nrg1 (nrg1,LOC107575152,LOC107681480)


Basic Information

Item Value
gene id nrg1
gene name nrg1,LOC107575152,LOC107681480
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056708.1
NCBI id CM032077.1
chromosome length 16503406
location 4358660 ~ 4407937 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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ATCTAGCCACTTAAGGGGGATTGATTTAGaaacatgtttaaatgcattaattattctTCCATTGTGTTTGGTGACTCCAGAGGTGCATAAATTACACCATTTACTCTTAACTACTAATGATATCTTCCAGATGACCATTTTGGTGGCTAAACAGCATGAACCCCTGGATATATTCGTATGTTGtggtttttgttgtgtttatagAATTAGTCACTCTTTCTCACATTATTACATTCTTTTCTGTTtgatgaaataaagaaaagatggTTACAAATATG

Function

symbol description
nrg1 Predicted to enable chemorepellent activity and protein tyrosine kinase activator activity. Acts upstream of or within several processes, including enteric nervous system development; fin regeneration; and neurogenesis. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in extracellular space. Is expressed in gut; heart; nervous system; and somite. Human ortholog(s) of this gene implicated in several diseases, including bipolar disorder; cerebral malaria; dementia; middle cerebral artery infarction; and psychotic disorder (multiple). Orthologous to human NRG1 (neuregulin 1).

NR:

description
PREDICTED: pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0001755 neural crest cell migration biological_process
GO:0036135 Schwann cell migration biological_process
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GO:0009790 embryo development biological_process
GO:0021778 oligodendrocyte cell fate specification biological_process
GO:0005102 signaling receptor binding molecular_function

KEGG:

id description
K05455 NRG1; neuregulin 1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_043250408.1 False 5278 mRNA 0.39 6 4358660 4375147

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G75454 LOC107552069,LOC107678002,LOC107586137,LOC107687386,LOC107742371,LOC108437806 other upstream 2769387 7177324 ~ 7180821 (-)
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Expression


Co-expression Network