G64912


Basic Information

Item Value
gene id G64912
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030127.1
NCBI id CM030127.1
chromosome length 42978078
location 28996392 ~ 29001633 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU81187
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>TU81188
ttttttttttttttttataaattgggTGAACTGTCAGTGCCGAATTACAGCATTTTCATACGGCAACAAGTCTGTGCCATTCAATGCCAAAATCATTCACTAGGAAACCACACAGGATTGTACTTACTTTTTGTTGCCCTGTAACCATCCCTTTACCTCCTATATCGACAAAACCCAGTCGCCCTCATTGCTCCAGTCGCACACGAACATTAGACGGCGGATCCTGATGTCTTGGCCTATCATTTTAGTTGACCTAATCATTTGCTGGCTTCTTGTTCTACTAATTGTGTGGATATTGATGCACCTAGTAGAAAAGGTCTTAACCCAGACTGCCCAATCCAGAGTCACTGTTGAAACGTTGTAGACGTAGGCAGCCCAGCTAGAGACAGCTCTCCAAACCCAGTCCACCAAAGATCAAGTGTCTGACCACAGATTCAATTTCTTGCATCCCCTTTATTTGCTGCTTACAAAACTACTGAATTAAAAGAGGACAACTGACTGCAGTTTGTGCAAGGGAACTAATGGGATGAATTCTGACCCACTCCAAAGACCACTGATAGGGGCTTCCCTGTAAATAACTGTTATAGGTTGACCTCTTTAGTCTAGGCAGCACTATTTCCAATCTGGACCATGTTATAGCAACTAGATTGCTTGGGAGTGCACATTTTGCAGGACACACGTGTGTGTTAGCTATATACATCCTTCATGCATTGCTATTGGGGTCAGCTATTGCTATTTGCTGCATTGAGTGACAATAGGCAATTCAAAATTGGAtgagtgttaaataaaaaaaattagattttcttaaaaaaaaaaaaaagaaaatacaacaagcAAACGCATCCACTGATTAGAATGGGGTTGATTTCTCAGGAGAAAACGTCtgccaatttgttttttgtgaacgAAGACCTGGTTAGTTTATTTCTGTCAGTCCATTTTACAGGTCTGTATGTCTCACGGGACACATTTAACCCCTTTTGTGACCTCAGGGAGGAATTGTACAGGAAAAGCACTGATACATGTTGGAAGCCTGAACTTTAGAAATAGAATACTTGAGGCTTTGAAGGTAGTGAGTTAATTCCagagtgtaaaataaaatactcatAAAAAGGAGATGGAGAAGCTAATTAGATAATATTTTTCTACACATATGACCTTGCCTTGATTCTAATGTGAAAGAGGAATCCGGCCTTTAGTGGGAAAGAGGTTATGGGAAACACAGGGATTTTGTCTTGTCATCATAATGAATCTTTGACAATATTttgacaaatatttaattttgtaattcatTTCTTCCCCATTCTGTAACCATTCTGTCGCTTGACCTTTGGGAGTAGTTGTTTGTTGTCAAGACTCAGCTGTATGTTGCCAAATCATAGTTGCCTGATGTTTAATGGCCTTTTTTTGAGGAGACAGTGTCTTAACGGCAATTTTCTTgccttttaaagagaaaaagcaaTTGGATCACTGAGGTTAAATCACTGCTCAGCTACATCACTTGTAGGTTCACTTGCTGTAGTGTAAAACCAAAAGTTATAAGACATCCTATAAAAGTTAGCATGTATTTTGGAAGGCTTATTCTTGCAATGGTTTGTTGGAAGCAATCACTGCCTAAAACTGCCTGTTTATTTGCTGTACAGTAGACgacagtatatataaatacattaatatgaatgaCTATAGAATATAAGCCTAATTTAACAATCAGGTATATGAGACAATAGGGAACTGTTATTTTACactctgatttgtttttatggttttgttatacaccTGTTCTTGTAGAAAAGGTGTTTGTTAAAGAAAAGGGAAGTGATACACATCTTCAGTTGTTTAGCAGCACAAATGGCCATCGGTGACCGAAGACTGCTCACAAGCTGCATATGGAAATCATGAAGTGGCAAGGAAAATAGatgaacatttcattttatatagcCGCAGTTACATATCAAAAATATGTGCACCCTTCACTTTCCCTCGAAATATTAGATGTGTAATGTTTTCAGATGCTTGTGAATCGGTGGGCGCTCTGCTTCATTTTCACAATTCATTAAATGTATCAGAGCTGGGGGGTGGGCAGGGACTGAGATGTCCTTACTAATATTAAGATTGTcgtatttgtttgcttttatttttcattaatcttATTAAGAataagattaagaaaaaaaaaacgtaattaaATACTGCTCACTAGACCTTTAATACGCCCCTTTAATGATGATCAAAAGCAACTGAAGGATTACCAGGGAATGTTTCATGTGTCTTGGGAAATGTCCAAATGGGTTTGGTAAAATCCTTCCTTTCCAAAActgcataaaacatttactgaGCTAATTAACCTTTGCTCACCACAATTTTGAATTTGCCCACACAAGCTTGCAGACTCCCCTGATGACATGaactgcaatttatttattaacccaAGGGTCCTGATGAACTCTTTCCCAGATCCAGCCCTGGTTATGTCATTGACATCCTCAAAGGGAATGATTTTGTTACCCACCTGGATTTCAACTGTAAAACTGTGTGTGGTTTGGCTCACAGGagctttgaaaatgtctttctttgtaGCTTAACCCCTTTAAGTTGCATCAGGAGTAAACCCTTACAGCAACAATACATCAGAAAGTGATCTTGTGCCAAGTGTTGCTTTTGAATAGACAGACGAGTTCTGTAAATGTCCAGACAAGACATGCATTGTATTAAGCTTCCATCAGGGCTTATATTTTAGAGATGTTCCATCAGTTTCAAGATAGtcagtataatttgttttcctattatttaACCTATTGTTGTCATCATCTGCACTGTTAGACATTGTTCTTTCTGGTGCACGGGTCTCCAGGAAGTCTGTGAGGGAGGAATATGAATGTAACACCACCCTGAAAAGCTCATAGGAGAAGAAGTGTAACACTTTtagctgaaaatgtaattgacttTTATTTATATCGCTCATCAAACTACACTCATttaccaattatttattttcagatttaattagcAATATCAATTTGACTAAATGAAGTGgtgaataataaacagaaatagGAGGGAATGCACTAGGATGAGGAAAGTATCCCTCAAGGATGGAAGCTGGTGGTGTTGTAGACGCATCTTGTTATGCAGGGCACTGTGTGCAACTTTGCTGTAGCAAGTCCTCTGAAATGTGTGGCAGCTTCCAGATAGCTAGTCATATGATGGAGCCCTCAGTGACAGTGGTACTGTACCTTTAAAGCTTCAGTtggatttatttgaattaattacagTTCAGAGAGGATCTGCTTTGGTTTTCTGTTATGTGGGCCATAGTTATGGAGCCTAGCAaacatatgtttaaatattaaacagcatctctctctctctctctctcatctccacTGTAGATGACCACGGTGCTGTATTTTCTTgctgttgaaaatatatgttgtGAAACACTGCTCCCGTGTggtcatatttaaatacaatatgggTTCTGTACAGTTCATATAGGAGagtgttgattttcttttgtacaTTTGTTAATCTTTACTTATTTACCATCAGGAGTGCtgatattacaataataatattgcatgCCCACAAACATGgcttatttaaatttttattcACACTAAACAGAGCTTGAGGTTTTAATATGTCACATACATGGATCTATCACTCAGCTGAAGCAGTCAGTTATTTTCTGCATTTGGGATACCATGAATTTATATTCCCTTTAGATTAGACTTCCTGTCCATAAAATGCTGCCTACAGTAACTGCAGTACTGTGATAATTGTGCTCAGGCCCAGAGTTCTGCTACCTGGGTCTAAATCTGTGTATAAACTGAGTGAAAATAGTGTGTAACAACCTATTTCCTTCAGATGTAATATTTTATAGCTGGGTCAAGTACTGGAAGACATATAAAACAAGGGGGTTGTGCAATTTACAAGGTCTCTCAAATGGTTCCATAAAGAAAAAGCAGACACTGTTGCCTGCTGAATGTAAAATGATACACAAGGCagttctgcattttcttttttttttaaatatatatattttttgtttcttgctgGTTCTTTTAATAGTGGCACCTTTGTAATTAACGCTGTCTTGATTTCTGTCAATTAAAGGGacaccctccccaccccctgctTACTTTCCTGAACTAGATGTTGCTTAGATTAGTTTTGTGTGGGGTGTTTGTGCCTACGCACATTATGGCCACTCGCCCCTGTAGTGACAGTGAAGCAGCCGAGACCGGGTCTTGAGTTCTACGCCGTTTCTGTACTACTAGTCTCTTAAGCACTGTTACTGTGATCTACCTGTGCTTGATTTTAGACACGTTTTCCTTTCAGCTGTATGGAAGTATTGTCACACAGTCAACGCGTCTCAGTTTGTGGTTCTAACGCAGTCATTCAGTCATCTGAAGTGTGCAGTCTGGTCAGCTACAGTCAGGCAGCTACAATGGTGCTGAGTTTTCCTTTGGCAGGCTATTTGTCCTGCATCACATCATTCTCAATGTTAATTTGCTTTGGGACAACCATCAGTGATTTAAATTCAACATTAACAGATGAAACAACACTTACATCACTTTGACAGGGACTGAGACTGAGATACAGAAAATGTTGACTTAACTCCAGCTGAAATTAAGCCAGCTGAAATTTCATAACTGTTACCCTGTTCTTCCCAAATGGCCTTATAGATGGGATTTATGTATGTgtctacatatatatgtatgtatgtatatgtatatatatatatctcacaGTGGGGCATTAATATCTCAGTGCCTCACAATGTGCTCTACAGATTTCAGCAACATTCCAGTCAATTATCATTACAGCAGCTGCTAACATTGACTACATTGTGCTCAtctgttgttttatatttgtttttaacattaaataattgtatgcatttcttaagggaaaaaaaaaatgctgcattgACCAACAGAAAATGCACAGCATCGTCAAATCGATTTCTCTCTGTATCGTACAGTGTGTTTGCCTCT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>TU81189
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Function

GO:

id name namespace
GO:0048731 system development biological_process
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GO:0009653 anatomical structure morphogenesis biological_process
GO:0048856 anatomical structure development biological_process
GO:0032501 multicellular organismal process biological_process
GO:0032502 developmental process biological_process

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU81187 False 3116 lncRNA 0.38 1 28996417 28999532
TU81188 True 5242 lncRNA 0.38 1 28996392 29001633
TU81189 False 3141 lncRNA 0.38 1 28996392 28999532

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00020669 cebpg coding downstream 191718 28804201 ~ 28804674 (-)
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AMCG00020659 gpib,LOC108428767,LOC100196524,LOC103130839 coding downstream 731201 28250873 ~ 28265191 (-)
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AMCG00020678 zgc:165481,LOC107657136,LOC107696720,LOC107554618,LOC107551474,LOC108432404 coding upstream 219047 29220680 ~ 29221402 (-)
G64886 NA non-coding downstream 138038 28857989 ~ 28858354 (-)
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G64632 NA non-coding downstream 2250569 26745549 ~ 26745823 (-)
G64991 LOC103376870 non-coding upstream 257924 29259557 ~ 29314059 (-)
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G65035 wwox,LOC107555694,LOC107742620,LOC107669551 non-coding upstream 1125056 30126689 ~ 30390868 (-)
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G64811 NA other downstream 766745 28226535 ~ 28229647 (-)
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G65000 NA other upstream 379682 29381315 ~ 29405636 (-)
AMCG00020685 bat1,slc7a9,LOC106592435,LOC102305828,LOC106596152 other upstream 518558 29520191 ~ 29533117 (-)
AMCG00020694 wwox other upstream 1448112 30449745 ~ 30531136 (-)
AMCG00020700 NA other upstream 1721150 30722783 ~ 30737976 (-)
AMCG00020702 NA other upstream 1798949 30800582 ~ 30808846 (-)

Expression


Co-expression Network