muc13a


Basic Information

Item Value
gene id muc13a
gene name NA
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056699.1
NCBI id CM032068.1
chromosome length 31761587
location 21738022 ~ 21756866 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043244789.1
ATGCCTTTCTTGCCTAACAGCAGaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaagCCACGACTATTACTACAGtaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaaccacAACTACAGCTTTATCgaccacatctccaacaacgagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccactactcttactacaataccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatcagcagctgtaacatctgaagccacgactcttactacaataccttcaacttcagagagtacaccagcacaaaccacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaagCCACAACTCTTACTACAAtaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcGTCAACCACATatccaacaacaagcaatccaacaacatccgcAGCTGTAACGTCTGAATCCATGACTCTTACTACAAtaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaaccacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaaaCCACGACTCTTACTACAAtaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatcagcagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAGTAActtcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatctgcagctgtaacatctgaatccacgactcttactacaataccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcAGCTGTAACGTCTGAATCCACGACTCTTACTACAAtaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaaccacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcAACTGTAACATCTGAAATCACGACTCTTACTACAAtaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatcagcagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAGTAACTCcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgttacaccagcacaaaccacAACTACAGCTTCttcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccactactcttactacaaaaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaattacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccactactcttactacaataccttcaacttcacagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccactactcttactacaaaaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccactactcttactacaaaaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccaCGATTCTTACTACAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaagccacgactcttactacaataccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaagccacgactcttactacaataccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAAAACCTTCAACTTCAGAtagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccactactcttactacaataccttcaacttcacagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccactactcttactacaatacctttaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccaCGATTCTTACTACAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaagccacgactcttactacaataccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaagccacgactcttactacaataccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAAAACCTTCAACTTCAGAtagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccactactcttactacaataccttcaacttcacagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccactactcttactacaatacctttaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccacgactcttactacaataccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccaCGACTCTTACTACAAAACCTTCTacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaagCCACGACTCTTACTACAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaagccacgactcttactacaataccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccactactcttactacaaaaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaattacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccactactcttactacaataccttcaacttcacagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaagCCACAACTCTTACTACAAtaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaattacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaaaATCCACAGCTGTAACTTCTGAATCCACGACTCTTACTACAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcAGCTTTAACATCCGAATCCACGACTCTTACTACAAtaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaaccacAACTACAGCTTCttcaaccacatctccaacaacaagtaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccacgactcttactacaataccttcaacttcagagagtacaTCAGCAAAAACcacaactacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccaCAACTCTTACTACAAAACCTTCAACTTCAcagagtacaccagcacaaactacaattacagcttcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccacagctgtaacatctgaatccaCGACTCATACTACAATACCTTCAATttcagagagtacaccagcacaaactacaactacagattcatcaaccacatctccaacaacaagcaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccTCTACTCTTACCTCAAAaccttcaacttcagagagtacaccagcacaaactacaactacaacttcttcaaccacatctccaacaacaagtaatccaacaacatccgcagctgtaacatctgaatccactactcttactacaCTGTGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043244789.1 True 6180 mRNA 0.42 5 21738022 21756866

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122348885 NA coding downstream 1314 21734334 ~ 21736708 (-)
LOC122337558 LOC107552383 coding downstream 3309 21713527 ~ 21734713 (-)
si:dkey-56e3.3 LOC107719778,LOC107689468,LOC107552374 coding downstream 25454 21707938 ~ 21712568 (-)
mogs mogs,LOC107719770,LOC107689467,LOC107551727,LOC107567052,LOC107692169 coding downstream 46649 21687227 ~ 21691373 (-)
LOC122342104 LOC107689469,LOC107551743,LOC107719777,LOC797711,LOC107711522,LOC107567046,LOC107692200 coding downstream 58492 21676087 ~ 21679530 (-)
LOC122348917 LOC107720307 coding upstream 51925 21808791 ~ 21812589 (-)
LOC122348927 NA coding upstream 70690 21827556 ~ 21832934 (-)
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dtx4b dtx4,LOC107676128,LOC107551788,LOC107692161,LOC107746726,LOC107603012 coding upstream 110126 21866992 ~ 21882353 (-)
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G4934 NA non-coding downstream 1269007 20466162 ~ 20469015 (-)
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G5368 lipt1,LOC107676853,LOC107712244,LOC107692196,LOC107567789,LOC107603034,LOC107715555,LOC107718931 non-coding upstream 655596 22412462 ~ 22414007 (-)
G5395 NA non-coding upstream 677747 22434613 ~ 22438354 (-)
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si:dkey-37g12.1 LOC107692174,LOC107711524 other downstream 173945 21549617 ~ 21564077 (-)
ctnna2 ctnna2,LOC107689479 other downstream 327451 20906170 ~ 21410571 (-)
G4958 NA other downstream 1051282 20683842 ~ 20686740 (-)
timm10 timm10,LOC107674252,LOC107746912,LOC107556822 other downstream 1368911 20367129 ~ 20369111 (-)
zdhhc5a zdhhc5a,LOC107730508,LOC107551501,LOC107746524,LOC107674225,LOC107556824,LOC107664565,LOC108412478 other downstream 1425074 20289317 ~ 20312948 (-)
LOC122348907 NA other upstream 5015 21761881 ~ 21799744 (-)
G5356 LOC107561873,LOC107676873,LOC107712236,LOC107692142,LOC107603029,LOC107718585 other upstream 502573 22259439 ~ 22328929 (-)
LOC122348696 sept3,LOC107718600,LOC107551931,LOC107603027,LOC107692148 other upstream 515952 22272818 ~ 22287521 (-)
atp11a atp11a,LOC107676866,LOC107692133,LOC107718450,LOC107746295 other upstream 782818 22539684 ~ 22602648 (-)
itsn1 itsn1,LOC107746280,LOC107718832 other upstream 1107965 22864831 ~ 22903414 (-)

Expression


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