G84495


Basic Information

Item Value
gene id G84495
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030130.1
NCBI id CM030130.1
chromosome length 39556810
location 10006111 ~ 10009690 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU105424
ttttttcccttactgtaaatatttatatatatttataatattctCTTACAGCTACATATACATACTCTTAAATCTGAATTCTAAATACTATTCCGTGAAAAAACATTACCTCTCAAATAGCACAATCTCATTCACTCAAACTAATTCAtgaatttttttattatttttattgtgatcCTGGACACGcccagttaaaaaatatataaacttgaAATAAACATCTCATGATGTTGAAGGGCTcttaatattctttaaaaaaatgtatcttattttattgttttttggagGAGAAGCCTCCCCTCTCaagtatgttttattgtttttttatggtaaATTATAAAAGGAAAACCATTCTCCCTGAGGGGTTCTACTGATAAAAATATATGagaggaattaaattaaaaggctGTGGTAGAAACTTGTAATGTCTCATTGTcttattaaaagacaaaatcaatagatatttacttaattttgtattgtttggttTATCTTTTACAGCTGTGCCAATAGCAGCCTAGTCCATTCAATGTTAGAGTTAATGTGACTGAAATTGCCATTAGTAATCCACATGTTGCGTATGTCACTTGTGAGCTGTATGTCACAGTGctttcatatttgtataataatttaaaagcctTAATGACTTATTTTCTATGAACATCCATTACTTGAATTCCATACATTATGAAGATTTTCACATACAGCTTCCATTTAGGTCAAATAATGAGCAGCACGGTTTAAGAGCAAGTATAAAATTAGGATTGCATTTAATATCAgacattttatactgttttttaaataggcaaaggtttgttttgtttaatatgtggCTATTTGTCCTTAGAATATGTTTCTGAGCTCATTTTTTTAGCATTGCTTCATCCTGGCATGCTGTCAAATCAAGATCAGACATGTAGGGAAAAATGCATCGGAGCAATCTAAGGCAGTGTTTCTCAGTTCAGCTCGGCAAGGCGTGTCACCTATGGCTTATTGCATATTTCAGCACTGGTGAAGAGAGAAAGCATTGAAATATACGGGAAGTAAAGGGCCCAGCTCTCATTTCCCTGACATTACCACTGTGCTTAGTGTAACCTCAAACACTGAATATATCAATATAACCTTTGTTATAGATGCCAAACTACATGACAACGTGACAAGCGGATAATGCGTCCCATTGTGATGTAGGGATGCcctgtcttttttaattttctagCTGTGCATCAACCCACAAATGGGAAAACAGCTTCACTTGTCATGGTATTGTAATGCcccatattatttatttattggtattcACCCGTTTTGCTACTGTTAATCGTTAATCGATGGTGCACGTTTCTACTCATGAATCAGTCAGCTTAACCTTTAATTCAGATACCTTCTCCACACTTGAAATCAGCTAAAATTTCAGCCTAGGCAGTGGACCTTTCATCTTTGTTAGTTAATTACCGCCGCTGTATTGTTATGGTATAAATaagtctgttttccttttctgttaaGTAAGAACAAATGGGTTCTATTCCAGTAAAGAATggcatttcattgtatttttattctctACATCTTTTCTAGGCAAGTCGATAGCGTCCTTTCCTTTTGTTGCCCCATGTGAGGAACAGTTTGTTGCTTTGTGCTGAAATTGTGTGTGAGGAATATGGAAATGGAGTTGTCGTGGTTAATTTTCCTTGTGGGAGTGTATTCAAAGTACCAAATGCAACTTTATCTGTCACTCAGGATTCATTACCATCAGAGCTATAATAGGTAATGGTAAATGCAGAATTGTTTTCTACTAGATATaggcattctttcttttttatttcagggCCTTACCTTAGCTTACTGACAGATGTGCCTTATACTTCGTTTTCAATAAGCCACAATATCTAATGTTActactgaaaaatgtgtttagtgaTTTAAGTAATGAAACAATATTGTGCATGTATGCCTAATTGTGGATTATAACCAAGGCTATGAAATAATTTGGGTATTCTTAAACAATCCTCATTGGTGTGCCAATTCATTGTCCCAATCTATCAAGAAAGGACTAtattatgtgtgtttattttattttatttccctaggtaacatctctcgctctcttatTAATGACCAGTgccaaatcaaacacaaaaatcattaGAGTAATCACAATCTTTAGGTAATTAATaccattcaaaatatatttctgcagTTAAAATTCAAGTTATTTAGGTAATCGGTCCATCCTAATATAcaacaaaacttaaaacattCCAAAAATATGAACTCTCAGTCTTTGATTAATAAACACCAGTTTCCCATGAGTATGAaccaatattataattttttcttcattagtagttctttttgttttctatgttAGGGTATTAAAAGAGTTGCACACAAGgagaataaaaatgtactaGATTTGCATTAAGCATGACTTACTTTTGCTTTTTACAGGACAtgctttaatttttattttccagtttaattATTACCAgttcacagtactgtatattgaaCACTGGTTTATTTGTATAGGAAATcttatttcagtttgaatgataaaaaataacactACCTTAAAGACTACTAATATGTTGGCATTAGAATGTTTTACATGCATTatcttatgtgtatttattttccaagaagAAAGTTTGGGATTTTTCAGAGTTCTTTAGTTCCGGTTGTttcaaactgaataataattattataattcttcATTCTGAATTCATTTTTATGAATGAATTACTTGTTTTCATTACCTGTTCCCTAGAAATTGGCTCAATTCCTCATGTAGTCACTCCCCTAAAGAGGATGAGAAGGGATGATCTAACTCTTGCAAGATCAAATTTTATTCACTCTGAGTAGACCTTAGGTACTGATGGCCAACTGAACTTTGCAGTTGAATTATTTGACCCCACTCCAGTTTGTTTCATTATATCTAGGACTGaactataatttaaattaatgtcttaATCTGAGATAATGGATTCAGATCTGGAACTGGTTTTGTGTTCTTTTACTGAAGGATTAAATGAATAACCCCTGTCTTGCAAGTCCTGATAGCTAAAcaattgttttctaatatttcaAGTAACCCTACTCTTCTGTGTTCTCAACATCTTAAGAAACAGTTGTCGCATTCACTTGTCATTCTGTTGTATCGTGTAGacttctgtatttttaagaGTGTACTGACTGTTACTGTGATCAATGAAATAAGCTGCGATCCTTGTACTTGTATATATCACTGACATGCCTTTTTTGGTAAAATACATAGACATTCCACTCCTTTTCACCTCACTAAACAAATGTGCTCTGTAAAACTGTGCCAGTTTTTCTACACcctcttgtaaaaaaaaaaaaaaaaagtttcttatCAGTTCTTCAGCTGTTAATTTGAGCTTCCAAATGTAAATTTCCCTTTACAAAAAGACTTCAaatgtctgtgtatataattgttttgtataaaaaaaaatgcatgccaagaaaacatttgaCCAAACCTGAGACCATGTATATATCCTCTGTATAAATTGTAGGatgtttcttaaaatgtttcatgGATTAAAAGAACAAAGTGGT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU105424 True 3580 lncRNA 0.32 1 10006111 10009690

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00021225 lrch2 coding upstream 2109 9975043 ~ 10004002 (+)
AMCG00021226 lrch2 coding upstream 58628 9947160 ~ 9947483 (+)
AMCG00021219 NA coding upstream 176368 9714537 ~ 9829743 (+)
AMCG00021217 NA coding upstream 376470 9626560 ~ 9629641 (+)
AMCG00021218 klhl13 coding upstream 392977 9603592 ~ 9613134 (+)
AMCG00021224 NA coding downstream 6830 10016520 ~ 10029583 (+)
AMCG00021229 NA coding downstream 34491 10044181 ~ 10044720 (+)
AMCG00021227 NA coding downstream 57538 10067228 ~ 10078775 (+)
AMCG00021233 upp,uprt,LOC105023903 coding downstream 264799 10274489 ~ 10279151 (+)
AMCG00021232 fgf16 coding downstream 334439 10344129 ~ 10355983 (+)
G84477 LOC108440084,LOC106603334,LOC103024645,LOC105026974 non-coding upstream 127244 9864686 ~ 9878867 (+)
G84298 NA non-coding upstream 1417148 8587598 ~ 8588963 (+)
G84276 NA non-coding upstream 1447693 8555961 ~ 8558418 (+)
G84244 NA non-coding upstream 1630073 8375331 ~ 8376038 (+)
G84196 NA non-coding upstream 1798733 8201838 ~ 8207378 (+)
G84535 NA non-coding downstream 215393 10225083 ~ 10225298 (+)
G84536 NA non-coding downstream 218215 10227905 ~ 10262453 (+)
G84549 NA non-coding downstream 270298 10279988 ~ 10361508 (+)
G84627 NA non-coding downstream 625706 10635396 ~ 10636269 (+)
G84662 NA non-coding downstream 1026891 11036581 ~ 11036826 (+)
G84425 NA other upstream 582692 9416267 ~ 9423419 (+)
G84301 NA other upstream 1372701 8631727 ~ 8633410 (+)
AMCG00021180 NA other upstream 1962812 8040170 ~ 8043299 (+)
AMCG00021150 fundc2,LOC106603170,LOC107661711 other upstream 2884874 7111997 ~ 7121237 (+)
AMCG00021133 NA other upstream 3459510 6544234 ~ 6546601 (+)
AMCG00021240 LOC107742636 other downstream 460373 10470063 ~ 10719327 (+)
G84657 slitrk2,LOC106611993,LOC106604961,LOC107688026,LOC107588360 other downstream 953458 10963148 ~ 10987174 (+)
G84749 NA other downstream 2065655 12075345 ~ 12100707 (+)
AMCG00021267 timm8a,LOC107593201 other downstream 3425617 13435307 ~ 13437408 (+)
AMCG00021296 NA other downstream 4006443 14016133 ~ 14033557 (+)

Expression


Co-expression Network