G73385


Basic Information

Item Value
gene id G73385
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056707.1
NCBI id CM032076.1
chromosome length 26426558
location 26054867 ~ 26062832 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU108585
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>TU108588
gtttatgttatttattttattttttttagcaaagcaaAAAGACACTGATGAAGCTCTAGTGGACGTGGTAATCATGGATTTGCAGTCATTTTTAGTGGAGGAGAACGAGGGCTTCGTGGCAATTGTAATGAAGCTTGAGTCGGCATGTGCTTCATACAAGGCATGCAGTGAAGGACACAGTTGCTGCAAGGTATGAAATGACAAAATTGAAGGTGGTGGAGGAGATTTAAGAAAGCAAACACTGATAAACACATGAGACGTGAGCATGGATGCTTACCTTGTAACTTTTTTGAATTCCCTGAAGCTTAGCGCATTAAAGAAGGCGTCGGGAATAAGAGAGAGTCACTGACCATGCCTCAAACACGGCTCTTCAGATCAGACACAGTCTCTGCTTTGCTCACACCTTAAATCTCGTGGTGAAAAAGGCCTCTCTCAGACAGCAGATCAGTGCAAGAAGTGGTATCTTCTTCAGATCCAGCGCCGATGCCGCTGAGAAACCATCCACAATCCAGCCCAAAATGAGCTTATTCGGGAGGTGGAAGTGTGCATTCGTCTTGATTCCAAGGGTTTAAGGAGATGTTCGAACATCCTCGGACACCAACACTAGAGCCTTGGCCAGTGACTTCAAGCCCATTCCTCCTTCAATCGCGCAAAAAACAGTTGAACTTTCCGCTGAGAGGTTGGTCAAAGCTTCAAAGATCATACCTATTGTCAGAATGTAGTTCCATAAAATCAGTGAAAAGGCACAGAAACTGACCGTTGGCCTCGCAAACaacttgattaaaaatgaacaccTAGGAGCTGTAGAATCctatttttggattattttgGATCCCAGATTTCAGACTGTGCTGCTGAATGCAGTGCTTCAATGCTTTAGACGTCAAGAGAGCTTACACCACCTGATTCATTACAGCCATCTACTTCAGCACATTTTTACACActggacattttatttaaagctttacTGATATTATTGCAAATAGCGTCTTTCATTATGTTCGGGCCTAGTTATTGTGCTTTTACACTGTTTTGAACCAGCAGGTGTCAGCAGCGTCTGATGTTTTGAGAAGCAGTTGGTTCAACTGATCTGAAACTTTGTAAAGCTTCGATTCTACTGGCGCCAGTGAAACAGCAGTTCAGTATATTATTAGCAACAAATCCGTGGATGCACTTGAAGATGTTTGCTCTAATATCATTACTCTTAgctcacaaaaaatatttattctttggCCCCAAGAATGATTCGGGCATTTAAGGTCAAATACGACTCAAGCTTTTTTCCGTCACACTACATCCACAAGAAAACCCACATTTTTCATCAAACTGTATCTTATGTCAGGCTGAAATGTGACTCTTATGTAGgtatagccaacaatacattgcatgggtcaaaattatagattgggatattaagcaaagactgtgtttcatgaagatatgactgtaaatacatcaatacttcttttgattagtaatatgcgtTGCAAGAATTCATTTGGACGCTTTAAAGGTAGTTTTCTCAATTCTTTTGCAccatcagattccagattttcaatgTAAAGCAGCTTCAATATGATCTATAAAtctccatttaaaaataactgccgcttatgattggttttgtggcCCGGGGTCACATATGACATACTGTGCATTATATTTCTTGGTAATTAAAGAAGCAAGGTGTGAGATATTTAATCAAGGCATACATCCATATTCATACGGCAGAGCTTTTATTTCACTGTAGAAGAAATAGCAGGAACAAAATCTCCAGAAAAGTCTCATTTGTTCCCTCACGCTTCACGAAGAACAAGTGCAAATGAAGGTTATGCTTATGTCATgactcaaactaaaaaaaaatacacataaaagaTCCCAAAGTCACACCACACAGACTTAAGAGGATATAGTGAAAGTTCAAGTTAATTTAGAGAAACATCAAAACGACATATTATTATAGCAATGCAATAGGACTTAAGCATAAGTCAACAATTGAATAAAACGTGAAACAATCACTCGTCTTTCAAAATCAAGCCGACTGCGTGTGAAGATCGCAAGCcatacacaaaacaaatgtacataataaaagcaaaacaattaaatcGATTTACGGTAATCATGTTAAAGTAGGTGTGATTTAAAAATCTCATCTGTTTTGTTATAAACACACATAGCCATATAAcgttttaaaatggaaattattAACCACCATGGTGACTTCAACATGCAAAACCTTCATTATTGGATAGACCCGCGCTTCTGAAACGCTATTGCTTTACTTCGGGGAATAAAAGGGAATGCAGTCTGCATCTACAGTATCCAGTGAAAGCATTCGTTTTGCTCACAGGAGATGTTACAGACAATCATTTCGAGGGAACGGTTTACTGATGTGCAGCTGATATGACTCCAGATGTCTCTCCACCGCCATTATTAGCGTGAAAACACACCCACACTTTGGCATCGTGAGTATCCACACACAGCCTTCAAAACAGAGGTAAAAACTCTGATGGAAATAATATTTACACAAGCAGCATTCTCGGTACAGATTCttgcagcaacaaaaaaaaacagtaacagcTAAAGTGAATTTTCTTTGATTAACATTTGCgtgaatgcaaaacaaaaaaagtctccGATACCGATGATATTGCAGAACTTACAGTATGCTTTTTACTCGAGCatctataaaaagtaaatacgcCGACTACATTAAATACTGACCCTCAAGCAAGTGTCTGGCTTGAGGACACAATATGGCAATGTTAAATCTAGTATCGAATATActgaatatcatcaaaaagctGAACAATATGATACATGTGGTTAAGCTATATCACTTAGCCTTACGGTGAACCTCTAACTTTATATGAACAGAGTGTTTCTTCACCGGCCCGAAACATGAATACAAAAACTgtgatgcatgcattttaatgacagGACGGCTATTAATTGCCCGACTAACGGTCGATATTGTCTACACATTTAAAACTATACCTTTAGGGAAGTGAAAGTTGtgcaaaaaacccccaaaaagaaagcatttcaaataaaagtggAAAATGTCATCTCCCACACAACAATCACTGCTTTATTCGCTGGTATTACTATATGTACAGGCTTTACATCTAGAAGCTAAAAAGCGTAGCATTGGGATATAATTGAAAAATAGAGAAACACAAGACGAGACAGGGAGACGACGTGTCAAACCAGTTATTAGACAGTGCGTTTACTTGTAAACTAGCAATACTTTAAGGTCAGAAAGGCTAGAAAAAAGTGTCAGTACGTTAATTAAATCTGTAACAACTTAAGGAGAATTATAGTATAAATGTGAAAGATATACTTTTTTCGGTTTAGAGGTTGAGTATATGTATGGGTTAGTGTGAAGCaattataatgtgcattatttataCCTATAGGAAtggttaacaaaaaataaatcaataaacaaatatatttattcgatatatttcattttttgtgaaccatttctttaaaaacaatacgTCTATTTGGATAGCTAGGTAaatgcgcgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgagcaCAGTGAATCTTCTTTCCATCAACACTCCTTGTGCACTTTTGTATTAGACAAGCtgaaaaatgacataaaaagggAATTAGTTCACTCGTAATACCCTAAATTGCAATCTCTTTAGTGCATATTGATTGTTCAGTGAATCCTGTTTATTTTCTCCATagagaaaatgattttcagtaATACTATATAAGTTATATTAAGGCAGGAATCTGTAGACTGGAAAAAGCGTTATGGATTATggacagttttaaaaataccttaatgatggatttgtttcttacagacGTACAGCTTTTCGTTTCATACAACATTAACTGATTGACTGGAacggtgtggattacttgtgaattattgtgatgctttttttatcagctgttctgacggcacccattcgccgcaAGTGAAGCGATCGAATGCCACATCTCTCCAAATCTCTTCTAACGAAGAAACAGACTCATCTACATCCTGGATGGCCTGAGATTCAGTGCATTTCTCcgacaaaaaatgtttttcgaTGAATTATTCCTTCGAGTATTCATGTCGAATTAGATTTGCTTAAAACACACGATGATCTCAATAATAATCCATGTTCAGCAGCTAGCGGacctcacacacgctcacagctgatttaacatttttttctgtccgagtagtaaaaaaaaaacaaaacaacaacaacaaaagaggaTCACATGCTGTCTATCTTTGTCTGACACTTCCAGAGAGATGtgaatgatttattgttttCGACTGACTAACTGGATGGGAAAAAAATTGGGCAGAATTCAAACCGTTTTGGAAAGACACATAATGGTAAATGTCTGTTCCAGATGGATTACAATCAAATCTGTCAAACGCCGCCAATTTGGTCAAAATACTTGTTGCCATGCAAAGAAAGACATGATGGGATGGTACGGTGACGTGGATTGTTGCTATGACAACAGTACAGGGTGCTCACCTTTGGGGATCAGCATCTGCAAGCTTAGGAAAGGAGGctaattacaaaagaaaaagtaattaattcaaAACGACTGAGTAAATGGACAAAAAATGCATAGGGTTGGGTTACCGAAACCTAACTACCCAAGTAACCGAATTTCAGTGCCATGTCCGAACGACGATCCCAACAAATCTTTGCAGCACGGCGAGTGTGCTTGTTGTTTTCACGTTTCaacttaaaaacacaacttgAATAAGAGCACGTGAATGCAGATAGCCTTCCGTTAGCTAGCTGAGCTAAACGCGCTTCAACGCCTGAagctaagctaaagctaaaCCTGTTGTCCAACAAAAGAGATCATCATAACCGTTTTAATCCGCAATACCAGTCAAATGCTTCCTTTTGTCGAGTGTTTATCGTCTTT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Function

GO:

id name namespace
GO:0032400 melanosome localization biological_process
GO:0051875 pigment granule localization biological_process
GO:0051648 vesicle localization biological_process
GO:0045202 synapse cellular_component

KEGG:

id description
ko04080 Neuroactive ligand-receptor interaction
ko04727 GABAergic synapse
ko04723 Retrograde endocannabinoid signaling
ko05032 Morphine addiction
ko05033 Nicotine addiction

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU108585 False 4578 lncRNA 0.37 2 26056491 26061118
TU108588 True 7810 lncRNA 0.38 3 26054867 26062832

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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gcgb gcgb,gcg,LOC107730589,LOC107677918,LOC107722905,LOC107674768,LOC105907977 coding upstream 2380 26065212 ~ 26067013 (-)
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G73347 NA other downstream 261811 25790517 ~ 25793056 (-)
G73300 LOC107577510,LOC107663597,LOC107729051,LOC107728259,LOC107661178 other downstream 596125 25456414 ~ 25458742 (-)
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G73201 NA other downstream 1023902 25027585 ~ 25030965 (-)
LOC122351579 LOC107563831,LOC107730593,LOC107677922,LOC107674758,LOC107722906 other upstream 43825 26106657 ~ 26187631 (-)
fign fign,LOC107730568,LOC107722902,LOC107677893,LOC107674765,LOC107600675 other upstream 209544 26272376 ~ 26331126 (-)

Expression


Co-expression Network