LOC122352567 (ywhah,LOC107562560,LOC107744159,LOC107713377,LOC107555530,LOC107688000)


Basic Information

Item Value
gene id LOC122352567
gene name ywhah,LOC107562560,LOC107744159,LOC107713377,LOC107555530,LOC107688000
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056708.1
NCBI id CM032077.1
chromosome length 16503406
location 5238279 ~ 5250137 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU110925
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>TU110926
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>XR_006251886.1
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>XR_006251887.1
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Function

symbol description
ywhah Predicted to enable monooxygenase activity. Is expressed in central nervous system; head; neural tube; neurons; and otic vesicle. Orthologous to human YWHAH (tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein eta).

NR:

description
14-3-3 protein eta

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU110925 True 3526 TUCP 0.44 4 5244590 5250137
TU110926 False 3139 TUCP 0.42 3 5238428 5250137
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XR_006251887.1 False 1021 lncRNA 0.42 3 5238279 5239558

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122352997 LOC107711241,LOC107672456,LOC107588012,LOC107670466,LOC107757355,LOC107567234 coding upstream 170742 5058497 ~ 5067537 (+)
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LOC122352867 LOC107711243,LOC107672495,LOC107587952,LOC107757372,LOC107567248,LOC107670491 coding upstream 192741 5038846 ~ 5045538 (+)
LOC122352868 LOC107587995,LOC107711162,LOC107672432,LOC107757375,LOC107587996 coding upstream 199774 5035033 ~ 5038505 (+)
LOC122352870 NA coding upstream 203795 5032154 ~ 5034484 (+)
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pigo pigo,LOC107713385,LOC107686475,LOC107744133,LOC107687847 coding downstream 232628 5482765 ~ 5491729 (+)
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G74906 NA non-coding upstream 150688 5087280 ~ 5087591 (+)
G74902 LOC107560569,LOC107739969 non-coding upstream 164073 5073928 ~ 5074206 (+)
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G75077 NA non-coding downstream 393412 5643549 ~ 5643766 (+)
LOC122352404 LOC107670527,LOC107567246,LOC107587997,LOC107757377,LOC107711240,LOC107672489 other upstream 114906 5116866 ~ 5123373 (+)
LOC122352783 tln1,LOC107715875,LOC107670039,LOC107568645,LOC107702558 other upstream 709277 4481267 ~ 4529002 (+)
LOC122352388 tln1,LOC107715875,LOC107670039,LOC107568645,LOC107702558,LOC107737170 other upstream 1117832 4013034 ~ 4120447 (+)
cdc42se2 cdc42se2 other upstream 1543683 3669003 ~ 3694596 (+)
zgc:113274 LOC107715885,LOC107702590,LOC107720383,LOC107560406 other upstream 1570273 3663912 ~ 3668006 (+)
G74965 NA other downstream 6701 5256838 ~ 5258823 (+)
ccl19b LOC107744181,LOC107677997,LOC107567444,LOC107555521,LOC107713300,LOC107688602,LOC107713257 other downstream 248510 5498647 ~ 5500388 (+)
G75062 LOC107744182,LOC107678054,LOC107567441,LOC107713390,LOC107687817 other downstream 310514 5560651 ~ 5562085 (+)
lrrtm4l1 lrrtm4l1,LOC107730422,LOC107553720,LOC107687748,LOC107720738,LOC107561403 other downstream 811054 6061191 ~ 6089587 (+)
LOC122352486 LOC107720590,LOC107677990,LOC107553711,LOC107705075,LOC107586209 other downstream 1203928 6454065 ~ 6472107 (+)

Expression


Co-expression Network