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Basic Information

Item Value
gene id LOC122351623
gene name raph1,LOC107592998,LOC107668371,LOC107752894,LOC107738113,LOC107688760,LOC107738116,LOC107596536
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056707.1
NCBI id CM032076.1
chromosome length 26426558
location 8014449 ~ 8024672 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU101496
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>XM_043248835.1
GTGAACTATTAATTTTACCTCaacgaaaataaaaatttatttaagcAGAAAGTGGTTTAGCGGACACATCTCACGGGCACAGACAACTCACGCGCACCCATCAACAGTAGTCTAAAATTCAAATGTGAATTTCTTATCGATGGACTTTGAAAAGCTTATTTTGCGCTATTATTGAACCTGTGTTATGTGATAATGTGTTGGaaaaccaaatatttttttttagtttttaatacgTGATTAACTGTGCTTGAATAAGCCACGAGCGGCTTAAAGTGCTTGTCCAatttttgagttaaaaaaaaagagaaaagggtaaaataaaactgtagttTAAGAATGACTTGTACTGTTCTGTGAATAGTGACTTTCCGGGAACCGTGTCACTACGTCACAGAAAAtggcgcccgaacagggacttttTGAACTTAACGCTTGGAACTTTGGGAACCTGAAACAATgtgtaaatgttgttgttgttttatacaaatgttcttttgtttgttaCTGCCCTTAATGAATTCAACGTACTGACAGCAAAGTGTTACCAGGTAATCTTGTGAACTATAagtgcacaaaaatattgttgaaGCTTTGATAtttatcatcagcatagcagtgaaagcaaacaccatgtctcctgataatatcttcCAGAGGTAACCTGTATacgttgaaaagtaacggtcctagcactgagccttgaggaactccatatttcacttgtgagcagTGTGATACCTCCTCAAAgctacaaactgatagtggtcagatagatatgatttgaaccatgctaaggtgcttcctctaatgccaacatagttttctagtctatcctagagaatgttgtgatcggtagtatcgaatgctgcactaataacgagataaaaccacaatccgatgcaggtcattagtaactttAATGAGAGCAGTCTTAGTACTATGGTACAGTCTTAATTCTGATTgaaaatcctcacagatacattttttttctttttttctaaaaatgaatttagTTGTGAgaatactaccttttctagtatccttgacagtaaattacagaccagatctctaatctcccttttctaaGTCTTTGGgttcaagatgtggtttcttaataagaggcttaactacagccagttttgaaggttttgggaacatatcctaatgacaattaATAATGAGGATATTATAAACTGCAGCAACACctacctccccctttaccttttaaacgtggctcatttttatagcagtaattttggggggtagattaatgtattcatctggttttagccaggttttggtcaaacagagcaaatctaggttctgatctttggtcaaatcatttatatgaaGTGTTTTAGTGGAAAGGgatctaatattcagcaagccaagttttatcatttgctttataggtagtttttatttgttgaacattaaattattgcttttaagtCGTTTTGGACGTTCTCTTtgtattctaattcggggaacaggcacaatctctatagtgtgatatctaggtgaaagagtctctgtGTCTTCTTCCATATTTTCTCCTGTGAATGCTGTTGCTGTCAAGAGTGACCATCTCAAACTAACCTTTCCTACTTTTGGAAGACCATCAGATGATTCTGATCCTCTGCTGTGTGTAACTAAGTGTAAGGATTGTGTCCTTACTTACCCACTGTCTGATCCTGAAATTCTAGCTTCCTTTAGAACAGTCCTGCATGGCACTGCCCGTGATTGGTGGGAAGTAGCCAGAACTATGATCAATACTTTGAGTCTTCATTCCTCACTGCTTTTCTTTCTGAAGACTGAGGATGAACTAGCCAAACGATTCGGAATCAGAACTCAAGGTGAAAAAGAATCTGTAAGAGACTTTGCCTTTAGTTATAGAGCACTTTGTAAAAGATGGAAACCTACCCTAACGGATCCAGAATTAGTCAAAATGATCCTGAAAAACGTAAAGCCTTACTTGGCTGGCCAACTGCGTGGTCGGGTGTCCACGGTGGAAGAATTGGTACGACTGGGACAACTGCTTGAGAAGGATCATCTACAACAGTTGCAGTATGATTACCGGTTGAGCCTAAAGCATAACCAATCTGCGTTTAAAGGTCCCAATGTTATCAGACTTGCAGAAAAACCCCAAGTTCAATGCTGGAAGTGTAAAGGCCATCATTTTCCTGGTAATTGCCCACAGTTTACCTTGATCTCACTGTCCGTTTCACCACGATCCCCCAACATGCTACTAAAATGCAACCAACCTTTCCTTTGAAATCCAGAGGTAGACCCACTAACAACTACTGAAACATTATATGAGAAAACAAACTCCACATATGGTTTGAAATCAATTAATTGCACCAGTCAGCATTGGTACCGGTAAAGCCATCGTTGACACAGGGGCAAGTTATACCCTAATTCATGAATGCTTATAGAGAGACTTTGATCTCTCAGAACCAAACCTTAGACGTTGGACTCTTGGACCATTATATCTGACCAATGGAAAGGCTGAAGGACCTCTGGGTTGGTTGAATGTTTCGCATTACATGATCAAATTTGGCCCTTACCTGTTGCTGTACTGACAACTAAAGCTCTTGCTTATGGTATTGTTTTAGGTCTagactttttttgtgaaatgcaaataaagatGTCTGAGGCAAAGCATTCATTTACCTCTGACACTGATGTGGATTACTTCTTTCAGCCTGGTCATGCCAGTGTGCCAACACCATTAAAGATTCAGTGTCCCCAAAATGGAAGCACTGTACATCAGTCCACCCTAAGTATTTCCTTAAGTTCTGTCCCACTTTTAGTGTTACCGTTATCCTTATCCTTATCCTTAGACAATAGTGAAAGAGAGGATGATGCAACATTCATCAATCAAGCAGTGGTAGTTTAAGAATGACTTGTAGTGTTCTGTGAATTATGACTTTCTAGGAACAGTGTCACTAGGTCACAGCATGGAGACTCTTGATGCACTGACTCCAGCTTTATTCACTCCTTGTGAAGCTGCTTGTGATTTATTCTTAAACTTGCGGTCATCCCTGTTACTGAACACCTTTTCCTACCCAATTTCTTCCTTCCAGtaaactttgcatttaatatgcttagatacagcactctgtgaacagccagtcCTTTCAGAGATGACCGTTTGTGATTTAACCTCTTTGTGGATGGTGTGAGTGATTGTCTACTGATCCATTGCCGAGTCATCCGTCTCCCTCATTATTGTTGCATCAAAGAACAAGAGATACATGGAACTTCTATTGTAGAGATGGTAAttttaatgacttaaatataaatgttctaatattttgagatgcTGGATTTGAAAGCTGTAAactatcaaaattaaaacaagtcacatgttttactttacaagtaatgaatctaaaatatgaaagttttactttttttacatttttgagatgTACCTGTATATCCAATGATTcagtttcagtgtgtttcaaatCATGATAATGTTCCTATTAATAGGCATATTTTATGCTAAGTAAACAAACCCACATTAGGTCAGCAATAGGCTgctacactttaaaaaaaaggttacaggACAAAAGGATTCATCGCTGATAACAGATTGTTGTGGcaggcatgttttatttaacctAATATGCAACATACAATAGGGTGACCATAAGGTCCATTTTCCCAGAATGggtcctggccaggatttctatattgcttaaaatataattttgtttgctttatggATTTCAACCTGacgtttttaattttcttcatcAGAGCAGATCTGAAGAAAAGTAGCGTTAGCCACTTGCTCACCATAGGATCCTCTGCAATGAATAGGTGCTGTCAGAATGGTAATCCACCATTAATCCACAAAATTAACCTGTCCAAAATTAACATGTCATACACATGCAATACTTTTGTGGCAGGTTAACGTGACAAATTGCCTTATATAAAGTATTGCAACTGAAGCAGTGTACTGGgactttttaacaaaaaataacaaaataggcATGTGCACAAATACAGAAATTGACATTAAATCCACTGTGAAAAATCAACGGAATAAAAGCATGACAACCACCCCAGTCTTGTGGCCCCCTTCAGCTGCTCAAACATATCATATGACTACCACTAtacggataaaaaaaaaaacgcatttacAAGTTAAGGACAAACAGATTATGTAGAAAATTAAGGGCAACTAATGATAAATGCATGacacaatgttttttaaaaaatgtttaatgtacaTAACTTTGCACAAGCCATGTTGACATTTCAAAAGCCACATATATGCAGCCATTGTGAAATAATCATCCAGCATTTCCAGACCACAATGTCTTCAGGTTTTATGAAAAGCTCAATTAAATCTGCAAAGCATTTACTTTGTGGTTAAAGCCAAGGCAGGGCTTGTAACATCGCATCTCTGGAAGATTGTTTACTGAGTACTGCAGtgaagaaaaatacattcaCGTAGAAAGATCAGTAGAAGTGAGTTAAGAAACGGAGATCAAGAAAAAAGATGACACCAGCCTACATTTTGCTGCTCTTTCAGTGCTGCTGTGTCTCGGGGCAGCTTGTATTAAGATATAACTTCAGTCCTCTGGCTAACCTGGCACTGAAGGTTTCTGTTGATGAAGTCAACAGGCAGTCCAACAGTTTCAACCTTCACAGGCCAACCAACAGTGTCGTCCAAcagATCACACTGGGACGTGATAACAGATATGATATCCTGCTTGATTTTGGAACAAAGGAGACAGTCTGTCTGAAATATACCAGAAGCCCTTACAGGAACGGTTGCCGTTTCAAACAGGGACATCTTGCGTCAAAGAAATCGTGCTCCAGTCTTGTGCGTGTTGGCAGCACATCTGTAGCTCCTCTGAGCATCAGTTGTACGGCTGAAACAGCTGCTTTTGGGTCCAGCTCAGAGTCCAGCAGCGAAGAGATCATTATCCAACAGACAGGACGGGTTCCTCTGGGATTTTTGTCTTCAGGAGTCGTTCTGT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Function

symbol description
raph1 Predicted to be involved in signal transduction. Predicted to act upstream of or within axon extension. Located in cytosol; nuclear body; and plasma membrane.

NR:

description
PREDICTED: secreted phosphoprotein 24-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU101496 False 3314 TUCP 0.47 2 8014449 8018105
XM_043248835.1 True 6756 mRNA 0.38 4 8016761 8024672

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G68554 nrp2b,LOC107596550,LOC107716756,LOC107688751,LOC107593002,LOC107752901 non-coding downstream 192560 7820008 ~ 7821889 (-)
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LOC122351350 cb064,LOC107688735,LOC107716767,LOC107676512,LOC108232354,LOC103042106,LOC105927538 other downstream 860495 7070985 ~ 7153954 (-)
G68188 irs2b,LOC107715923,LOC107688717,LOC107559513,LOC107557930,LOC107721603,LOC107702923 other downstream 1753380 6246900 ~ 6261069 (-)
LOC122351979 NA other downstream 1914537 6099071 ~ 6099912 (-)
G68124 dip2a,LOC107549743,LOC107752588,LOC107720936 other downstream 1970524 6043275 ~ 6043925 (-)
LOC122351463 LOC107689507,LOC107549921,LOC107670332,LOC107752589,LOC107549740 other downstream 2083313 5912855 ~ 5931136 (-)
als2a als2a,LOC107688763,LOC107596546,LOC107668398,LOC107752891,LOC107592992,LOC107738114 other upstream 51796 8076468 ~ 8094847 (-)
LOC122351483 LOC107663814,LOC107733620,LOC107555196,LOC107720141,LOC107600416,LOC107655476 other upstream 1883516 9908188 ~ 9910178 (-)
trim13 trim13,LOC107720128,LOC107555217,LOC107663864,LOC107706093,LOC107600394,LOC107655513 other upstream 2408835 10433507 ~ 10443619 (-)
fdx1 fdx1,LOC107663820,LOC107706088,LOC107720152,LOC107655504,LOC107600437,LOC107555213,LOC107655505 other upstream 2490600 10515272 ~ 10519457 (-)
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Expression


Co-expression Network