pank4 (pank4,LOC107742899,LOC107557906,LOC107745330)


Basic Information

Item Value
gene id pank4
gene name pank4,LOC107742899,LOC107557906,LOC107745330
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056709.1
NCBI id CM032078.1
chromosome length 24513629
location 4436874 ~ 4454436 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
pank4 Predicted to enable pantothenate kinase activity. Predicted to be involved in coenzyme A biosynthetic process. Predicted to be active in cytosol and nucleus. Orthologous to human PANK4 (pantothenate kinase 4 (inactive)).

NR:

description
pantothenate kinase 4-like isoform X2

GO:

id name namespace
GO:0015937 coenzyme A biosynthetic process biological_process
GO:0005524 ATP binding molecular_function
GO:0004594 pantothenate kinase activity molecular_function

KEGG:

id description
K24265 PANK4; bifunctional damage-control phosphatase, subfamily II, fusion protein

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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uox uox,uric,LOC107669002,LOC107560424,LOC107658581,LOC107742901,LOC108430123,LOC103030682 coding downstream 52921 4381167 ~ 4383953 (-)
ttll7 ttll7,LOC107745334,LOC107669020 coding downstream 69709 4292348 ~ 4367165 (-)
ghrh LOC107718698,LOC107557909,LOC107745328,LOC107658696,LOC107560430,LOC107669017 coding upstream 29699 4484135 ~ 4487197 (-)
LOC122354090 LOC107658671,LOC107718693,LOC107557899 coding upstream 43124 4497560 ~ 4509180 (-)
LOC122353703 LOC107712987,LOC107746004,LOC107701987,LOC107592853,LOC107735212,LOC107706548,LOC107557400 coding upstream 756346 5210782 ~ 5212158 (-)
aldh4a1 aldh4a1,LOC106582961 coding upstream 763797 5218233 ~ 5229330 (-)
iffo2b iffo2,LOC107557407 coding upstream 789171 5243607 ~ 5273639 (-)
G79236 NA non-coding downstream 36284 4399506 ~ 4400590 (-)
G79227 NA non-coding downstream 48135 4388101 ~ 4388739 (-)
G79172 NA non-coding downstream 61481 4374648 ~ 4375393 (-)
G79126 NA non-coding downstream 324804 4109104 ~ 4112070 (-)
G79083 nwd1,LOC107710443,LOC107658741,LOC107592553,LOC107655543,LOC107730478 non-coding downstream 656557 3779999 ~ 3780317 (-)
G79256 NA non-coding upstream 10351 4464787 ~ 4469281 (-)
LOC122353716 NA non-coding upstream 707593 5162029 ~ 5164464 (-)
G79327 LOC107393734 non-coding upstream 717339 5171775 ~ 5172519 (-)
G79329 LOC107660256,LOC107566921 non-coding upstream 726860 5181296 ~ 5181698 (-)
LOC122354468 NA non-coding upstream 739576 5194012 ~ 5195326 (-)
si:dkey-197i20.6 si:dkey-197i20.6,LOC107745350,LOC107710445,LOC107658773,LOC107669007,LOC107592569 other downstream 471083 3961981 ~ 3965791 (-)
G79085 zgc:113223,LOC107745344,LOC107698001,LOC107556176 other downstream 522239 3913248 ~ 3914635 (-)
LOC122354343 cpne5b,LOC107680428,LOC107714485,LOC107555996,LOC107699334,LOC107751002,LOC108436414 other downstream 601951 3813505 ~ 3834923 (-)
G79003 NA other downstream 895819 3540001 ~ 3541055 (-)
cdab cda,LOC107714500,LOC107751011,LOC107572847,LOC107680435,LOC108436250,LOC105898129 other downstream 1180662 3253863 ~ 3256212 (-)
mmel1 mmel1,LOC107712974,LOC107756657,LOC107654428,LOC107702001,LOC107592889 other upstream 1284580 5739016 ~ 5765140 (-)
G79565 NA other upstream 1641697 6096133 ~ 6096480 (-)
vamp3 vamp3 other upstream 2359189 6813625 ~ 6847790 (-)
phf13 LOC107756642,LOC107751178,LOC107582403 other upstream 2677142 7131578 ~ 7141236 (-)
LOC122354641 svbp other upstream 2699029 7153465 ~ 7155275 (-)

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