggtaaagcatggagacgtctggatgatatttatggcATGtgtacaggcatatatggttgcgTAGCTTGCAAAGCCAGCACGGTGCATGAGCtgtgtgcactgcacattgggtggattaaatcaataaaacacataatCCTTTAAAGGCACATTTGCGCAATGTAGCCGATACATTCAGGAttggaaacaaatgtaatcttagaaaaataagaactatctgaacagataatcttTTAGGAGCTGGTCAGAGTTTTGCCTTTATCCGCAGGCACACTATACGAAGTGGAGGTGATAGCTACacgttacattgacacacacacactgtacacgaAGCAGGCTCGGTGCGGTCGGGTcgcacacacagacggacatgTTACGAGCTGGACTGTAAGAGTACTCACACGGACACCGCTCCGCCCGGGACTCCAGCCGAGCAGCAGCTGAGCGCAGTCACACCCGCACAGCCGCGCACATTGACGCAGGCGCACATTGTGCTGCGGTGTGTTGACTTTGTGTGAGAATACCTATTAATTGCGCTCAAATGCACCTACAAAGCATAACAAAGGCCACTGTCCTTCCCCAGGTAAACCGACACGACGTCCATTGATTGCACTCTAGACAAAGCAGcagttAGAGAACCAATTATGCGTGGTGTGAAGACGGCAGACCTGCAAAGTCTTATCATAGTACTCTCAGCATGCATTGTGCACgGTTTCAGCGAGAGGGACTTCAACTTTACCGGAAACTGGAAGCACGGCAGCAACCCTCTGACTCTTCAGTTCAATGTGAGCACCGGCGGCGACACTCTCTACATCAGCACCAACGAGACAACTCTGACTGTCATTGCCACAATCTCGATGGTCTGCAAAAATGAGTCAAACATTGAACTTCACCCAAACCAGTCTACACAGACGTCTTTCAGTGTCACCTGGGATGGGTTTCTGGACTTGTTACAGGTTAAGTACGACAATTGGACATATACACTGTGTGCATCCCCTGGTTTACAACCCACCTGCTACACTGGCCTGACGGATAAAGGAGGCCCAAATCCTAGTACAGGTTTTGGCATTTTTAATGGAAGAATTCGTGGAGACCTTATAACAGAGAAACTTGTGGATTCTTATACGTTTCTTGGAGAATCTTCTAGTTGTGTGAAGGACTTATGTGAAGAGGCACGTAAAGTAACCGCGGAGAGATCAAACCGTGTTGATGTAATAGAGGAGACGCTGATGAGGGCAAATGTCAATGGCAGCGTGGACTTGCAGTGTGCAAAAGCTACAGTCCTGAACATAGAGGCAGGATTTAAAGGCTACAGCACCTCCATGTTTGCTCCGCGAGATGTGCCCTCCGCAAAGTCCCCTTCAGTCCGAATCCCCCCCACTCTGCTAGCTTCAAAAGCTAGAAGCTCTGCCAAAGTGATCATCACCTACTACAGAAACTTCAGTCTGTTCCAGGCCATGGACCATAGTGTGATTCTCAACCGTGAGGTCATGGGTATCACTGTGCAGAATGAGGTCATCACTGAGCTGCCAGACCCTGTTGCCATCACCTTTCACCACCAGGAGCCCTTGCTCCAACTGGAGCAGAAACCTGTTCGATACCTGACAGCCTTGACTTTCATCACGTCTCTGGGCTGTATGCTCTCTGCCATCAGCTGCATCTGCCTCCTGGTGCTCTTCACACGACAACGAAGAAATTCCAGCTCGGAGTGCACCCCTGTGCATTGTAACCTCACCGTGGCCCTGCTTCTGCTCAgcctctccttcttcttcaatGGGATTCTGGCCTCTCTGAAGGAGCCACACCTGTGCAGGTTTTTGGCTGTCCTACTGCATTACTCATTGCTCTGCTCCTTCATGTGGATGGGGAATGAGGCCTTCAATGCCTTCAGGCTGGTGTACAAACCGATGGCATCCTATATACCACACTACATTGCAAAACTCTGCCTTTTGGGCTATGGCTTACCGCTAATTGTGGTGGCCGTGGTTTTATTGAGTGGTAATTTCTACGGAGAGCTCCGCATCATATCGGAGGAAAACACGGAGGCCTCAATGTGCTGGATTACAGAAGACCTGGTGCACTACATTACAAACATCGGCGTCTTCTCAGTAATCTTCTTTTTCAATTTGGCCATGCTGGTGTGCTTGGTCATCAATATTCAGGACAGAGGGCCCTGGAAGGATAAGCACATTATGCTCATCAGCATCTGGGGAATGAACTGCTTGTTCGGGATCACATGGGGCCTGGCCTTCTTTAACTTCGGACCCTTGACCGTGCCTGTTCAGTTCTTGTTCTGCATCGTTAACTCCCTCCAGGGGTTTTTCCTTTGCCTGCGGTTCTACCTTTTCCAGCGCCGCTCCTCCTCCAACCAGAGTGGGTTCTCCGGGTCTGGATCAGAGCGATACTCTTTGCGTGGGAATCAGACTGGGGCCAACGCACACTTAGTGTCGCAGACACAATAGAGGGACACCGGAGGGAAGGACTTCAGAGACTGGGTCATGTCGCTCTTTGTCTGTGGCAGGGGCGGACACTCCTGTCCTGTCTCACGACTGAATCTCAGGGAAAGGCAGCAAACTATAAAACACAGGCCACTCACATGCTGTGCATCCGAAAAAAACAAGGGTTATCAATAACCGAATTGCTATTTAGAGACATGGTATTTGTGACCCTGTTTTGTGGATCTAATCTGAACTAGAAGCAAGCGCAAGAAGTCTGTTGCAGTGAATTATGGATCCCCTCACATGTGCAAAGAAAGACATGAAAGTGATGTGCTGCCGCAAATCAAACTGCGCTGTATTGTGCTTTTACCTGCCTGTGTTTGGAAATTGGACTTTATTTGAAAATTTGTGGCAACACTGCCACAATAAGTTATGCATTAAGCATTCCATCGATCTTTCAGAATTTGTATGGTAAATAAGAATATCCCTGCACATGAGAGTTTAAATCtgtgaattttatttatttatctgtttgaaTAGTCTCTGTATTTTGCCAGACagcccattaaaaaaaatcaaaaaaaacataaaaagtacaaGTGTCACCAGTAGGTGGCAGGAATCTCTTCAGCAGTGAGGAAAACTCCCTCTTGTTCCAAACTAAAGAGGACATGGACTTGGGCAATGTCACACCACTGGCACAATTTGGCCATTATTCTCGTTAATCCTGTACATACAGAGCACAACTGTTAAAgccaaacactgaaaataatgtatataaatacttttaaaagccCATGCTGTTTTCTATAGATTTGAGATTCAAAATTGTTTctctgttaaaaaatgtatagtttgttATACTAATGTGTATAATCATCAAGCATTACCCTCTATGGCTTTCCCCTTTTTTTGGGAAGCTATGTTGTAAAATTTAACTTCTCTATTGTTgtctctaaatgtatttatttaatctagatagtttattttttaataaagcctTTGTCATTGCTCG

Function


GO: NA

KEGG:

id description
K08450 ADGRG1, GPR56; adhesion G-protein coupled receptor G1

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00020423 True 9622 mRNA 0.41 12 18438204 18454657

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00020421 NA coding downstream 6949 18419182 ~ 18431255 (-)
AMCG00020424 NA coding downstream 22434 18398834 ~ 18415770 (-)
AMCG00020422 NA coding downstream 42908 18390806 ~ 18395296 (-)
AMCG00020416 NA coding downstream 104172 18314671 ~ 18334032 (-)
AMCG00020418 NA coding downstream 146599 18247657 ~ 18291605 (-)
AMCG00020434 NA coding upstream 420245 18874902 ~ 18901561 (-)
AMCG00020433 NA coding upstream 454321 18908978 ~ 18915511 (-)
AMCG00020437 NA coding upstream 860138 19314795 ~ 19316145 (-)
AMCG00020435 LOC107556245,LOC106562015 coding upstream 868738 19323395 ~ 19438437 (-)
AMCG00020440 NA coding upstream 1098301 19552958 ~ 19570840 (-)
G63096 NA non-coding downstream 1265 18436525 ~ 18436939 (-)
G63092 NA non-coding downstream 39473 18397467 ~ 18398731 (-)
G63057 NA non-coding downstream 79294 18357825 ~ 18358910 (-)
G63015 NA non-coding downstream 252154 18184008 ~ 18186050 (-)
G62981 NA non-coding downstream 299906 18137480 ~ 18138298 (-)
G63180 NA non-coding upstream 622820 19077477 ~ 19077758 (-)
G63257 NA non-coding upstream 1179637 19634294 ~ 19636243 (-)
G63346 NA non-coding upstream 1801265 20255922 ~ 20256399 (-)
G63447 NA non-coding upstream 2628605 21083262 ~ 21083461 (-)
G63628 NA non-coding upstream 3927707 22382364 ~ 22384918 (-)
G62961 NA other downstream 398244 18006168 ~ 18039960 (-)
AMCG00020403 NA other downstream 422342 17987181 ~ 18015862 (-)
G62853 necab2 other downstream 812015 17610664 ~ 17626189 (-)
AMCG00020346 nup93,LOC103368977 other downstream 1620437 16794996 ~ 16817767 (-)
G62618 NA other downstream 1645037 16792866 ~ 16793167 (-)
AMCG00020446 cssa11h16orf87,cunh16orf87,clg02h16orf87,zgc:92818,LOC106587296,LOC103043940,LOC107757775 other upstream 1833913 20288570 ~ 20299843 (-)
G63464 NA other upstream 2857545 21312202 ~ 21312605 (-)
AMCG00020471 NA other upstream 3676185 22130842 ~ 22132737 (-)
AMCG00020489 rnf166,LOC106587267,LOC106562062,LOC107685853 other upstream 3986135 22440792 ~ 22466767 (-)
G63679 NA other upstream 4089185 22543842 ~ 22544689 (-)

Expression



Co-expression Network