lrch1 (lrch1,LOC107709425,LOC107601076,LOC107673127,LOC107724026)


Basic Information

Item Value
gene id lrch1
gene name lrch1,LOC107709425,LOC107601076,LOC107673127,LOC107724026
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056707.1
NCBI id CM032076.1
chromosome length 26426558
location 12518284 ~ 12582425 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
lrch1 Predicted to be involved in cellular response to chemokine and negative regulation of T cell migration. Predicted to be active in cytoplasm. Orthologous to human LRCH1 (leucine rich repeats and calponin homology domain containing 1).

NR:

description
PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1

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RNA

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Neighbor

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arglu1a arglu1a,LOC107555859,LOC107673121,LOC107711396,LOC107577473,LOC107675355,LOC106586866 coding downstream 508347 12004004 ~ 12009937 (-)
efnb2a efnb2a,efnb2,LOC107555860,LOC107563180,LOC107675360,LOC105018709 coding downstream 517592 11982968 ~ 12000692 (-)
LOC122352021 hs6st3b,LOC107555209,LOC107733651,LOC107663930,LOC107600438,LOC107720131,LOC107655503 coding downstream 1053870 11454069 ~ 11464414 (-)
slc39a10 slc39a10,LOC107673130,LOC107709428,LOC107724029,LOC107675357 coding upstream 36851 12619276 ~ 12640868 (-)
LOC122352069 hacd2,LOC107660639,LOC107741899,LOC107661144 coding upstream 140976 12723401 ~ 12729104 (-)
LOC122351488 pikfyve,LOC107731754,LOC107569979 coding upstream 231728 12814153 ~ 12815138 (-)
ftcdnl1 zgc:153901,LOC107555842,LOC107728290,LOC107670712 coding upstream 532078 13114503 ~ 13118222 (-)
stk17b stk17b,LOC107670710,LOC107728292,LOC107555841,LOC107718375,LOC107675356,LOC107601079 coding upstream 547624 13130049 ~ 13137972 (-)
G69631 NA non-coding downstream 88937 12425515 ~ 12429347 (-)
G69645 NA non-coding downstream 106449 12411507 ~ 12411835 (-)
G69644 NA non-coding downstream 111522 12406167 ~ 12406762 (-)
G69643 LOC106586327,LOC106582410 non-coding downstream 113563 12404395 ~ 12404721 (-)
G69642 NA non-coding downstream 121770 12396066 ~ 12396514 (-)
G69704 NA non-coding upstream 63411 12645836 ~ 12647002 (-)
G69733 NA non-coding upstream 148616 12731041 ~ 12731743 (-)
G69738 NA non-coding upstream 191016 12773441 ~ 12773852 (-)
LOC122351847 NA non-coding upstream 204690 12787115 ~ 12789134 (-)
G69762 NA non-coding upstream 453531 13035956 ~ 13037453 (-)
G69650 NA other downstream 94838 12422429 ~ 12423446 (-)
gtdc1 gtdc1,LOC107709416,LOC107555857,LOC107563182,LOC107675364,LOC107673117 other downstream 323323 12091131 ~ 12194961 (-)
LOC122351308 si:rp71-84d19.3,gtpbp8,LOC107663822,LOC107567641,LOC107738531,LOC107733632,LOC107598183 other downstream 1017789 11496947 ~ 11500495 (-)
LOC122351858 slc10a2,LOC107663831,LOC107567642,LOC107675341,LOC107738529 other downstream 1025164 11396666 ~ 11493120 (-)
mrasa LOC107551943,LOC107663912,LOC107733654,LOC107600440,LOC107738526 other downstream 1831657 10680158 ~ 10686627 (-)
LOC122351186 adcy5,LOC107555914,LOC107660638,LOC107596066,LOC107661140,LOC106586396,LOC107745452,LOC107668560,LOC107695824,LOC107716189,LOC107568450,LOC108433131 other upstream 125551 12707976 ~ 12720690 (-)
LOC122352189 NA other upstream 155619 12738044 ~ 12738171 (-)
G69757 NA other upstream 402699 12985124 ~ 12985978 (-)
gypc gypc,LOC107723681,LOC107725252,LOC107555063,LOC107567781,LOC107684853,LOC107695565 other upstream 890710 13473135 ~ 13495667 (-)
tmem163a tmem163a,LOC107658221,LOC107725256,LOC107684456,LOC107555363,LOC106586306,LOC106582396 other upstream 1059878 13642303 ~ 13673807 (-)

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