phf24 (phf24,LOC107677982,LOC107713387,LOC107744162)


Basic Information

Item Value
gene id phf24
gene name phf24,LOC107677982,LOC107713387,LOC107744162
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056708.1
NCBI id CM032077.1
chromosome length 16503406
location 5519168 ~ 5545588 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043251116.1
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>XM_043251117.1
AAACAAGTTCCACGAAGAGGATCGAAGAATATTGGATTCTCGCGAATCTAGCGGGCTGGTCAGCTGAAGCAGCAGGCgcaactttttttccccccaggcTTGTGTTTATTTACGCGAGCTGTACGGCGCCCAGAGCGAAGTTTACGCTCCAGAATTCAGCACCGGAGCTGTCCAGCTTCTCAGCTCGCGCCTCAAAACGACGCTGTTTTCTCGGCTGCGGAATATTTGTTTGACTGGGTTACACACACCGTGCACACACTGACCGCCGCGATCACACTACGCGCATAGCGTTCATTGACGGAAGCGAGCCTTGAAATGACCGCCGGCAGCGCGTGAGGGGAGAAGAAGAAATCGAGTCCCGAGTACCGGAGCACCATCCCATTTCCTTCAGCCATGGGTGTGCTGATGTCCAAGAAGCAGCAGGTGGAGAAGGTGCAGAAGTGCAGCGCGGTGGTGTCGGCGTTTAAAGACGGTCTGAAGGACCGGGCGGCCCCGGCGGCCGAAGAGGTCGTAGCTGAGAACGGGGACGAATCTGCCGAAGGATCCCAACAGGCGAACAAGGAGCGTACTGAACAGAAAGACAAGGACAGCAAAGCAGGCTCATTACCAAATCAACAGGCCTCAGCTCCGCTCAGAGAGGAGCAGAAGGCCAATCAGGAGGCTTGGGGGCGGCTCCGCGATGGGAAGGGGGTGGAGCCCGAGGATCTAAAGAAGGCACATCAGCTCACTCCTCCCGCCTTTGTGAGGCCAAAGAGAGAGGTCAATGACGACCAACCAGTAGACGTGCCGCTTGGGCAAAGAGAGCAGCCCGTGAACGACGAGATGTGCGAGGTGTGTGAGGTTTGGACGGCAGACGATCTGTTTCCCTGCCGAACGTGCACGAGGGTCTTCCACGACGGCTGTCTGCGGGAGATGGGTTACCTGAGCTCTGAAGCCCTGCAGGAAATGAGAGAGACGGCCCACACCACCACCGGCTGGAGCTGCTATTACTGCGATAATGTGAACCTGCTGCTTACCGAAGAAGAGATGTACAGTCTGATGGAAACCTTCAAGCAGTGCAAGATCATCCCAGAGTCGTGCCTGGTGTCAGATGAACTCCTGCAGTACAGGCACTTTGTGACCAAGCAGCTCTTCGAAAGAGATTTGACcgatgaggaggaagaggaggttCTGGCCCAGTTTGCAGCTCTGGATCCAGACAAGAAGGGTCAGATCGAGTGGTCGGACTTCCTCTACCACGAGTCACTTTCAGTGCTGCAGAAGTTCCGGACCGAGAATTCGCTGGTGAGAATCCTCACAGCGAAGGAGAAGGATCGAGCACGGGCCGTGTTTCAGAGTATAGACCAGGACAAAGATGGGATCATTACTGCTGGAGAAGCCAGAAAAGCCCAAACCTCCTGGTTCCACAAGATTAACAAAGAATCCCAGTCCTGCAGTGTCAGTATCAGCCATGTAGGTCCAATATCTGAGAGCAGTCCTGCCAGTTCCAGCAGCGAGCGAAGCAGAGATAAAGCCTTGGAAAATGATAACAGACCCGTTACCTGGGCCAACTTCCTGCGGGAGAGCGCCATCTACATCCTTGCTGCGAGGCCCAACAGCCCAGCCATGCACATCCGCTTACCACTCTAACCCTGGCCACATAGCCTGAGACTTCCAGAGGGGCTTCCCGGGTCCAGATTCACAAGAGAGCGGCGCTGAGGACTAAACTGAAAGTCACACGAGAGTCAAACGCTAAAGAGTACGCCACCACACGCTAAGACTGTACAAGGCATCGACGGATTCTTCCTCTAACGACACAATCTAATAGCGACACTGACAAATTCAACGCTACTGAATAGCACATCTGTCACCACTTCTTGAGCTTTTTACGAGCTTGTATGGTTTCCGTTTTTGTGACAAAGTAACTGTTTTGATCAGAGAAGCTGCTGCAAGAAACACCGTCAAGCATTGTGTTTTTGATGTTAACGTGTTGTATCATTTTTGAGTTGGGTGAGTTGCGATCGATGGATCCATGCGAGAGCAGTGGTTGAATCATTGCTGATCTAATTTCAGTCAccacaaaatatgaatataatatagtGGGCAGCAGTTGTGCCATACAGGAATTAAAGTGAGATGCTATGATATACTATATACAGtctatatacatacaaaatgtatttattcccATACTTTCAGGGATGGATTATGGACTAGGCCAAGGAGCTTCCAGACTGCCAGGGGCCTAAAGCTGTGACATAGGAAAACAATTGAAATTGTTGACAGACAACCACTACCACTAACTAAGATACTGGATATACTAAAAAGGTTTGCATCAGTTTGAATTTTCACTTGACAACGTGCGTGTCAGAATTATCAGaagctgtaatttttttttttatattgtattttatattgtatttctaTGTGAAACATGATAAGGAGGCGGAACTTAATTTTAGCTAGATTGTGAAGTACGATCTTCATTTCTAAAATTCAGTGAGCTGCCAGTTTAGGCAGTATTTCAAGGCAACGTGGGAATGTTTCTGATGCAAAATCTGTATAGGCAGCATATATTAGCAAATTAATAGTGAAAAtcgtataaaaaatatttgtatgtaattttaaaaatgcgaTTTTACCcagtatttgtatatttatagctAGTTGAGTTTTGATTTGTTAGCTAGCAAACGTTAATTCCAAATTCCATTGAAATTTAACTGAGATAGGtcttattataattatcataCTCTTTAAggtaaatcattttaacttaTAATActtatgattaattaaataaaatgactttaattaaacataattaaaattaattatgttaacccatatttgtttgtgtgtatgggGTTATTAGAGAGTTGCATTGTTAGCATAagctacattttaattacaaaccAATTTCTATTGAAACTAATTCAATCGAGTCATAATTCTGATACTTTTAAggtactttattttgattaacactattttaaaatcGAATTAAATATctaacttatttattatttcaccCAATATGAGTGTTTTTTTGCGTTTTAGAGTGCTGTTTCATTAGCTTAGCATGTTGCTAAAACTATGTtgcaaaactattaaaattgattttgaatCAAGTTTCTGCATAATTATCTTCTTTCTATGATAACTCATTTTGACCTTCAAGTATGGATAAGTATGGATTGCCCAAAtatttgttgtatatttttctaCCTAAGTGTTGTTAACATAGCATCATGCTAATGCCAAACTCTAAAATCAACCGAGTCGTCTAAATCCTACGTGCTTCATTATtcataattgaaaataaattcaatCATGATTGAAAATAAAGTCAGATTGGTCACTTTTAAGGTATCATGTCAGAATTATGTCTTAAAGCAGCTCACTgggctgaaataaaaaaaataataaagtattaaagtagCAATTTTGGAATGCAAAGCTGCtattacaataaataagatCTCATTTAGTATTTCTTTAATCCCTGGGGAAAAGGTAACAAAGTGGGGCTAGTAGGTCCATAATCCATCCTTGCATACCTTGTGTCATgacctgttgttttattttcattttatttttttttaacttgcttGTTATTACACTTTACTgggtctgtaaaaaaaatgtaacacctGTAGAAGTGACATTATTCAGTGTTGAGCTAAAACAGCTGATGCAAACATATAACcttcccaaacacacactcaaattcTAATTTAAAGGCCTCAAAATGTTGATAACCGTGTTTAGGACTGACTGTCTAAACAAAGCTGACCCAGAGACCTTCCtcccttgtttttatttatgttgaatTTGTTCTTAGATCTGGTGCAGATGAAAACACTTTCTAATATCTAAAACCTTTTATTCATAGTTGTTAATCATGCACACTTCGGTAAAATGCCACCTGGCTTTACACTCATTATATCAAACTGTATGAGGGATATGAAACATGTCCGCTCTTGTTTATGTGGTCATATCCACTGTACTGTATTTGCTTATAGAACGTTTGTGTTGGGTTGGATTGCTCAAGGCGGTTATTTGAAGGGACTGTGCAATACTCTGAGTTTTGCTGGTAgtgctgaaaataaatgcatgatgtTAACTTCAAAAATTA
>XM_043251118.1
GGCTGAAAACAAGTTCCACGAAGAGGATCGAAGAATATTGGATTCTCGCGAATCTAGCGGGCTGGTCAGCTGAAGCAGCAGGCgcaactttttttccccccaggcTTGTGTTTATTTACGCGAGCTGTACGGCGCCCAGAGCGAAGTTTACGCTCCAGAATTCAGCACCGGAGCTGTCCAGCTTCTCAGCTCGCGCCTCAAAACGACGCTGTTTTCTCGGCTGCGGAATATTTGTTTGACTGGGTTACACACACCGTGCACACACTGACCGCCGCGATCACACTACGCGCATAGCGTTCATTGACGGAAGCGAGCCTTGAAATGACCGCCGGCAGCGCGTGAGGGGAGAAGAAGAAATCGAGTCCCGAGTACCGGAGCACCATCCCATTTCCTTCAGCCCGTGAACGACGAGATGTGCGAGGTGTGTGAGGTTTGGACGGCAGACGATCTGTTTCCCTGCCGAACGTGCACGAGGGTCTTCCACGACGGCTGTCTGCGGGAGATGGGTTACCTGAGCTCTGAAGCCCTGCAGGAAATGAGAGAGACGGCCCACACCACCACCGGCTGGAGCTGCTATTACTGCGATAATGTGAACCTGCTGCTTACCGAAGAAGAGATGTACAGTCTGATGGAAACCTTCAAGCAGTGCAAGATCATCCCAGAGTCGTGCCTGGTGTCAGATGAACTCCTGCAGTACAGGCACTTTGTGACCAAGCAGCTCTTCGAAAGAGATTTGACcgatgaggaggaagaggaggttCTGGCCCAGTTTGCAGCTCTGGATCCAGACAAGAAGGGTCAGATCGAGTGGTCGGACTTCCTCTACCACGAGTCACTTTCAGTGCTGCAGAAGTTCCGGACCGAGAATTCGCTGGTGAGAATCCTCACAGCGAAGGAGAAGGATCGAGCACGGGCCGTGTTTCAGAGTATAGACCAGGACAAAGATGGGATCATTACTGCTGGAGAAGCCAGAAAAGCCCAAACCTCCTGGTTCCACAAGATTAACAAAGAATCCCAGTCCTGCAGTGTCAGACTCATGGGATTGTGTTCCCCTTTGTTCAGTATGGGTATCAGCCATGTAGGTCCAATATCTGAGAGCAGTCCTGCCAGTTCCAGCAGCGAGCGAAGCAGAGATAAAGCCTTGGAAAATGATAACAGACCCGTTACCTGGGCCAACTTCCTGCGGGAGAGCGCCATCTACATCCTTGCTGCGAGGCCCAACAGCCCAGCCATGCACATCCGCTTACCACTCTAACCCTGGCCACATAGCCTGAGACTTCCAGAGGGGCTTCCCGGGTCCAGATTCACAAGAGAGCGGCGCTGAGGACTAAACTGAAAGTCACACGAGAGTCAAACGCTAAAGAGTACGCCACCACACGCTAAGACTGTACAAGGCATCGACGGATTCTTCCTCTAACGACACAATCTAATAGCGACACTGACAAATTCAACGCTACTGAATAGCACATCTGTCACCACTTCTTGAGCTTTTTACGAGCTTGTATGGTTTCCGTTTTTGTGACAAAGTAACTGTTTTGATCAGAGAAGCTGCTGCAAGAAACACCGTCAAGCATTGTGTTTTTGATGTTAACGTGTTGTATCATTTTTGAGTTGGGTGAGTTGCGATCGATGGATCCATGCGAGAGCAGTGGTTGAATCATTGCTGATCTAATTTCAGTCAccacaaaatatgaatataatatagtGGGCAGCAGTTGTGCCATACAGGAATTAAAGTGAGATGCTATGATATACTATATACAGtctatatacatacaaaatgtatttattcccATACTTTCAGGGATGGATTATGGACTAGGCCAAGGAGCTTCCAGACTGCCAGGGGCCTAAAGCTGTGACATAGGAAAACAATTGAAATTGTTGACAGACAACCACTACCACTAACTAAGATACTGGATATACTAAAAAGGTTTGCATCAGTTTGAATTTTCACTTGACAACGTGCGTGTCAGAATTATCAGaagctgtaatttttttttttatattgtattttatattgtatttctaTGTGAAACATGATAAGGAGGCGGAACTTAATTTTAGCTAGATTGTGAAGTACGATCTTCATTTCTAAAATTCAGTGAGCTGCCAGTTTAGGCAGTATTTCAAGGCAACGTGGGAATGTTTCTGATGCAAAATCTGTATAGGCAGCATATATTAGCAAATTAATAGTGAAAAtcgtataaaaaatatttgtatgtaattttaaaaatgcgaTTTTACCcagtatttgtatatttatagctAGTTGAGTTTTGATTTGTTAGCTAGCAAACGTTAATTCCAAATTCCATTGAAATTTAACTGAGATAGGtcttattataattatcataCTCTTTAAggtaaatcattttaacttaTAATActtatgattaattaaataaaatgactttaattaaacataattaaaattaattatgttaacccatatttgtttgtgtgtatgggGTTATTAGAGAGTTGCATTGTTAGCATAagctacattttaattacaaaccAATTTCTATTGAAACTAATTCAATCGAGTCATAATTCTGATACTTTTAAggtactttattttgattaacactattttaaaatcGAATTAAATATctaacttatttattatttcaccCAATATGAGTGTTTTTTTGCGTTTTAGAGTGCTGTTTCATTAGCTTAGCATGTTGCTAAAACTATGTtgcaaaactattaaaattgattttgaatCAAGTTTCTGCATAATTATCTTCTTTCTATGATAACTCATTTTGACCTTCAAGTATGGATAAGTATGGATTGCCCAAAtatttgttgtatatttttctaCCTAAGTGTTGTTAACATAGCATCATGCTAATGCCAAACTCTAAAATCAACCGAGTCGTCTAAATCCTACGTGCTTCATTATtcataattgaaaataaattcaatCATGATTGAAAATAAAGTCAGATTGGTCACTTTTAAGGTATCATGTCAGAATTATGTCTTAAAGCAGCTCACTgggctgaaataaaaaaaataataaagtattaaagtagCAATTTTGGAATGCAAAGCTGCtattacaataaataagatCTCATTTAGTATTTCTTTAATCCCTGGGGAAAAGGTAACAAAGTGGGGCTAGTAGGTCCATAATCCATCCTTGCATACCTTGTGTCATgacctgttgttttattttcattttatttttttttaacttgcttGTTATTACACTTTACTgggtctgtaaaaaaaatgtaacacctGTAGAAGTGACATTATTCAGTGTTGAGCTAAAACAGCTGATGCAAACATATAACcttcccaaacacacactcaaattcTAATTTAAAGGCCTCAAAATGTTGATAACCGTGTTTAGGACTGACTGTCTAAACAAAGCTGACCCAGAGACCTTCCtcccttgtttttatttatgttgaatTTGTTCTTAGATCTGGTGCAGATGAAAACACTTTCTAATATCTAAAACCTTTTATTCATAGTTGTTAATCATGCACACTTCGGTAAAATGCCACCTGGCTTTACACTCATTATATCAAACTGTATGAGGGATATGAAACATGTCCGCTCTTGTTTATGTGGTCATATCCACTGTACTGTATTTGCTTATAGAACGTTTGTGTTGGGTTGGATTGCTCAAGGCGGTTATTTGAAGGGACTGTGCAATACTCTGAGTTTTGCTGGTAgtgctgaaaataaatgcatgatgtTAACTTCAAAAATTA

Function

symbol description
phf24 Predicted to enable metal ion binding activity. Orthologous to human PHF24 (PHD finger protein 24).

NR:

description
PHD finger protein 24-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043251116.1 True 4156 mRNA 0.42 9 5519171 5545588
XM_043251117.1 False 4117 mRNA 0.42 8 5519174 5545588
XM_043251118.1 False 3743 mRNA 0.40 8 5519168 5545588

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pigo pigo,LOC107713385,LOC107686475,LOC107744133,LOC107687847 coding upstream 27439 5482765 ~ 5491729 (+)
slc20a1b LOC107686476,LOC107744132,LOC107687859,LOC107713386,LOC107555522 coding upstream 42163 5464957 ~ 5477005 (+)
drg1 drg1,LOC107744129,LOC107567440,LOC107713382,LOC107555524,LOC107687909 coding upstream 67213 5447331 ~ 5451955 (+)
kcnn2 si:dkey-76p7.5,kcnn2,LOC106564970,LOC107687918,LOC107686472,LOC107567448,LOC106563202 coding upstream 72732 5411683 ~ 5446436 (+)
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prkab1a prkab1a,prkab1,LOC107713388,LOC107555518,LOC103357303 coding downstream 3117 5548705 ~ 5553640 (+)
ppp2r2ab ppp2r2ab,LOC107744137,LOC107720666,LOC107678035,LOC107560523,LOC107687801 coding downstream 347015 5892603 ~ 5906876 (+)
bnip3lb bnip3lb,LOC107560522,LOC107678042,LOC107744138,LOC107687791,LOC107561399,LOC107720674 coding downstream 362425 5908013 ~ 5918050 (+)
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tmem230a tmem230,tmem230a,LOC107677999,LOC107744140,LOC103035677,LOC108427245 coding downstream 409523 5955111 ~ 5956835 (+)
G75007 NA non-coding upstream 60307 5456371 ~ 5458861 (+)
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G74958 NA non-coding upstream 283213 5235599 ~ 5235955 (+)
G74914 NA non-coding upstream 411054 5107785 ~ 5108114 (+)
G74908 NA non-coding upstream 420604 5097644 ~ 5098564 (+)
G75067 NA non-coding downstream 18115 5563703 ~ 5638236 (+)
G75076 NA non-coding downstream 97301 5642889 ~ 5643101 (+)
G75077 NA non-coding downstream 97961 5643549 ~ 5643766 (+)
G75081 NA non-coding downstream 111771 5657359 ~ 5663075 (+)
G75083 NA non-coding downstream 117569 5663157 ~ 5722027 (+)
ccl19b LOC107744181,LOC107677997,LOC107567444,LOC107555521,LOC107713300,LOC107688602,LOC107713257 other upstream 18780 5498647 ~ 5500388 (+)
G74965 NA other upstream 260345 5256838 ~ 5258823 (+)
LOC122352567 ywhah,LOC107562560,LOC107744159,LOC107713377,LOC107555530,LOC107688000 other upstream 269031 5238279 ~ 5250137 (+)
LOC122352404 LOC107670527,LOC107567246,LOC107587997,LOC107757377,LOC107711240,LOC107672489 other upstream 395795 5116866 ~ 5123373 (+)
LOC122352783 tln1,LOC107715875,LOC107670039,LOC107568645,LOC107702558 other upstream 990166 4481267 ~ 4529002 (+)
G75062 LOC107744182,LOC107678054,LOC107567441,LOC107713390,LOC107687817 other downstream 15063 5560651 ~ 5562085 (+)
lrrtm4l1 lrrtm4l1,LOC107730422,LOC107553720,LOC107687748,LOC107720738,LOC107561403 other downstream 515603 6061191 ~ 6089587 (+)
LOC122352486 LOC107720590,LOC107677990,LOC107553711,LOC107705075,LOC107586209 other downstream 908477 6454065 ~ 6472107 (+)
trpc7a trpc7a,LOC107677994,LOC107720592,LOC107552051,LOC105905985,LOC108437819,LOC106603261 other downstream 1435904 6981492 ~ 6993621 (+)
G75422 pcdh1a6,LOC107677970,LOC107552011,LOC107677969,LOC107742394,LOC107720565,LOC107586182,LOC107742396 other downstream 1596705 7142293 ~ 7150581 (+)

Expression


Co-expression Network