sh3pxd2aa (sh3pxd2a,sh3pxd2aa,LOC107692111,LOC107746291,LOC107746053)



Basic Information


Item Value
gene id sh3pxd2aa
gene name sh3pxd2a,sh3pxd2aa,LOC107692111,LOC107746291,LOC107746053
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056699.1
NCBI id CM032068.1
chromosome length 31761587
location 23064152 ~ 23147300 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043239630.1
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aaaacacaataaaatgtatccTCCTTGTTCTTATAA

Function


symbol description
sh3pxd2aa Predicted to enable superoxide-generating NADPH oxidase activator activity. Acts upstream of or within neural crest cell migration and posterior lateral line neuromast primordium migration. Predicted to be located in podosome. Predicted to be active in cytoplasm. Orthologous to human SH3PXD2A (SH3 and PX domains 2A).
sh3pxd2a Predicted to enable superoxide-generating NADPH oxidase activator activity. Involved in osteoclast fusion and superoxide metabolic process. Located in podosome.

NR:

description
PREDICTED: SH3 and PX domain-containing protein 2A-like isoform X1

GO:

id name namespace
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GO:0016175 superoxide-generating NAD(P)H oxidase activity molecular_function
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KEGG:

id description
K24032 SH3PXD2; SH3 and PX domain-containing protein 2

RNA


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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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Expression



Co-expression Network