usp9 (usp9,LOC107748163)


Basic Information

Item Value
gene id usp9
gene name usp9,LOC107748163
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056707.1
NCBI id CM032076.1
chromosome length 26426558
location 16152577 ~ 16180163 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043249655.1
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Function

symbol description
usp9 Predicted to enable cysteine-type endopeptidase activity and thiol-dependent deubiquitinase. Predicted to be involved in cell migration and protein deubiquitination. Predicted to act upstream of or within ubiquitin-dependent protein catabolic process. Predicted to be active in cytosol and nucleus. Is expressed in endodermal cell; myotome; nervous system; pectoral fin; and solid lens vesicle. Human ortholog(s) of this gene implicated in Y-linked spermatogenic failure 2; female-restricted syndromic X-linked intellectual disability 99; and non-syndromic X-linked intellectual disability 99. Orthologous to several human genes including USP9X (ubiquitin specific peptidase 9 X-linked).

NR:

description
PREDICTED: probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X isoform X1

GO:

id name namespace
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GO:0004843 thiol-dependent ubiquitin-specific protease activity molecular_function

KEGG:

id description
K11840 USP9_24; ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 9/24

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122351678 hspe1,mob4,LOC107690609,LOC107595852,LOC107569672,LOC107731766,LOC106586370,LOC105016277,LOC100701317,LOC103156730,LOC101472107,LOC102310674,LOC102783361,LOC108238849,LOC107690608,LOC106582314,LOC105899369 other upstream 436676 15708201 ~ 15715901 (+)
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Expression


Co-expression Network