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Basic Information

Item Value
gene id abi2a
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gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056707.1
NCBI id CM032076.1
chromosome length 26426558
location 8026229 ~ 8055168 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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GGGAGGCGAAGCCGCTGTACTTCCTGTCGCCGGTTGCGCGAGGCGGGCGCGTGGAGGGATGTAAAGATGGCGGAGCTGCAGATGCTGCTGGAAGAGGAAATCCCAGCGGGTCGCAGAGCGTTACTGGACAGCTTCACCAACCTCGAAAGAGTCGCCGAATACTGCGAAAGTAACTACGTGCAGTCTCCAGACAAGCACGCCGCTTTAGAGGAAACCAAGAACTACACCACTCAGTCCCTGGCCAGCGTGGCCTACCTGATCAACACACTAGCCAACAATGTGCTCCAAATGCTCGACATCCAGGCGTCTCAGCTGCGCCGAATGGAGTCCTCCATCAACCACATCTCTCAGACGGTGGATATTCACAAAGAAAAAGTGGCGAGGCGGGAGATCGGCATCCTCACGACCAATAAGAACACCTCCCGCACGCATAAAATCATCGCTCCAGCCAATCCAGAGAGACCGGTGCGGTACATTCGCAAACCTATCGATTACAGCGCGCTGGATGATATCGGTCACGGTGTGAAGGTTAACACCCAGAACATGAAGATGGGTGGCCTTCTTCGCACCACACCTCCCACACAGAAACCGCCAAGCCCCCCAATGCCTGGAAAAGGCACCATAGGGAGACACTCCCCCTACAGGACGCTTGAGCCAGTGCGGCCTCCGGTGGTGCCAAATGACTACGTCCCCAGCCCCACACGCAATATGCTGCCCATTCTGCAGCAAAGTCCTGTGCGCACGGCTTCTGTTAATCAAAGGAACCGCACTTACAGCGGGAGCAGTGGCGGCAGTCATCCCAGCAGTCGCAGCAGCAGTCGTGAAAACAGCGGCAGTGGCAGTGTGGGTGTTCCCATCGCTGTGCCCACACCCTCTCCACCCAGCGCCTTCCCAGGTGGTCCTCAGTTCTACAGTATGAACAGGCCCGTCCCCAGGCAGATCTCCCCCACAGTGGGGGGTTCGCTGCCTTATCGCCGAGCACCCTCGATCTCGGGTCAGACTTCCATGCCCCCCAGCCAACAGAACGGAGGACCCCATTACAATCAGAACCAAGTTTCAGATGCGCCTCCTCCACCTCCCCCTTCAGAAGAGCCGGTGTTTGAGGAGACACAAAACCCAGTTCCACCCCCAGAAGACTACGAGGAAGAGGAGTCTTCTGTGGTGGAGTACAGTGACCCCTATGCTGAAGAAGACCCACCCTGGGCTCCACAAACTTACGTGGAGAAAGTGGTGGCAATCTACGACTACACGCAGGACAAGGAAGATGAATTGTCTTTCCAGGAGGGAGCCATCATATACGTCATTAAAAAGAATGACGATGGCTGGTTCGAAGGTGTGATGAGCGGCACTACAGGACTCTTCCCTGGAAATTACGTGGAGTCCATCATGCACTACACGGAGTGAGAGCGTCCTCCGTCTCTCCCCCAACCCTCAACGCCCACCAGCGCTAATCTTACACTGCAGAAGAGTGCATGTGTGCATACAAACCATGCTAATAACAGGCCGTGAGACTTCAGAGATGAGAGGTGCAACTGAAGAGAGGAAGCGACTTGGAGCCGGAAGACAGAGAAAAACACTATTagagaaataaaactatattaataaaCGCCAATAATATGTTTACTGTTGAATGAAGGATACAGAGTTTTGAAGTTCGGGATAAGCTAGATTTAGTGcgagtacatttttatttttggatatttcATAACCTTTGCTCGTTCCACAGCATTGTGGTGTTTTGGAAGGCAGCGCGGGGGCTGACTGACGTCtgaaatggatttgtttttgttttttgaacgGTCTGAGGTGGATTCGGGGTGCGCTTTACAGTGAGCTCACGCTCAAAAAGGGAGTTCATTACATTTATGTTGGAGCAAGGAAAGTGTGGAACTGAACAGAAAAAGCCAATATAGAGAAGAAGCTTTCTATTTATTACATGATGTGACAGCTCAaggtttttaaatttgtttgtaaAGTGTTTTAAGTAATTGTTTGAATTATCCTCTCCCATCTAATTAAAATCAGTTTGAGCCAGATGATATAGGAAATATTTGCACAAAGGTCTCACCCTGGTTTTACTATattgattaaatgtatttaatgtttgtttttccccccTGAGAATCGGTCAGCCCCAACACAAATGCAGTAGACATATCTAATAACCTCATGAactgttttactttttgtttgttttacatttaaatattgtgtCATGATGCTAACCGTTTGGTTAATATTTGATACGTGTATGTAGTGCTTAATAGACTGcatgcttaataaaaaataaaccttatttacatttaatttcttttttttcctttcacattttatttatagagtTCCCACAGTTATGGAAAACTTAAAATATCTGGAAATGTTAAACTAGTGATTTTTAGTcttctcaacatttttttttttagtggtcTGAATTATTTCATCAGCTAAAACTGCAACTGCATGAAACATATTTTTGGTTGTGGGACATTTTGAgacatttacataataatacagtttatcTATTCATTCATGTTAGCACCTGACATTGAAAAATCCTCCAATAGTAGTGATCATCTAGAAAGGTTACCAAATGTTGTGGTACGCGGACAGTTAAAGTCCAAACGTTACAGTATTAATTTGGGTGCTCTTTGTCtttatgctaaatatattgTGCCATTTTGGAGTATTACTGAAATGTGTATAAGCTACTATTTGACAATCACAggtctctttctctccagctACTAGAGCAGTTTTCCATTTTGCAGGTCTTAAAATAAGCAAGTCTTCGTTGCGTCTCCATAgtgaaatttaatttgaatcttATGTAAAGAACAGATGGAGGTTGTTTAAAGCAGGGTAGAGTCAGGTGagctcatctctctctctctctctctctctacttaacaataaaatgtgatgtttaaagggttaatttACCTCTGTTTGAAAGCACATCACTCTAAACACCAGTGTTGACATTTTAACaaagagtaattttttgtaAACCCGTTAACTCTATATTCTTGTGTgcaaatatatgtgtatatatatataactgaataaaagtcCTGGACATAAGTA

Function

symbol description
abi2a Predicted to enable SH3 domain binding activity. Predicted to act upstream of or within actin polymerization or depolymerization. Predicted to be located in cell junction; cytoskeleton; and filopodium. Predicted to be active in lamellipodium. Orthologous to human ABI2 (abl interactor 2).
abi2 Enables several functions, including SH3 domain binding activity; identical protein binding activity; and ubiquitin protein ligase binding activity. Contributes to small GTPase binding activity. Involved in Rac protein signal transduction; positive regulation of cellular component biogenesis; and zonula adherens assembly. Acts upstream of or within peptidyl-tyrosine phosphorylation. Located in several cellular components, including filopodium tip; lamellipodium; and nucleoplasm. Part of SCAR complex. Is active in adherens junction. Colocalizes with actin filament.

NR:

description
PREDICTED: abl interactor 2-like isoform X12

GO:

id name namespace
GO:0005737 cytoplasm cellular_component

KEGG:

id description
K05751 ABI2; abl interactor 2

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network