si:dkey-100n23.5 (LOC107748207,LOC107555230,LOC107720121,LOC107655523)


Basic Information

Item Value
gene id si:dkey-100n23.5
gene name LOC107748207,LOC107555230,LOC107720121,LOC107655523
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056707.1
NCBI id CM032076.1
chromosome length 26426558
location 10167336 ~ 10174783 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU102130
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>XM_043249271.1
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>XM_043249272.1
TTTGTCCCTCTGCGCACTCCTTACGTGTCAATGTGGCTGTGGCGTCTCATGATGTGCGCGCTCCACATCAAAATATTAGttagtaaaaagaaagaataattatGGGAGATGAGCATCCACTCCAGGTTAACAACGACAGCAGCTCCCGCTGTGCTTTCCTCAACGCCGTGCCCGACGACTATCGATGTGATGTGATTCTTAAAGTGAAAAGAGCCACAGGGACATTTTCTCTAGTGGCATGCTTTTTCATGATGTTTGCGATGTGGCTGCTCCGCCGATGTAACTCTTTGGCACAGAAAATGATATTCAGTCTGACAGTAGCTGCAGCTTTTGACAGTGTTGCGTATATTATGGGAGAGTCTCATCTAGAGGGATCTCTGTGTAATTTTCAGGCCTGGTGGCTCACGTATTTTGACTGGACTGCACTGATGTGGGTTTGTCTTATTACGTTTAATCTGTACCTGAACCTGGTGAGAGAAATCAGAACTGAACATTATGAGATACCATATCATTTGGTGGCTTGGGGTATTCCTCTGCTCATGTCCACCCTCCCCCTGATGGCTGGTTACTATGGTCCTGCTGGAGCCTGGTGTTGGATCACAGATAATCACGTTGGGTGGAGGTTTGGCATaTGGTATGTTCCTCTGTTTAGCCTGATTATCCTCATGACCTGCTGTTATGCTCGAATCATCTGTGTGGCCAACGAGaggatgcGTTCCTGGTTAGGCACCTTTAAtccagaaagagagaggaggaagATCTCTCTAGCTGAAGAGATCAGACCGTTGAAGTGGTATCCCTCTGTCTATCTGCTCGTCTCTATATTTCCTCTCATAAATCGACTTCATAATGCTGCTTACCCAAAGAACCCTGTGTTTTCGCTGACGTTACTGCACGTGCTCAGTGCACCCTTGCATGGGCTTGCAAATGCTCTCGTCTTCGGTAAGGACACCTGGAGTCAGCTGAGTACAACAGGAATAAAGGTTGCTATTCAGTCTCGACTGTGTGCCAGCACAAGAATTAGAGAGTACCACGCTGCAAATGTAAGATACACACATGACCTTGATACACACTCCGATTCTGACGATGAAGACAACAACATTCTATTTTACAGCCCAGACATGACCTTAAAAGATAGGGGACCCTGGGAGAATGtttagaaagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttcgtgcacatttttacattctttgCCTTTTAAAGAATTTCTATCAGTGTTTCCGTGTTGCAGCTTTCGTGTTGACACTTTAATTAtagcaattattattatgcacCTTTTTCctcaaagaggaaaaaaagccTATGGGTGAGGAATGTGGTTTGTTAGACGGCATAGGTACATAACGTGGAAAATAACAACGtgcataaaacagtaaaactgtttgcactacaaaccagtgtgttcataatgaatgatgatacatttaaataacataagacgcttattttcaatatcaagcagaaAAATGAACTCTTGAACagttaaaaatagctggacgTGGTTGAGACCTGGAGCTAGATTGGTGAAATTTACAAATGGTGCCTATTTTTACATCAAGAAAAATGTGGATAGTTggaaaacaggaaagaaaatgGTTGATAGTATGTCTTTCTTTGCTGTTAATGACGGGTAAAAGcataagttgttgtttttttttttgtactgtattaaAGTGGAAAAGCTTTAAATCGAGCAATTCACCACTTCAAAATAATCTTTgttgtatataatgtaattaaagacTGCCTTTTCCAATTCATTCAGCTGAGTATTTcagacttttaaaatgtttgagcatgttttaatattgtatttatgaaaatgtatgctatatttttgtattgtttgcgGACTCaactaattttaaatacaaatctaaaaacatttatgtcgtgtttgtgtcttttgtcTAGTAGAAAGAGCTGGCACTCATTAACTTCAGTTAATCAGCTAATCAACTTTGAGTTCAAGTTAATTAAGTCTAAATTTTGAGTCTCTTAGTGCTTAAGTCAGGATGATTAACCAGAAAGCCTTGTTAAGTAGGAGCTTTCCCATGAACTGCTTTATAAGAAGGTTATAAAAGGTCAAATTTAAATCAGTGATTAAAAACGccaaagtgtttttattttgcaataataaaacactttaaactaTAAAGCTACCGACACGAGTGGACAGAAGTAGAAGTGTTGTCAGAAATGCAcctttgtactttattttcacacaaatgtagtgtgaaaataatatttagatgcaaatttatttaaatattatttatagtgcTATAAACAAACGATATTAGTTTTTCACCcgttatttatgtgtgttttcctGATTGGCCGTGTTGTCTCGCGTCATCTCAGCGCGTTTAATCGCAATTGGTGAACAACTCGTGACGAGTGGCAAGGGAGCCAATCAACGAGAAGTACGTTGTACGACTGATGAGAAATGAGACAGGAACCTATGCATAACATATTTTCATAACAGCAGCTGGAAAATGCAGGGCGCCTCCTGAACAACAACATTTATAGCTCGTTTAAAAGACGCTTTTAAAGACGTATTTTCTGGGCACGAAACAGATACAGTAGAAACTACGATCTGTACAGCATGCCGGTGCCTACGTGGTGCGCAAGATCCGCGCCGCCCTTACAGAGGGAGAGCAGACAGAACAACCTGTGCTCACACCATGTAGTCTGGCTAAAGGAAAACAGCGCCATGCGGCATTGTCCGCTCCAGAGCCTAAGGGTCCTGCTGGGTCATCTGCATCTACGGAGACAACTGTACAAAAATATGGTTCCCTAGGGTAAAGGTCACGCAGAAGCAAATCTGGGCACAATGGAAGATGAAAAAACAGCATTGCTAGAGTTTTGGATGCTGGATGGTCATCTAAGCTTGTCCTTTAAATTTGGATTTTACCAGTAGAAGGGATTGTGGTAGAAATCTGACATCAGTCCAGTTTTGCTCTGCGTGACCTTTTGTTCTTAGATGCAAACACTCGCTCTTCATTTCcctttgtctctttctctcttgtttcCCATCAGCTGTAGTTTGTGAAGGTCTGTTTATCAACCTCTTCTTCAGGGGCGATTCAGATCTGATGTTTACCTGCAGCTTTTGTGTTTATAATCATCAACTAACTGACTGTACACTAGCTGAAGACATATCGCTGTCAGTAACAGTAACAGCTGACACTCTTTACAAGATTTCTTATTTtgtaatggcaaaaaaaattaataaaacagtccagtctt

Function

NR:

description
cyclic AMP receptor 1-like

GO:

id name namespace
GO:0007186 G protein-coupled receptor signaling pathway biological_process
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0030552 cAMP binding molecular_function
GO:0004930 G protein-coupled receptor activity molecular_function

KEGG:

id description
K22987 GCR1, CRLA; cAMP receptor-like G-protein coupled receptor

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU102130 False 865 lncRNA 0.42 3 10173283 10174783
XM_043249271.1 True 3293 mRNA 0.40 15 10167336 10174713
XM_043249272.1 False 3274 mRNA 0.40 15 10167336 10174713

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
mid1ip1a mid1ip1,mid1ip1a,LOC107655494,LOC107748224,LOC107663855,LOC107555231,LOC107600390 coding upstream 914 10165180 ~ 10166422 (+)
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asb11 asb11,LOC107748226,LOC107720119,LOC107655497,LOC107600386 coding upstream 49788 10113994 ~ 10117548 (+)
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LOC122351607 abi3bp,LOC107748202,LOC107655519 coding downstream 34066 10208849 ~ 10226652 (+)
dcbld2 dcbld2,LOC107600392,LOC107655516,LOC107706081 coding downstream 87595 10262378 ~ 10279903 (+)
LOC122351198 LOC107706096,LOC107663847,LOC107663844,LOC107555219,LOC107706098 coding downstream 227562 10402345 ~ 10405495 (+)
LOC122351200 LOC107663844,LOC107555219,LOC107706096,LOC107706098,LOC107663847 coding downstream 231200 10405983 ~ 10408038 (+)
G69042 NA non-coding upstream 59152 10107840 ~ 10108184 (+)
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G69031 NA non-coding upstream 105725 10061058 ~ 10061611 (+)
LOC122351843 NA non-coding downstream 265 10175048 ~ 10179380 (+)
G69089 NA non-coding downstream 245699 10420482 ~ 10420692 (+)
G69090 NA non-coding downstream 247260 10422043 ~ 10422253 (+)
LOC122351945 NA non-coding downstream 248431 10423214 ~ 10435142 (+)
G69080 NA non-coding downstream 273918 10448701 ~ 10457161 (+)
piga piga,LOC107748211,LOC107555234,LOC107663925,LOC107655498,LOC107600385,LOC107720146 other upstream 53980 10092350 ~ 10113356 (+)
thsd7ba thsd7b,thsd7ba,LOC107663893,LOC107751610,LOC107720322,LOC107658187,LOC107658188,LOC107558036 other upstream 600339 9443125 ~ 9566997 (+)
LOC122351827 LOC107568346,LOC107676221,LOC566927,LOC107706103,LOC107706102,LOC108412955 other upstream 1006515 9156045 ~ 9160821 (+)
si:ch1073-416j23.1 si:ch1073-416j23.1,LOC107749868,LOC107663920,LOC107556448 other upstream 1017243 9142592 ~ 9150093 (+)
fev fev,LOC107749901,LOC107562104,LOC107663906,LOC107672289,LOC106581833 other upstream 1295703 8867097 ~ 8871633 (+)
il1rapl1a il1rapl1a,LOC107655515,LOC107600393,LOC107663843,LOC107555221,LOC107706095 other downstream 153948 10328731 ~ 10395230 (+)
creb1b creb1b,creb1,LOC107598164,LOC107738506,LOC107698524,LOC107663917 other downstream 846953 11021736 ~ 11030409 (+)
LOC122352020 uggt2,LOC107600415,LOC107720140,LOC107663813,LOC107655477,LOC108430493,LOC107706079,LOC108266228 other downstream 1290821 11465604 ~ 11490149 (+)
G69527 arhgap15,LOC107563181,LOC107673132,LOC107709415,LOC107555858,LOC107675340,LOC107711394 other downstream 1871716 12046499 ~ 12155804 (+)
epc2 epc2,itm2b,LOC107709422,LOC107724031,LOC107675331,LOC107673124,LOC107709423 other downstream 2260205 12434988 ~ 12452365 (+)

Expression


Co-expression Network