G71442 (LOC103022703,LOC103363874,LOC107673729,LOC107721018,LOC107596080,LOC107660614,LOC107555938)


Basic Information

Item Value
gene id G71442
gene name LOC103022703,LOC103363874,LOC107673729,LOC107721018,LOC107596080,LOC107660614,LOC107555938
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056707.1
NCBI id CM032076.1
chromosome length 26426558
location 18747911 ~ 18892052 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU105770
tgttttttttttttttttttttttttttttttttttttttgttttttttttttttttttttttttttttTACTTTGTGAAAAGTTTATTATGAGAATTGACagaggcaaaaaataaattaagactCTGGGGATAGGGGAAGAGGTTTTGCAGCCAGTCCATTAATGGCAGTATATTTAGCACCTTTGACTTTGCGATCCAGGCCGTGAGGGGTCAAGGGGGtggtttgtatttttgtgtaactATGATGCCCCCCTACACCCCCACCCCTCACAGCCGTTCCGCTATGGAGAGGCTTGTCCCGGCACGAACAACACCAAGAAAATTAGCTGGAAAAAATATGAATGGCTTCCAAGAATGGACAAAAGAAATGGGAGTCAAGTGGAAAAAAATAGGAaacacaaataacaaaataactgtttatgACTAACATCCCGTGTCCCTTTCATCCATTTCTGAGTTGGTTTTGGAAACGTTGTGTGGATGTCCTGACATCATGGAATCTGGAGAAACGCTTCAGTTTCCTTACAACTCCAACTTCTTACACAGACATGATGTGTTTGACGAAAGCTGTTCAGAATGGAGAGATCAAATAGGTTTAGAATTACAACAAACATTGTCTGTAAATCCCTCAATCGTTAACAATTTCACTGTGGTTGGataaagaaatgattttaaCTGACCCTCATAGTTCACACAGCCATTTTCATCCTCCTGGCCTTGCATGAGAGCATCGATCTCAGTTTCAGACATTTTCTCACCTTGTTGACAAGACGATACGCAGCTCAGCACCCATTACTGTTCCATTGCCCTCCTTATCGAATACACGCAGACCCTCAACGTAGTCATCGTATGTTGCCTTGTTTGGGCTGTTGACCACAAACTGCAGCATGGGCAAGAAACCCTCAAAGTCCACTCTCTTGTTTGCCATGTCTGTAACATCTGCGGTGGGGTTGCCCAGGATCTTTGTAACCTCTTTGTTGGTTGGGTTCTGTCCCAATGCACGCATGATATCTGCAACTTGGTTGAAGGCTACTTTGCTGTCACCAACTCTGTCGAAAAGTCCGAAGGCCTCCCTGTAATCTGGAATTTGTGGAGAGATTATTTTAGGAAAAGATGAAGTGTGCACATTTGTTCCCAACAGGTTTCCTGAACACATCCCTCTCTGCCATTGGTTGATCAAACCAATAATCCTGCCCATGGGTCACACAATTGGATTATAGGGTACAATTATTACACAGCACCTAATTTTTAAAGATGTCCCCATTTATAACTTGAATGTCCAAGGCTTCTTTCTATTGCTAGCTGCTCCCAACTATTTTAGCTGGACAAAAGCAGTCCTTTAATATGCAAACTGCTATTACTtctcatattattatttgtctgtttactgcactttgttatttttttgatcTTCATTTTAgataaagttttagtaattttgtcatttgtataaatttttgttgtatttaaatgtctataattttagtaatttttatttccaacttcattattttattattataaatgtattattttcagtttataatCACATCAGGTTAAAGTAcatgaaaatgcataatatttccTTGAAACCTagttttttcaatatattttatcgTAAGTTCTTTTAGTTAATCAATAGTatcttttaatggttttagttttagttaagtATAATAACCCTGTTGGGAATCAACACATGAATGGCTTATAGTTAGGCTTTTTATGAGGCAATTTGAATGTAGAATTTGAATATTAAGTATGCCCAAGGAAATTCTGcacacacaacataaaaaaaaaggttttctctAAAACTGTATAAACAAAGTTTTTTGCCATAGGTCAGATTAGATTTAATTTCCAAATTTATATTGAAAATGGACAGACTGAATAATAATCAGTGCTCATGGCACACGTCATGGCAAGGAGACTAGGTGGTATGATGAGATGAGCTGCTAAAAGATTAATAGCTTCATCTGATTTCCACACAAAGCCAGCTGCCACCAAAGATGTGGCAGGGTCAGGGGGAGACATTCAAAGTGTCGTCTTGGAATTGATATGCTCGCCCAAGAATATAACTCCCTCCATATAAAGGCAGTACCATGTGAGCCCAGAATGCTGACTGCAGTGTAACTCACACCCAGGCTGCTGAAAACTCCCCTCATTGGGCAACGAACACATTCTTCCACGTAAGACGCAGGCCTGGACAATGGTGCAAATTAACTGTAAAGTTTGCATGAAACTGCTTGACCTTTATTCCACAACAGAAGCAAATACCAGAGCTCTTTGGAAATTTAACACAGGTTGCTTGCCtcaaaaaacttaaaatgttctatgcttttgaatgaactTCCTGCCTAAAGGCAGATTATAATTAGGATAACTAATAACTATTTTTCCcctatttttcattattttaagcGCTACACCCCATGCAATCTCACTACATATTTGTAAGCAAGGGTCATGAAAAATGATCTCACCTTCCATCTGGTCCTGGCTGAAATCGACCTGCAGGAAAACAAaggtactttttattttgtcccAGTGAAAGATAATATATTATGCTTAAGAACTGAAAGGTGATATAATACATGCTTAAGAGATCAGTGTGTTAtgtaaattcaaatatataaggCAAAATGTCAtgacagctttatttaaatcgGCTTTATATTATGTAGTGCCGTTATGTAAGGCAAAGAATGTATTTTGTCAATGGCAAATAtcacttttgtaaaataataatcagtaatgCAAATGGATTTTCCACAGCATAAAACAGGGGGACTATGTGCATGGCCTGAAGATGCTGAATGATTTTCAGGAAATGAGAAAATCCATCTCATCACTAGAGTTATGACAGGTGAGTCATTCACAAACAGCTGCTTTAATAGAAAACCAAAGAGTAAGAGCCCCAGATCTTGGCATGCTTAATTTAGTCCCTCAGCTGCTTACAGAACTTTAAGGAGCTCCATGTTTGGCTATGAGAACCTACTCCACTTTTGGCTATCTGGGCCAATCAGAAAAGGGGTGTTACGTTTGATTGTAGTtatgcagaaaacaaaaaaaaacaaaaacagaactaTCGGTGGTGATGAATCATCTGCCAATAATAGATattttctccagtcttcaggcCCAGAACAACCTTAGGCATCTGCTTGACTTAActcattaaacaaaataatatgctTAACAGATCATTAGGTTATCTACGTTCAGATATATGACTCAAACGTTTATGATGGCTCCATTTGAATCTGCATTGCGTAGTGCCTTAATGTCAAACACATTATGAATGCAATTAGCAACACAACCTTAATGCAGGCATTTTCACAGATAAGCTTGAGagactttaaaatacaaatataatggACTTTTTGCTTCATTAATTGCAAATTCATATAATAGACTAGGCCTACCTGCCATGCAGTACTTACaataatagattaataataacacaacaTTATTTTGctagaattaaaataatgtattaaccAATAAGCATTCTCCAGAACTATATATTAACACCCTCTCcagatttacatattttttaattttttctctctttttttttttttttttaaatctcattggTAATTTAGTAAAAACTGCAAAGCACGTTTATTTCAGCTAAGCTCTAGCAAGTAAATAACTACATTTACTTGTAGTAAATCTTAGAGAggaaaacccccaaaacaaaacacttcactGCTCATCTATCTGTTTGATGCCGTGCCGTTACCTTCACACCGGACAGATCTACTCCCGCGGGTTTAGGTGGGGCCACGGGTTCCGGCGCGGGAGCGGGGGCAGGTGCGGGCTCTGCTTTCTTGGCAGGCTCGGGCTTCTTAGCGTCCTTCTTGGGTGCCATTTTTTTAGTCTATTTGTCCGCCGGGAGGGAAGTCAACACAGGGAGTGGACCACAGCTTGGAGGATACTCAGCATTCTCAATCCTGGACTCTTGGGAAAGGGAGTTAGTGGAGTCTGAAAGTCTTGAGGAGGCCTCAGCTGCTGATGCCCGTTACCCCTCAAAGCGCACAGATTGTGGTCCCCCAGCTGTCATCAGGGCTCACCCCTGCTGACTAGAAGCACCTTCTCTAAAAACCTGCCCCCATCCACCTGCCTATCAGAACCAACAACCCCCTCTCCAGCTCTTAATGATTTTAACAGCTAATTCACTTTTAGCCTACTTGGTTATTTGGCATGGTTGTTGGGATGGGGAGGAGTCATTAAGTTTGATGGAAGACACAAGACGTCTCAAGATAACTTCTCTAATATGCAGAAGGTTTGGCGTACCATACATTTTTGGCCTTCATTACaaaccttttttgttgttttttgttgtattttcctatcaaaataataaatgataaacaatatCTTAAGCACCACCCCCAGTCAACATGTATACATTCatggttattttaattactaatcATAATCagtaatcatatttaattactATCGTCTTACAATGCTAAGTTAAACAAATTTCATATtataatgcagtaaaaatactaTGGTGATTCTATTCCCAAGGTGTCTGTAGAGAATATTTACAATAACATATTGATTTTGATAGGTGTCTCTCACATTATCCCACAGATTAGggtacaatgttttataataatagtttattctatttagtgccctttgc
>TU105772
ACAGTAATGTGTGTTGACAAGACGATACGCAGCTCAGCACCCATTACTGTTCCATTGCCCTCCTTATCGAATACACGCAGACCCTCAACGTAGTCATCGTATGTTGCCTTGTTTGGGCTGTTGACCACAAACTGCAGCATGGGCAAGAAACCCTCAAAGTCCACTCTCTTGTTTGCCATGTCTGTAACATCTGCGGTGGGGTTGCCCAGGATCTTTGTAACCTCTTTGTTGGTTGGGTTCTGTCCCAATGCACGCATGATATCTGCAACTTGGTTGAAGGCTACTTTGCTGTCACCAACTCTGTCGAAAAGTCCGAAGGCCTCCCTGTAATCTGGAATTTGTGGAGAGATTATTTTAGGAAAAGATGAAGTGTGCACATTTGTTCCCAACAGGTTTCCTGAACACATCCCTCTCTGCCATTGGTTGATCAAACCAATAATCCTGCCCATGGGTCACACAATTGGATTATAGGGTACAATTATTACACAGCACCTAATTTTTAAAGATGTCCCCATTTATAACTTGAATGTCCAAGGCTTCTTTCTATTGCTAGCTGCTCCCAACTATTTTAGCTGGACAAAAGCAGTCCTTTAATATGCAAACTGCTATTACTtctcatattattatttgtctgtttactgcactttgttatttttttgatcTTCATTTTAgataaagttttagtaattttgtcatttgtataaatttttgttgtatttaaatgtctataattttagtaatttttatttccaacttcattattttattattataaatgtattattttcagtttataatCACATCAGGTTAAAGTAcatgaaaatgcataatatttccTTGAAACCTagttttttcaatatattttatcgTAAGTTCTTTTAGTTAATCAATAGTatcttttaatggttttagttttagttaagtATAATAACCCTGTTGGGAATCAACACATGAATGGCTTATAGTTAGGCTTTTTATGAGGCAATTTGAATGTAGAATTTGAATATTAAGTATGCCCAAGGAAATTCTGcacacacaacataaaaaaaaaggttttctctAAAACTGTATAAACAAAGTTTTTTGCCATAGGTCAGATTAGATTTAATTTCCAAATTTATATTGAAAATGGACAGACTGAATAATAATCAGTGCTCATGGCACACGTCATGGCAAGGAGACTAGGTGGTATGATGAGATGAGCTGCTAAAAGATTAATAGCTTCATCTGATTTCCACACAAAGCCAGCTGCCACCAAAGATGTGGCAGGGTCAGGGGGAGACATTCAAAGTGTCGTCTTGGAATTGATATGCTCGCCCAAGAATATAACTCCCTCCATATAAAGGCAGTACCATGTGAGCCCAGAATGCTGACTGCAGTGTAACTCACACCCAGGCTGCTGAAAACTCCCCTCATTGGGCAACGAACACATTCTTCCACGTAAGACGCAGGCCTGGACAATGGTGCAAATTAACTGTAAAGTTTGCATGAAACTGCTTGACCTTTATTCCACAACAGAAGCAAATACCAGAGCTCTTTGGAAATTTAACACAGGTTGCTTGCCtcaaaaaacttaaaatgttctatgcttttgaatgaactTCCTGCCTAAAGGCAGATTATAATTAGGATAACTAATAACTATTTTTCCcctatttttcattattttaagcGCTACACCCCATGCAATCTCACTACATATTTGTAAGCAAGGGTCATGAAAAATGATCTCACCTTCCATCTGGTCCTGGCTGAAATCGACCTACACCGGACAGATCTACTCCCGCGGGTTTAGGTGGGGCCACGGGTTCCGGCGCGGGAGCGGGGGCAGGTGCGGGCTCTGCTTTCTTGGCAGGCTCGGGCTTCTTAGCGTCCTTCTTGGGTGCCATTTTTTTAGTCTATTTGTCCGCCGGGAGGGAAGTCAACACAGGGAGTGGACCACAGCTTGGAGGATACTCAGCATTCTCAATCCTGGACTCTTGGGAAAGGGAGTTAGTGGAGTCTGAAAGTCTTGAGGAGGCCTCAGCTGCTGATGCCCGTTACCCCTCAAAGCGCACAGATTGTGGTCCCCCAGCTGTCATCAGGGCTCACCCCTGCTGACTAGAAGCACCTTCTCTAAAAACCTGCCCCCATCCACCTGCCTATCAGAACCAACAACCCCCTCTCCAGCTCTTAATGATTTTAACAGCTAATTCACTTTTAGCCTACTTGGTTATTTGGCATGGTTGTTGGGATGGGGAGGAGTCATTAAGTTTGATGGAAGACACAAGACGTCTCAAGATAACTTCTCTAATATGCAGAAGGTTTGGCGTACCATACATTTTTGGCCTTCATTACaaaccttttttgttgttttttgttgtattttcctatcaaaataataaatgataaacaatatCTTAAGCACCACCCCCAGTCAACATGTATACATTCatggttattttaattactaatcATAATCagtaatcatatttaattactATCGTCTTACAATGCTAAGTTAAACAAATTTCATATtataatgcagtaaaaatactaTGGTGATTCTATTCCCAAGGTGTCTGTAGAGAATATTTACAATAACATATTGATTTTGATAGGTGTCTCTCACATTATCCCACAGATTAGggtacaatgttttataataatagtttattctatttagtgccctttgc

Function

NR:

description
myosin light chain 1, skeletal muscle isoform

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU105770 True 4665 lncRNA 0.38 8 18747911 18892052
TU105772 False 2675 lncRNA 0.39 6 18817138 18892052

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
znf148 znf148,LOC107673743,LOC107660621 coding upstream 7855 18734419 ~ 18740056 (+)
snx4 snx4,LOC107660619,LOC107741918,LOC107555933,LOC107714137,LOC107673751 coding upstream 14898 18721173 ~ 18733013 (+)
osbpl11 LOC107741915,LOC107555931,LOC107660623,LOC107596076,LOC107714164 coding upstream 39718 18692575 ~ 18708193 (+)
lss lss,LOC107714200,LOC107673746,LOC107660663 coding upstream 65709 18675151 ~ 18682202 (+)
LOC122351791 LOC107555929,LOC107660624,LOC107741913,LOC107714185,LOC107673745,LOC107596074 coding upstream 73173 18663351 ~ 18674738 (+)
hibch hibch,LOC107660603,LOC107714371,LOC107741945 coding downstream 750997 19643049 ~ 19666613 (+)
mstnb LOC107728928,LOC107602146,LOC107660602,LOC107657539 coding downstream 781208 19673260 ~ 19676836 (+)
osgepl1 osgepl1,LOC107660598 coding downstream 825210 19717262 ~ 19720435 (+)
zgc:136439 zgc:136439,LOC107660597,LOC107602150,LOC107728935 coding downstream 840303 19732355 ~ 19733971 (+)
slc40a1 slc40a1,LOC107660595,LOC107602151 coding downstream 849588 19741640 ~ 19748311 (+)
G71334 NA non-coding upstream 203913 18543774 ~ 18543998 (+)
G71333 NA non-coding upstream 206575 18540883 ~ 18541336 (+)
G71331 NA non-coding upstream 209211 18538480 ~ 18538700 (+)
G71221 NA non-coding upstream 717363 18028361 ~ 18030548 (+)
G71167 NA non-coding upstream 1105473 17641910 ~ 17642438 (+)
G71457 LOC107662043,LOC107555909,LOC107741926,LOC107556197,LOC107660610,LOC107721020 non-coding downstream 88261 18980313 ~ 18985811 (+)
G71509 NA non-coding downstream 358787 19250839 ~ 19251157 (+)
G71517 NA non-coding downstream 363978 19256030 ~ 19256233 (+)
G71581 LOC107741931,LOC107602131,LOC107660608,LOC107714367,LOC107657499,LOC107565025 non-coding downstream 714933 19606985 ~ 19607201 (+)
G71583 LOC107741931,LOC107660608,LOC107602131 non-coding downstream 723642 19615694 ~ 19620476 (+)
lmln lmln,LOC107741941,LOC107555912,LOC107673747,LOC107596075,LOC107714369,LOC107660656 other upstream 58369 18682672 ~ 18689542 (+)
plcd4b plcd4b,LOC107741909,LOC107673750,LOC107714237,LOC107660629,LOC107596071 other upstream 105425 18635106 ~ 18642486 (+)
tfcp2l1 tfcp2l1,LOC107673739,LOC107714264,LOC107596086 other upstream 128524 18611995 ~ 18619387 (+)
clasp1a clasp1a,LOC107741904,LOC107555920,LOC107660633,LOC107673735,LOC107714287 other upstream 136983 18549936 ~ 18610928 (+)
lrp1bb lrp1b,LOC107661145,LOC107660661,LOC107746259,LOC107714450 other upstream 783667 17736006 ~ 17964244 (+)
cps1 cps1,LOC107660611,LOC107741925 other downstream 4550 18896602 ~ 18931462 (+)
vwc2l vwc2l,LOC107660607,LOC107657506,LOC107714362,LOC106586444 other downstream 620802 19512854 ~ 19543677 (+)
G71585 NA other downstream 729232 19621284 ~ 19621493 (+)
ormdl1 ormdl1,LOC107602148 other downstream 817312 19709364 ~ 19714404 (+)
si:dkey-10c21.1 NA other downstream 1321343 20213395 ~ 20218120 (+)

Expression


Co-expression Network