grk4 (grk4,LOC107665967,LOC107723186,LOC107692618,LOC107758889)



Basic Information


Item Value
gene id grk4
gene name grk4,LOC107665967,LOC107723186,LOC107692618,LOC107758889
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056699.1
NCBI id CM032068.1
chromosome length 31761587
location 7624106 ~ 7648594 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043240119.1
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Function


symbol description
grk4 Predicted to enable protein kinase activity. Acts upstream of or within induction by symbiont of host I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade. Predicted to be active in cytoplasm. Human ortholog(s) of this gene implicated in essential hypertension. Orthologous to human GRK4 (G protein-coupled receptor kinase 4).

NR:

description
PREDICTED: G protein-coupled receptor kinase 4 isoform X2

GO:

id name namespace
GO:0038032 termination of G protein-coupled receptor signaling pathway biological_process
GO:0006468 protein phosphorylation biological_process
GO:0085033 induction by symbiont of host I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade biological_process
GO:0005524 ATP binding molecular_function
GO:0004703 G protein-coupled receptor kinase activity molecular_function

KEGG:

id description
K08291 GRK4_5_6; G protein-coupled receptor kinase

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_043240125.1 False 6127 mRNA 0.38 16 7624106 7648594

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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G1660 knstrn,LOC107723170,LOC107564216,LOC107758858,LOC107586895 non-coding downstream 311208 7312252 ~ 7312898 (-)
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G1809 LOC107723197,LOC107692608,LOC107564078 non-coding upstream 94901 7743495 ~ 7797446 (-)
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dmd dmd,LOC107692624,LOC107723158,LOC107665951,LOC107758879,LOC107565081 other downstream 328277 7204004 ~ 7295829 (-)
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LOC122342514 NA other downstream 1079548 6533501 ~ 6544558 (-)
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mgarpb LOC107692675,LOC107742504,LOC107714221,LOC107563974,LOC107562972 other upstream 843550 8492144 ~ 8500212 (-)
G1926 NA other upstream 907446 8556040 ~ 8607795 (-)
LOC122351550 LOC107656542,LOC107747394,LOC107562929,LOC107721426,LOC107707229,LOC107658053,LOC107751937,LOC107661411 other upstream 1130618 8779212 ~ 8798355 (-)
G2302 slc25a4,LOC107656452,LOC107562743 other upstream 2708587 10357181 ~ 10401686 (-)
LOC122347930 dnah6,LOC106610484 other upstream 3086376 10734970 ~ 10799609 (-)

Expression



Co-expression Network