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Basic Information
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| gene type |
misc |
| species |
tiger barb (Puntius tetrazona) |
| category of species |
ornamental fish |
Chromosome Information
| Item |
Value |
| chromosome id |
NC_056708.1 |
| NCBI id |
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| location |
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Sequence
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Function
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pcdh1gc5
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Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane. Is expressed in brain and female organism.
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pcdh1gb9
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Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane.
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pcdh1gb2
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Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane.
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pcdh1g32
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Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane. Is expressed in brain.
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pcdh1g9
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Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane.
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pcdh1g11
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Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane.
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pcdh1g1
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Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane. Is expressed in brain.
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pcdh1g2
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Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane. Is expressed in brain.
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pcdh1g3
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Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane. Is expressed in brain.
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pcdh1g18
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Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane.
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pcdh1g33
|
Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cell adhesion. Predicted to act upstream of or within homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane.
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NR:
| description |
| PREDICTED: protocadherin gamma-C5-like isoform X4 |
GO:
| id |
name |
namespace |
|
GO:0007156
|
homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules |
biological_process |
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plasma membrane |
cellular_component |
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integral component of membrane |
cellular_component |
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|
calcium ion binding |
molecular_function |
KEGG:
| id |
description |
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K16497
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PCDHGC; protocadherin gamma subfamily C |
RNA
Neighbor
| gene id |
symbol |
gene type |
direction |
distance |
location |
| LOC122353116 |
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coding |
upstream |
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coding |
upstream |
52388 |
7142303 ~ 7145149 (+) |
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downstream |
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downstream |
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downstream |
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upstream |
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NA
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upstream |
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NA
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upstream |
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NA
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NA
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NA
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downstream |
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|
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upstream |
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upstream |
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trpc7a,LOC107677994,LOC107720592,LOC107552051,LOC105905985,LOC108437819,LOC106603261
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upstream |
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NA
|
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NA
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NA
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| trnat-agu_2 |
NA
|
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downstream |
521765 |
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Expression
Gene
RNA
