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Basic Information

Item Value
gene id piga
gene name piga,LOC107748211,LOC107555234,LOC107663925,LOC107655498,LOC107600385,LOC107720146
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056707.1
NCBI id CM032076.1
chromosome length 26426558
location 10092350 ~ 10113356 (+)
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Sequence

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ACCGTAAAGctacaagaagaagaagaaactccAAAAACCACGGAAGTAGACGTGATGAactgttttgcttgttttttattcCAGAGAACATCTGTTATAATTTCTGTAATGACAGAACAGGACGAATTATcgatgtatttaaaatatgctaaagaTGCATCTAGATCAAGCACACATCTTCAACCAGTCTTTGTTAATTCGCTGAGGATTCAGTCTCATATGTTAACAGCTAACCATTGACTGTGAGTGTTTTCACGTTTTAGGTGTCATTCGTGTAAATGATACTCAGTGTTAATGTACtttcataattaatttatttcgttcgtcaattaaaacaaatctttattgTCACATCACCGTAGCCTGAAATGGATATTTAGCAGCAGTTACCGTGCTGTAGTAAAGTTTTCAACCACAATATACTGCACTCTCTATATAATATGACTGTTTTGTGCAGAGGTTCATCCCTGCTTTTGAAGAACAGAGCACTGAAGACTTCACCTCACCATGGGCCACAGGAAGAGAGGTCACACACATTCACCTAAAACCCCTTCATCTTTGGACCCGTCCCGGCCCACTGATCGCGAGCAGGGCATGAAGCACAGGATATGTATGGTGTCAGACTTCTTCTACCCAAACATGGGTGGTGTGGAGAGTCACATCTACCAGCTCTCGCAGTGCCTCATAGAGAAGGGCCACAAGGTTGTCATAGCAACTCATGCATATGAAGACCGCCGTGGGATTCGCTACCTGACCAACGGCCTCAAGGTGTATTACCTACCCCTGCAGgtcATGTATAATCAGTCCACGGCGACCACCTGCTTTCACAGTTTGCCGTTGCTccggtgtgtgtttgtgcgtgaaCGCATCACGATCGTGCACGCCCACAGCTCCTTCTCCGCGATGGCCCATGATGCTCTGTTCCATGCCAAGACTATGGGTCTCAACACTGTATTCACTGATCACTCTCTCTTTGGATTTGCGGACCTGAGCTCTGTACTGACCAACAAGCTGCTGACTGTCTCTCTGTGCGACACCAATCACATTGTGTGCGTGTCGTACACTAGTAAAGAGAACACTGTGCTGCGAGCCGCTCTCGACCCTGAAATCGTCTCCGTCATCCCTAACGCTGTCGACCCCACTGACTTTACCCCTGACCCCTGTCGCCGTGACAACAGCAAGATTACCATTGTTGTTATCAGTCGACTGGTTTACAGGAAAGGGATTGATTTACTAAGTGGAATCATTCCTGAATTATGTGGAAAGCATCCAGATCTTTGTTTTCTGATTGGTGGAGAGGGACCCAAAAGAATCATACTGGAAGAGGTTCGAGAAAAATATCAGCTTCATGACCGGGTTCGTCTGCTGGGAGCTCTGGATCATAAAGATGTGAGAGATGTCCTAGTTCAGGGTCATATCTTTCTCAACACTTCTCTCACTGAGGCCTTCTGTATGGCCATAGTGGAGGGAGCCAGCTGTGGGCTGCAGGTGGTGAGCACCCGTGTTGGAGGTATACCTGAGGTCCTGCCTGATGAGTTGGTGACTCTGTGTGAACCATCGGTCCGTTCGCTTTGCGATGGCTTGGAAACCGTTATTGCTAGAATACGCACAGGAAACGTGGCGTCTCCTGCCACCATCCACCGCAGGGTCCGAACACTGTACACTTGGAGAAACGTCGCTGAGCGCACCGAAAAGgtgtatAATCGTGTGTGCAGGGAACCCGTTTTGCCGTTGTCTGAGCGCCTGCACAGACTCCGCTCTCACTGTGGTGCTGTGGCAGGCTCCATTTTCTCCTTCGTTGCTGTTATTACTTTCCTCTTCCTGCTTCTCCTGCAGTGGCTCCGCCCAGATCATCTGATCGACGTCGCTATAGACTCATCAGGTCCCCACAGCCGCATGGGGCAGCAGCTTAGTAAGAagaaaagtaaaacacaaaCCTGACCGTGTACTGACTAATGATCTAACACCACCTCACTTTACTCTCACGATGGACTTCAGAAGGGGAAGGAAGCAAGtaatgaactaaattaaatctCTTGTACCATACTAGTGTACTATGGTGCATCAAAACATGTACTGACTACTGTTTACATTCCTGTATAAAACTGATCTCAGGTGAAGAGAGAGCTTTTAAAAGCTGTCCTCAGACACTCCTATAGTCCAGCCGCATGCTTTTGCGCATTGAAAAGCTGCCTTTAACACAACCCCCGTCAGAAAATAGTCTTAACTTGGtgaaattatttcacaaatatgttttaatgtctAGATTTAAGATAGTTGATAAACAGTGCCAGCTTTTCCTGTATCAccttcacatttttttctaacaGCAAATCTCTACGGTGTAGATGTGgtttaaattgaactgaaaGCTTTTATGCCAAATACAGTTTTTGAGTTCTAGTGGagctataaaatgtaaaatgcatcatatctgttcatttttttttgatcTGACAgcacttgtttttctttaaaccacttcttatttaaattgattttgaataaatgcatttatttaaacccaAACATGAAACTCAAACGGGACACTTGATTTTGGGCACTGTATTTCTTTGCCTGTTTTATAATGACCTTCTCTGTGAGTATTGTGAACGTGATTATAATGCACAAAAGTTCATATTACCTGAAAAGGGAGTGggtttgaattatttttgttgacaCCGTGTACA

Function

symbol description
piga Predicted to enable phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase activity. Predicted to be involved in GPI anchor biosynthetic process. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be part of glycosylphosphatidylinositol-N-acetylglucosaminyltransferase (GPI-GnT) complex. Human ortholog(s) of this gene implicated in multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 2 and paroxysmal nocturnal hemoglobinuria. Orthologous to human PIGA (phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class A).

NR:

description
phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit A-like

GO:

id name namespace
GO:0006506 GPI anchor biosynthetic process biological_process

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU102102 True 3878 lncRNA 0.35 2 10092350 10101717
TU102103 False 1348 lncRNA 0.41 2 10097819 10099388
TU102105 False 1580 lncRNA 0.37 2 10092350 10099388
TU102106 False 3878 lncRNA 0.35 2 10092350 10101717
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XM_043249107.1 False 2474 mRNA 0.45 8 10097790 10113356
XM_043249108.1 False 2690 mRNA 0.44 6 10108945 10113356

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122351209 LOC107748218 coding upstream 61798 10022693 ~ 10030552 (+)
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G69033 cx45.6,LOC107663873,LOC107748213,LOC107572527,LOC107655501,LOC107720145,LOC107600426 non-coding upstream 29914 10062208 ~ 10062436 (+)
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LOC122351945 NA non-coding downstream 309858 10423214 ~ 10435142 (+)
G69080 NA non-coding downstream 335345 10448701 ~ 10457161 (+)
thsd7ba thsd7b,thsd7ba,LOC107663893,LOC107751610,LOC107720322,LOC107658187,LOC107658188,LOC107558036 other upstream 525353 9443125 ~ 9566997 (+)
LOC122351827 LOC107568346,LOC107676221,LOC566927,LOC107706103,LOC107706102,LOC108412955 other upstream 931529 9156045 ~ 9160821 (+)
si:ch1073-416j23.1 si:ch1073-416j23.1,LOC107749868,LOC107663920,LOC107556448 other upstream 942257 9142592 ~ 9150093 (+)
fev fev,LOC107749901,LOC107562104,LOC107663906,LOC107672289,LOC106581833 other upstream 1220717 8867097 ~ 8871633 (+)
cryba2b cryba2b,LOC107749902,LOC107562110,LOC107663929,LOC107566327,LOC107560461,LOC107672280 other upstream 1226045 8863387 ~ 8866305 (+)
si:dkey-100n23.5 LOC107748207,LOC107555230,LOC107720121,LOC107655523 other downstream 53980 10167336 ~ 10174783 (+)
il1rapl1a il1rapl1a,LOC107655515,LOC107600393,LOC107663843,LOC107555221,LOC107706095 other downstream 215375 10328731 ~ 10395230 (+)
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LOC122352020 uggt2,LOC107600415,LOC107720140,LOC107663813,LOC107655477,LOC108430493,LOC107706079,LOC108266228 other downstream 1352248 11465604 ~ 11490149 (+)
G69527 arhgap15,LOC107563181,LOC107673132,LOC107709415,LOC107555858,LOC107675340,LOC107711394 other downstream 1933143 12046499 ~ 12155804 (+)

Expression


Co-expression Network