prkag3b (prkag3b,LOC107738101,LOC107596559,LOC107752899,LOC107668376)


Basic Information

Item Value
gene id prkag3b
gene name prkag3b,LOC107738101,LOC107596559,LOC107752899,LOC107668376
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056707.1
NCBI id CM032076.1
chromosome length 26426558
location 7908087 ~ 7920562 (+)
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Sequence

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Function

symbol description
prkag3b Predicted to enable AMP binding activity; protein kinase binding activity; and protein kinase regulator activity. Predicted to be involved in cellular response to glucose starvation; protein phosphorylation; and regulation of catalytic activity. Predicted to act upstream of or within regulation of protein serine/threonine kinase activity. Predicted to be part of nucleotide-activated protein kinase complex. Predicted to be active in cytoplasm and nucleus. Orthologous to human PRKAG3 (protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma 3).

NR:

description
5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1-like

GO:

id name namespace
GO:0030554 adenyl nucleotide binding molecular_function

KEGG:

id description
K07200 PRKAG; 5'-AMP-activated protein kinase, regulatory gamma subunit

RNA

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Neighbor

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G68446 NA non-coding upstream 53809 7853481 ~ 7854278 (+)
G68435 NA non-coding upstream 571728 7335491 ~ 7336359 (+)
G68397 desma,LOC107688742,LOC107602901,LOC107716787 non-coding upstream 606592 7280767 ~ 7301495 (+)
G68424 NA non-coding upstream 644374 7262541 ~ 7263713 (+)
G68401 NA non-coding upstream 648693 7256680 ~ 7259394 (+)
G68668 NA non-coding downstream 283291 8203853 ~ 8205963 (+)
G68678 NA non-coding downstream 302025 8222587 ~ 8222817 (+)
LOC122351403 NA non-coding downstream 680162 8600724 ~ 8614984 (+)
G68808 NA non-coding downstream 905650 8826212 ~ 8827046 (+)
LOC122352063 NA non-coding downstream 938911 8859473 ~ 8860379 (+)
LOC122351907 LOC107670338,LOC107721263 other upstream 1934964 5962884 ~ 5973123 (+)
G68097 LOC107730457,LOC107670341,LOC107549918,LOC100537317,LOC107752618 other upstream 2022334 5883927 ~ 5885753 (+)
trnam-cau_112 NA other upstream 2450558 5457458 ~ 5457529 (+)
trnar-ccu_65 NA other upstream 2450824 5457191 ~ 5457263 (+)
trnam-cau_111 NA other upstream 2451244 5456772 ~ 5456843 (+)
si:ch211-167j6.3 NA other downstream 420733 8341295 ~ 8342751 (+)
sumo3b sumo3b,LOC107668404,LOC107596521,LOC107749883,LOC103392195 other downstream 510549 8431111 ~ 8433483 (+)
igf2bp2a igf2bp2a,LOC107749880,LOC107668393 other downstream 540182 8460744 ~ 8506143 (+)
cryba2b cryba2b,LOC107749902,LOC107562110,LOC107663929,LOC107566327,LOC107560461,LOC107672280 other downstream 942825 8863387 ~ 8866305 (+)
fev fev,LOC107749901,LOC107562104,LOC107663906,LOC107672289,LOC106581833 other downstream 946535 8867097 ~ 8871633 (+)

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