ddx4 (LOC107665473,LOC107715859,LOC107740783,LOC107670045)


Basic Information

Item Value
gene id ddx4
gene name LOC107665473,LOC107715859,LOC107740783,LOC107670045
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056708.1
NCBI id CM032077.1
chromosome length 16503406
location 4209639 ~ 4229765 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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>XM_043250411.1
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Function

NR:

description
probable ATP-dependent RNA helicase DDX4 isoform X2

GO:

id name namespace
GO:0008406 gonad development biological_process
GO:0043186 P granule cellular_component
GO:0005524 ATP binding molecular_function
GO:0003676 nucleic acid binding molecular_function

KEGG:

id description
K13982 DDX4, VASA; probable ATP-dependent RNA helicase DDX4

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC122352388 tln1,LOC107715875,LOC107670039,LOC107568645,LOC107702558,LOC107737170 other upstream 89192 4013034 ~ 4120447 (+)
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si:ch73-234b20.5 si:ch73-234b20.5,LOC107702596,LOC107558257,LOC107653492,LOC107573851,LOC107732123,LOC108440734 other upstream 605423 3596606 ~ 3604216 (+)
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LOC122352404 LOC107670527,LOC107567246,LOC107587997,LOC107757377,LOC107711240,LOC107672489 other downstream 887101 5116866 ~ 5123373 (+)
LOC122352567 ywhah,LOC107562560,LOC107744159,LOC107713377,LOC107555530,LOC107688000 other downstream 1008514 5238279 ~ 5250137 (+)
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ccl19b LOC107744181,LOC107677997,LOC107567444,LOC107555521,LOC107713300,LOC107688602,LOC107713257 other downstream 1268882 5498647 ~ 5500388 (+)

Expression


Co-expression Network