LOC122357607


Basic Information

Item Value
gene id LOC122357607
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056700.1
NCBI id CM032069.1
chromosome length 25613461
location 14091564 ~ 14098847 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU17546
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>XR_006252505.1
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GCTTTTCATTGCGGAAACGGCTACGAGAAATAAACAAGGCACAGACAGACATAAAAGAGACTGGAGTTAATGGTTACCTCTGCTGCACTCTTGTCTAATCATGCCCCTTTAtcagtataaaaatacaaattcccATTGCCAAAATGACGGTTGCCTTTTCCTTTAAGCTGGCAGTAAATTTTATTGAAACAACTGAGATGATTAACCTCTGATAGTATCCTAATGGAAACTCTCTGGCACCTCGCACACGGATTAATGCCAAGAGGAACCTCcaattcataatttttatttgaaatgggaCACCCATCTGCATACGGACTGATGGGTTTGGACAGGGCACTTGCTGTTGAACCGCTAACAGGCTTAGCTTAATGAGATGCAGATGAATGTCAGTGACAAGGCTTAAGACCAGCACCTGTTGTCTGAGGTGCCCTTCATGTCACATACCACAAATGTCGTTTTTTTGTATCTGGCACTAATAATCTAAACTCCATTGATGTTATGTTAATAACAAGCAAGTCTgcctatttatgtatttttattttctgatagtttaaataattgaatcatgtttatttgttatcCTCATTACTGGAGTTATCACTTACACTCATTTCTAGCCTATAACTCTTCAGCGTTTGAAGTGCAGTGGGCTGGCAGTAAATGAACTCGGTGCACCTGCGAGGCGCAATACAACaacaagccagcagagggagccaatgatagaaaaaaaacataataataataataaagcgaTTTAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU17546 False 950 lncRNA 0.44 3 14096839 14098518
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XR_006252505.1 False 5761 lncRNA 0.40 5 14091564 14098847

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G11856 jph1b,LOC107686034,LOC107746914,LOC107550709,LOC107584332,LOC107732545,LOC107664083 non-coding downstream 9308 14108155 ~ 14166955 (+)
G11855 NA non-coding downstream 32912 14131759 ~ 14164377 (+)
G11832 rpl7,LOC107664057,LOC107584398,LOC107686030,LOC107550715 non-coding downstream 37267 14136114 ~ 14185786 (+)
G11894 NA non-coding downstream 270841 14369688 ~ 14371834 (+)
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rnf152 rnf152,LOC107729101,LOC107679332,LOC107567413,LOC107674343,LOC107714840,LOC107584540 other upstream 1217556 12867929 ~ 12874008 (+)
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pld1a pld1a,LOC107688495,LOC107550602,LOC107680234,LOC107722545,LOC108442335 other upstream 2153974 11908073 ~ 11937590 (+)
mast3a LOC107722547,LOC107688474,LOC107680242,LOC107550619,LOC107709878,LOC107586070 other upstream 2583860 11482104 ~ 11507704 (+)
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G11854 jph1b,jph1,LOC107584332,LOC107550709,LOC107746914,LOC107732545,LOC107664083,LOC107686034,LOC107740042 other downstream 76517 14175364 ~ 14179615 (+)
plxdc2a LOC107686089,LOC107713976,LOC107751571 other downstream 647260 14746107 ~ 14753161 (+)
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LOC122357435 LOC107733881,LOC107599885,LOC107657419 other downstream 1142950 15241797 ~ 15249249 (+)
dars2 dars2,LOC107720851,LOC107700987,LOC107558296,LOC107599907 other downstream 1761332 15860179 ~ 15875764 (+)

Expression


Co-expression Network