impg2a (impg2,LOC107748205,LOC107655518,LOC107600387,LOC107720123)


Basic Information

Item Value
gene id impg2a
gene name impg2,LOC107748205,LOC107655518,LOC107600387,LOC107720123
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056707.1
NCBI id CM032076.1
chromosome length 26426558
location 10185746 ~ 10200828 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
impg2 Predicted to enable heparin binding activity and hyaluronic acid binding activity. Predicted to be involved in visual perception. Predicted to act upstream of or within extracellular matrix organization; protein localization; and retina morphogenesis in camera-type eye. Part of receptor complex. Implicated in retinitis pigmentosa 56 and vitelliform macular dystrophy.

NR:

description
PREDICTED: interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 isoform X2

GO: NA

KEGG:

id description
K19017 IMPG2, SPACRCAN; interphotoreceptor matrix proteoglycan 2

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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piga piga,LOC107748211,LOC107555234,LOC107663925,LOC107655498,LOC107600385,LOC107720146 other upstream 72390 10092350 ~ 10113356 (+)
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LOC122351827 LOC107568346,LOC107676221,LOC566927,LOC107706103,LOC107706102,LOC108412955 other upstream 1024925 9156045 ~ 9160821 (+)
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G69527 arhgap15,LOC107563181,LOC107673132,LOC107709415,LOC107555858,LOC107675340,LOC107711394 other downstream 1845671 12046499 ~ 12155804 (+)
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Expression


Co-expression Network