G69659 (LOC107709425,LOC107724026)


Basic Information

Item Value
gene id G69659
gene name LOC107709425,LOC107724026
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056707.1
NCBI id CM032076.1
chromosome length 26426558
location 12518289 ~ 12526873 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU103009
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>TU103011
AGGGGAAAGTATTTACTGGTAGAAGTTGGTACAAATAAACCTTATTTACAGAGAGGTTAAGGCAAAAGGTGGAATGACATGCATGCATTTCCCAAAAAACATTACTGTACATGCATTTAAAGTTCACAGAATTACAAAGGGGAAGAATCCCAAACACTGAAAAGACATGGAAAAATAATtcctatttataaaattaaagtaCAAAACTGTTTAGTACAAGCCGTTTCTCCTTATACAAAGTAGACAAAATAGCCACATAACATTCAGCAGTTAAAGATTTGTATCccattttaaagtgatttctcAAACACATCAGTAATCCGACCATCTGATATTTTCTccaaatactgtaatataaatacCACGCTTAATACTATTTGCCAGTTGCCAAAAAGACAGTCCCAAATACATAAAGTGCAAAACACTGtcatttcaaaatcaaatctgCATTTAAACCTCTATCTAGTGTGTATGAAGCAGACTTAGTTTCGCTGCTGTTTCTGTGAAGTGGTGGGGAATGTTGAGGGTACAGTAACGATGCACAACCTGTTCACTGTAGTGGAGATTTTCATACTGTACTTGAATATGAACCATAAACCTCAAATCGGTATTTTCTATTCTTTGAGGACGACATTTCTTGAAAGGTAAAGCGGTGAATTTATAGGATGTGATTGTGGTCTAAACtatgcatgaatattttttttttaatgcaaaagcaaagatttgtaaaataaaaataccatgtGAAGCTACTACCAAAAACCAAAATCTTAAGTGCTATCCCGTTCAAATGTCTCTAAAATTTCTAATCCGCatcttcattttctttccatttgTTTCATTCAAATCACTAAAGGTTTAAAATCTAGGAAGCTGTGTGAGTATTATTAGGAAAGCATTTTAACCCATGATGCACCAATTCAaagcttctggccaaaatattgTCCTATAGTATAATAATGCGCATTAAGTTTAAAGAGCAGATAATATACGTTTTTGTTGACTATTACAGTACAGAGATAATCCTTAGTAAATGCATTGTATTTGTATTGAATGCATGAATTACTGTCATGAATAAATAGTTACAGCCCACAGTCTCTCAGAAATCCCACATGGAAGTGTTATAACTGCTTTCATATAAGAACCTAAAagagtttttttcccctgtcagttcacattaataaaataaattgtgctttagttttaagtaaaataaacacCGAttcaaacatattaaaataaacacatcaaatataaatgttctgTACATTTTACACGTTCACACACCAACATCACGTAACAAATCCTTCTACAAATActacaaaacctttattttaaaaatacattttaaaaaactataaaatgattatgtttgTAAATCAGTTTtgatatatgaaaataattttggCAACTGTCAAATAATCTCCAGTGAGATATCAGCTTCAGGTGTTTTGGTCTGTTTCATGGCTGAATCTGCGAGGAGCTGAAGCTTTGGACACTAGACAAATacgcactaaaaaaaaaaaaaacacacaaacttgcatataaaaaaaaaaaaagtgccaacATGTGCTCTCGTCCTCTCACGCTCGCAAAGAAATACTCCTCAAGGTATAACTCACGcataaacaactgaaaacaaatgCCAGGTAAGTTGTTTTCTACCGTCCACACactcaaacatatttttttttttagtgaaatCATTCCTGACCGACAGGTAAGCAGAGCAGAGACCGTAAGAAACTATAGTGAGGCCACACCTCCCCTGAGACAAAACATCACCGTCTcccaaaaaccaactcaaaagtGGTTACAAAACCAGACTCTGGGAGGATGAGTGTTTTAAATCTAGATCGCTAAAGGTTTGCCCAAAACAAATATCATATGGGTAAATGCGTATATAAAAACCATCAGAAATTGTGCACAATTCTGTATACCTCTCAACTAAccgtttaataaataaatgcattttaaataaaacaatttcttaTCTTAAGCTGCTTTTGAGCTAATTTTGCTTATACGACCTGTGGCCTGGGCGACAGTGATCAGATAACAGTActaaataagaaagaaaagaaagtgagGGAAACATGAGCATATACCTGCAAGCTGAGGATCAACTGTTCTAATAGCAATAAATGGACACAGTCCAGGGAAATTCTTAAAGATTGTCTTCCGGtattagcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgcgactCATGTGATGAGTGTCTCACTGGCCGAAGTCTCATCCAGCAAAGCTTGGACAGTGATGCCAACTTTGATCAGGCCCTTCTCCTCAAGAATGTGATGTGGCAGACATAACTTATcctagagagagagattcaCAGAGAAGACAAACAAAGTGTCGTGTCAGAGAAGAAAGACACACAGTCAtggaaaacagaatttattatGCACAGTCCATTCAAATGTAACGCTCTTGAATCCAGTTAGTGAAACTAATAGAGACTCACCTTGTTTAGCAGTGATGGCAAATACGATATCAGTcatgcaaacaataaaaaaaaaaaaatgctgaccccaaacatttaaacggTGGTTTAAAAAGGCAAAGATGAGAAAAACAACCCAAACtgtacatttattctttttcatttacaggTTCATAAAAACCACAAAGCCTTACAAAGTCCACTAGAAGCAGCAGCACTGAACGCTATTCAAGAAGCGGCTGAACCGTCAGAGGAACCCACGCAATCTAATTTAAGCAATACAAACACTTTTTGCAtcttgcagctttttttttttttttttttttttacaaaggagGAAATATGCCGAACAAAAAGTCCCGAACAGTCAATATTGCCTTTATTTTTGTCAAACTGGATGATGAAAGCAGTGCCAATTATAACTGCTGTGATCCCGCCGATAAGGTTCAAAGTATTCTGTAGTTTGAGGAAGTGATGTCAAGAGGCCTCAGTGACATGCTCATTTACTAACGGCTCTCTTTAAAGATTTCTTTTATCTCTGATGAGATAAAGAAGGTCATTCTATTACGTGAGATAATGATCGGAACCTAAAATAGAATCAGAGCATCCGATTAGAAGACCCTCCGTTCTAGAGACACCTTGCATACAGACCTTCAACGAAGTAAATTACATACAGCCACTACACTGATTACTCAAttattaaaactgcattaatatgatatttcatcattttaaaaaaagccacCTCAACCTCTATTACAGATCACTGATAGAATACACGAATTAAAGCGTATTATCCGATGCTGTTGTTCCTTGGATTAGTCACATTGCTGTGGAATGTTgcttattaaatttattaaaaaatagatttggTTCGCTCTGTCATTCTGTTTTACTAATGATCGGGAAATGAAACCAATGATTCATTAGTCCCGTTTCATCCCATAGATGGCGTTTTGGAAAAAATAGCAATCTAATCATTTGCAACGACTGTGCAGGATGTTTAATAATTCCCGATCTAAACAATAACACATCATGCTCTTAAAAACACTCATAACCAAACTAACTGCTTTTTACATCCAACAGACAAATTAGCCCTTATGctaatgattaaatgttttaatcataGATATAACCTCACCGTACAAGACTTCTGTGCAAGCGAAGCTTATCATTTTGCTTTAATGGCATCTGGGCCTTCACTTACTCGAGCTTCCTGATTTATTATCTGCAAATTATTTTGTGTGAAGCAGACCAAATGTGCGCTTGATTCCTGTAGATATATTGCTGATCACTGGCATGACTGGCAcatccgttttttttttgtcatgcagATGCTAATAagtatatattgtttatatgtgCAATATCCGACAAAGTTTGTGAAACAACTTTTGTACAGAAGTGGAAGTGAGTGAGAATGTGGCCATTCGTCATTCCTCATTAAAGTGCTCCGTGCACCTCCTGcgtaaatgtttgtaaaaaggTTTCCTTAGCATTTTGCAAGGACTGATAAATATGGTATTCGAATCCCCGACTAATAAATAACACTTACTCgagcatgaaaatatttaaatctctTCCTGGAGCgcgttatttttttacaaaaatgttgcatgtttGGTTTTACGTATGGTTTCCATCACGGCCAAGGTAAGATGTAAGGTTTGATCAGACATGAAACTCTCTGGGCTGTGCtcattcacccaaaaatgaaaattctgcagTTTGAGTTGGtctccattgacttccacaatATGGAAATCAGCGGAGACCACAATTGCTTGGTTACCCGCATTCtttaaactattttcttttatgttccaaagAAATAAACCCGTACGGTTTTGTAACAAACCACTTGAGGGTGAGTAcgtgatgacagaattttcatttttgggtgtactatACCTTTAAGTGAGGCCAACCGTTCAATGTGCTTTCAAAGACCAGTAAATGATATAATGTGTTACTTTTGAGTTATTAGTTCatgtatgttatttaaattcGCTCCAGCTGTAGGCCACAAACAGCATCACCAGACAGAAAACGTGCAGTAGACTTGAGCCAATCAGATCCCATATTTGCCAGGAAGGGGGTGGAGTCTGAGTGGACTCGGGGATAAGCTTCttgacctctgtctctttctccctGCCACTTTCCACCTTTCCTTCCTTCTGCCTTGTTCCTGTGCTCTCCGCCATGAGCAAGGCCGCGACCACGGCCCAGAGCGGACGCAGGTTAAACTGCAGAACGTCATAAGCCGAGCAGAGAGAGGACTGAGAGAGATTAAAAACATGGAGGGGATGACAAAGAGAACcaggaagaggagaagagaacAGAGTAATAATGAAGAATGGATGGACAGAGAAACAAAGggagaagaaaaggaaagaagaaGGGAAATGAGAAAAGGAGAGATCATCCGTCCGGCACCAGAGAAAGATAAGGAATGTGATTAGACAGTGATAAAGGTCAAAGGTAAAATGCTTTGAGCTCAACAAATAACAAGAGTTCTGGATTATTGTCAAGAAATGATTACATTTGTGTAATAAATATGAGTTCCCATGATCACCGATAACGTAGTTAACAAGATACTAAAGTCACATTTAGCGTATACTGGAGCCATTTAAATTTGAggaattttactttttttcatcaaaatatcctCGTTCATCACCGATACATGAGTTGTACAGTATTCTGCTCAACCagtaaaactttattaaaaaatatgtctgACGTATTTAAGAAAAggaaattataatatttgtttctttttctgattGTCTTATATAGCGTGGTGCAAATACCTTTgtctacgtttttttttttttataatatgctgatttggtgctttagaataattaatttttcatttctaattaATATTAGC

Function

NR:

description
PREDICTED: leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1-like isoform X3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU103010 True 7976 lncRNA 0.37 2 12518289 12526873
TU103011 False 5376 lncRNA 0.36 2 12518289 12523692

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122351846 ankrd44,LOC107719801,LOC107659898,LOC107595853 coding downstream 262417 12789290 ~ 12811475 (+)
G69625 NA non-coding upstream 60791 12457264 ~ 12457498 (+)
G69578 NA non-coding upstream 195757 12322251 ~ 12322532 (+)
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G69518 NA non-coding upstream 508367 11979781 ~ 12009922 (+)
G69483 NA non-coding upstream 1094972 11420205 ~ 11423317 (+)
G69706 NA non-coding downstream 138139 12665012 ~ 12724840 (+)
G69718 NA non-coding downstream 246461 12773334 ~ 12773850 (+)
G69723 NA non-coding downstream 310846 12837719 ~ 12840151 (+)
G69783 NA non-coding downstream 579407 13106280 ~ 13106757 (+)
G69789 NA non-coding downstream 580722 13107595 ~ 13107832 (+)
epc2 epc2,itm2b,LOC107709422,LOC107724031,LOC107675331,LOC107673124,LOC107709423 other upstream 65924 12434988 ~ 12452365 (+)
G69527 arhgap15,LOC107563181,LOC107673132,LOC107709415,LOC107555858,LOC107675340,LOC107711394 other upstream 362485 12046499 ~ 12155804 (+)
LOC122352020 uggt2,LOC107600415,LOC107720140,LOC107663813,LOC107655477,LOC108430493,LOC107706079,LOC108266228 other upstream 1028140 11465604 ~ 11490149 (+)
creb1b creb1b,creb1,LOC107598164,LOC107738506,LOC107698524,LOC107663917 other upstream 1487880 11021736 ~ 11030409 (+)
il1rapl1a il1rapl1a,LOC107655515,LOC107600393,LOC107663843,LOC107555221,LOC107706095 other upstream 2123059 10328731 ~ 10395230 (+)
G69670 LOC107673130,LOC107555834,LOC107709428,LOC107724029,LOC107675357 other downstream 100662 12627535 ~ 12629535 (+)
LOC122351618 clasp1a,clasp2,LOC107741904,LOC107714287,LOC107673735,LOC107596084,LOC107706129,LOC107696541,LOC107669402 other downstream 205425 12732298 ~ 12803408 (+)
G69755 NA other downstream 457995 12984868 ~ 12985978 (+)
G69834 col6a3,LOC107685998,LOC107567775,LOC107670696 other downstream 762820 13289693 ~ 13304591 (+)
ccnt2a ccnt2a,LOC107658298,LOC107725237,LOC107723659,LOC107684218,LOC107555058,LOC107555362 other downstream 1149290 13676163 ~ 13684835 (+)

Expression


Co-expression Network