G78899 (LOC107556004,LOC107699348,LOC107714497)


Basic Information

Item Value
gene id G78899
gene name LOC107556004,LOC107699348,LOC107714497
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056709.1
NCBI id CM032078.1
chromosome length 24513629
location 3223735 ~ 3241319 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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>TU116768
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Function

NR:

description
PREDICTED: inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU116764 False 3115 lncRNA 0.38 2 3237551 3241319
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TU116769 True 4425 lncRNA 0.38 11 3233259 3241319

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
gnl3 gnl3,LOC107714492,LOC107680445,LOC107566445 coding downstream 165305 3052696 ~ 3058430 (-)
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G79010 NA non-coding upstream 412963 3654282 ~ 3657289 (-)
G79069 NA non-coding upstream 475370 3716689 ~ 3719414 (-)
G78853 gata2a,gata2,LOC107714496 other downstream 110043 3112933 ~ 3113692 (-)
spcs1 spcs1,LOC107566449,LOC107714491,LOC107680421,LOC107699355,LOC107744856,LOC107572401 other downstream 175511 3046738 ~ 3048224 (-)
trnai-aau_68 NA other downstream 237204 2986458 ~ 2986531 (-)
trnaf-aaa NA other downstream 238618 2985044 ~ 2985117 (-)
trnap-cgg_28 NA other downstream 239386 2984278 ~ 2984349 (-)
cdab cda,LOC107714500,LOC107751011,LOC107572847,LOC107680435,LOC108436250,LOC105898129 other upstream 12544 3253863 ~ 3256212 (-)
G79003 NA other upstream 298682 3540001 ~ 3541055 (-)
LOC122354343 cpne5b,LOC107680428,LOC107714485,LOC107555996,LOC107699334,LOC107751002,LOC108436414 other upstream 572186 3813505 ~ 3834923 (-)
G79085 zgc:113223,LOC107745344,LOC107698001,LOC107556176 other upstream 671929 3913248 ~ 3914635 (-)
si:dkey-197i20.6 si:dkey-197i20.6,LOC107745350,LOC107710445,LOC107658773,LOC107669007,LOC107592569 other upstream 720662 3961981 ~ 3965791 (-)

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