XLOC_006595


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_006595
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 23212759 ~ 23217818 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00013781
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>TCONS_00013783
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>TCONS_00013782
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00013781 False 4585 lncRNA 0.35 2 23212759 23217634
TCONS_00013783 False 4915 lncRNA 0.35 2 23212759 23217818
TCONS_00013782 True 4851 lncRNA 0.35 2 23212759 23217818

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_006594 kifbp coding downstream 117753 23083858 ~ 23095006 (-)
XLOC_006593 srgn coding downstream 138305 23070581 ~ 23074454 (-)
XLOC_006592 vps26a coding downstream 145378 23058268 ~ 23067381 (-)
XLOC_006591 supv3l1 coding downstream 160993 23037585 ~ 23051766 (-)
XLOC_006590 hkdc1 coding downstream 180956 23017498 ~ 23031803 (-)
XLOC_006596 si:dkey-103j14.5 coding upstream 16138 23233956 ~ 23270576 (-)
XLOC_006597 NA coding upstream 190211 23408029 ~ 23411631 (-)
XLOC_006598 prim2 coding upstream 270464 23488282 ~ 23612369 (-)
XLOC_006599 map3k21 coding upstream 416999 23634817 ~ 23666579 (-)
XLOC_006600 rgs17 coding upstream 510358 23728176 ~ 23756700 (-)
XLOC_006471 BX537274.2 misc downstream 12947854 10264741 ~ 10264905 (-)
XLOC_006338 rn7sk misc downstream 22386534 825904 ~ 826225 (-)
XLOC_006585 BX530068.1 non-coding downstream 365275 22843830 ~ 22847484 (-)
XLOC_006582 CR550304.1 non-coding downstream 428326 22778060 ~ 22784433 (-)
XLOC_006578 BX649385.1 non-coding downstream 1017591 22191361 ~ 22195168 (-)
XLOC_006577 NA non-coding downstream 1272794 21925701 ~ 21939965 (-)
XLOC_006570 NA non-coding downstream 2065377 21146114 ~ 21147382 (-)
XLOC_006602 AL772289.1 non-coding upstream 743474 23961292 ~ 23961406 (-)
XLOC_006605 CR762497.2 non-coding upstream 909245 24127063 ~ 24127179 (-)
XLOC_006607 CR762497.1 non-coding upstream 1065852 24283670 ~ 24286390 (-)
XLOC_006611 NA non-coding upstream 1129171 24346989 ~ 24351543 (-)

Expression


Co-expression Network