LOC122362257 (LOC107658348,LOC107563587,LOC107678922,LOC107726920,LOC107722065,LOC107559085)


Basic Information

Item Value
gene id LOC122362257
gene name LOC107658348,LOC107563587,LOC107678922,LOC107726920,LOC107722065,LOC107559085
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056700.1
NCBI id CM032069.1
chromosome length 25613461
location 16483160 ~ 16512019 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU18641
atattttcaataAACTTTATTCCCCCCCACTCTCCCAATACATAAAAAGTGATCATACTGAACATTTCCCAGTGTTGACACCGTACAATTATgttacatcaataaataaaaaactataaataaaaaaataaatagaacacGTGccacaattaattaataatactagTTAGGATTTGTCTGAGGGTAATGGCTTTCACAATGTTGGTTTTCTGAACACTTATTTAACACTTACAGCCATGGTCACAGTTTTGAGGACATTATGATTACTTATGATGGAGCATGTCAAGTAAACAAAGCTGGAGGCACACTGAATACATAGTCTTTTTTCTCCTCAAGTACAGACATTAAAGGATATAATAACTTTTAACAGCAAAAGCTTATATCAGGTGTGtatttgtagtgtttttttctcCCACTCCTGCCTAATTTGCTTGGAAAACCGAATATGAAGACGCCATATAAAGCACCTTTCATTCCCTTTGTGACTTAAGCTTGAGGTCCAGGGCCATTATTGCACAGAGGAATCCATCAGAAAGGCACTTTAGTCTCTCCCGCTCCTAACTGCTCCTCCATGAATTACAGTTCAACCTCAGCCATTCACCTCTGCCATCTTTAAAACTAATctcattaaaaagaataacCATTTGGTGTTCGTAGCTCTTCTTGTTTTGTGTACTAtttagtgaaataaaatgtcctttttaaaaaaagccaagTGATCGAGCATAAAAAGCCAAGCCCATCTCGAGCAGTGTATGGGGACACCGCGAGCAAAAGCAAGACGCTTAAGAACCCTGTGAGTTTTATGCCATCTGCACTTCAAGTCCAgctaaaaagaaacaaatcataaaaagaACAGGCTCAAATTTTGGTTGTGCACACTGTGAGTCAAGCTGGTAGTGTGATACGGTTGGTGTAGGCTCAGtcgcaaaaacaacaaaagaaaaccaaacgAAAAATAGTGCACGGTAGTTCAAAGAGGCCAGCCGATGACCAAGGACAGGAGATCTTCGTGGCAACGTGGAAGCTTcccctgattttttttttttttttttttttttttttttttttttttttt
>XM_043263640.1
CAACAGAGAGCGTAGACCACTTAGTGACAACATTAGttgagaagagaagagagaacaTCGGTGGAATACAAGAagattcaaatttaaaattggGCTTTATAAAAGGATTTCTTCATCATGGCCAATCAGCCTCTACCACTGTCTCAGGAGACATTAGCTCAGTTCAATCGCTCCATGTCCAGAGAAGCAGGTCTCTCAGGGCCTCCAAGGCGACGTTTGGGCTCCATCTCCACTCGCCGAAGCTCCAAAGACCAATCCAAGGACCAACCCCACCACAGACCTCTGTTTCTCAGGAGCATGACGGTTCCTTCGTCCGACTCATCGTTCCTGAGCCCCAACGTCAGCAATTCTCACATCTCCATGGGCAAACGGTTCTCATTCGCAGGCTGGCACCAGGGAGGAAGAGTGAGCTTCTCCGGACTCTATCTTCAACAACCCATCCAGGAGGTGTATGTGGAGAACACCTACAGAATGGGACCAGAACCAGGGTGCCACTTCAGTGCCAGCAGGACCCAGCAGATCTTACAGGTCACTCTGGATAGTTATTTGGACGGTGTGTGTTACAGTCCGGATAGTTGTAGCCAGCTGTGTCAGATGTTAGCGGATCTAGTTCTCAGTAAGCTAAAAGATGTAAATCCGCCACGATATAAACTCGTGTGCCAGGTGGTGGTCGGGCAGAGTGATAAACAAGGTATAAAGGTGGCCAGCCGTAGCCTGATGAACCCCAACACTGACAACTACACATCTGCTGTTTACCATAATCACTCACTGTTTGCTGTGGCTTTAGTACACGGCATGTACTTTGAATGAAGGCTAAATCAACAGAGCTAAATATCAGTTTACTAAATGCATACTTTAAgtctctttaaaaatatctttacatttttaaagaaaggtcgcataatttaaaataacatttttctattttaaaaagcaaagttGATTTTCTAGTAAACATAAATTTAGAACgtatatacaaattattttatatccattcttgtatattatgtattttgattttatgcTAAGACGCaagcaataacattttatgttctgtcttttcttatgttatgtaaaaacagctacacacacacagtttgtttgcaaaaaaacattttaattttttcagaaGTTGTTCTTTAATATACGCAATTGTTTaatttcttgtatttttattttgcacctAACCCAGTTGCAGtttaattgagattaattagaatgtgcaattacattttttttttcttcaaaacggttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaggagttaTAAATTTTTGCAAATTTATATTACACAGAGACACAATGTTACAGGGATGTAATTCTTTTCCCTCAATGTGCCAATGTTTTCCTCAATGTGTCATTAAAAATTGCCAGGAAAAGAagccataaaaataataataataataataattttaaattataaatactacTAATTATAAatgctactaataataataataaaccgaACTGTtacttaaaattgtaattaaaaatgtttgtctttaaaatcttaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaatgtatattttcaataAACTTTATTCCCCCCCACTCTCCCAATACATAAAAAGTGATCATACTGAACATTTCCCAGTGTTGACACCGTACAATTATgttacatcaataaataaaaaactataaataaaaaaataaa
>XM_043263646.1
GTAGACCACTTAGTGACAACATTAGttgagaagagaagagagaacaTCGGTGGAATACAAGAagattcaaatttaaaattggGCTTTATAAAAGGAGCGGTAAACTGTGGTGAATGTTTTGGCACGTAGATGAATATCTGACTAGAGTGATGTGGAGGCAAAGACTGGGGAAAGACAGAAGAGAGGTGAACTGAACCTGAGATGTGGTATAATCTACTGTTGACTCAATCTGTGGACTTTAACAAAAACTTACGGCACAGACAGATTTCTTCATCATGGCCAATCAGCCTCTACCACTGTCTCAGGAGACATTAGCTCAGTTCAATCGCTCCATGTCCAGAGAAGCAGGTCTCTCAGGGCCTCCAAGGCGACGTTTGGGCTCCATCTCCACTCGCCGAAGCTCCAAAGACCAATCCAAGGACCAACCCCACCACAGACCTCTGTTTCTCAGGAGCATGACGGTTCCTTCGTCCGACTCATCGTTCCTGAGCCCCAACGTCAGCAATTCTCACATCTCCATGGGCAAACGGTTCTCATTCGCAGGCTGGCACCAGGGAGGAAGAGTGAGCTTCTCCGGACTCTATCTTCAACAACCCATCCAGGAGGTGTATGTGGAGAACACCTACAGAATGGGACCAGAACCAGGGTGCCACTTCAGTGCCAGCAGGACCCAGCAGATCTTACAGGTCACTCTGGATAGTTATTTGGACGGTGTGTGTTACAGTCCGGATAGTTGTAGCCAGCTGTGTCAGATGTTAGCGGATCTAGTTCTCAGTAAGCTAAAAGATGTAAATCCGCCACGATATAAACTCGTGTGCCAGGTGGTGGTCGGGCAGAGTGATAAACAAGGTATAAAGGTGGCCAGCCGTAGCCTGATGAACCCCAACACTGACAACTACACATCTGCTGTTTACCATAATCACTCACTGTTTGCTGTGGCTTTAGTACACGGCATGTACTTTGAATGAAGGCTAAATCAACAGAGCTAAATATCAGTTTACTAAATGCATACTTTAAgtctctttaaaaatatctttacatttttaaagaaaggtcgcataatttaaaataacatttttctattttaaaaagcaaagttGATTTTCTAGTAAACATAAATTTAGAACgtatatacaaattattttatatccattcttgtatattatgtattttgattttatgcTAAGACGCaagcaataacattttatgttctgtcttttcttatgttatgtaaaaacagctacacacacacagtttgtttgcaaaaaaacattttaattttttcagaaGTTGTTCTTTAATATACGCAATTGTTTaatttcttgtatttttattttgcacctAACCCAGTTGCAGtttaattgagattaattagaatgtgcaattacattttttttttcttcaaaacggttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaggagttaTAAATTTTTGCAAATTTATATTACACAGAGACACAATGTTACAGGGATGTAATTCTTTTCCCTCAATGTGCCAATGTTTTCCTCAATGTGTCATTAAAAATTGCCAGGAAAAGAagccataaaaataataataataataataattttaaattataaatactacTAATTATAAatgctactaataataataataaaccgaACTGTtacttaaaattgtaattaaaaatgtttgtctttaaaatcttaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaatgtatattttcaataAACTTTATTCCCCCCCACTCTCCCAATACATAAAAAGTGATCATACTGAACATTTCCCAGTGTTGACACCGTACAATTATgttacatcaataaataaaaaactataaataaaaaaataaa
>XM_043263654.1
GTAGACCACTTAGTGACAACATTAGttgagaagagaagagagaacaTCGGTGGAATACAAGAagattcaaatttaaaattggGCTTTATAAAAGGAGCGGTAAACTGTGGTGAATGTTTTGGCACGTAGATGAATATCTGACTAGAGTGATGTGGAGGCAAAGACTGGGGAAAGACAGAAGAGAGATTTCTTCATCATGGCCAATCAGCCTCTACCACTGTCTCAGGAGACATTAGCTCAGTTCAATCGCTCCATGTCCAGAGAAGCAGGTCTCTCAGGGCCTCCAAGGCGACGTTTGGGCTCCATCTCCACTCGCCGAAGCTCCAAAGACCAATCCAAGGACCAACCCCACCACAGACCTCTGTTTCTCAGGAGCATGACGGTTCCTTCGTCCGACTCATCGTTCCTGAGCCCCAACGTCAGCAATTCTCACATCTCCATGGGCAAACGGTTCTCATTCGCAGGCTGGCACCAGGGAGGAAGAGTGAGCTTCTCCGGACTCTATCTTCAACAACCCATCCAGGAGGTGTATGTGGAGAACACCTACAGAATGGGACCAGAACCAGGGTGCCACTTCAGTGCCAGCAGGACCCAGCAGATCTTACAGGTCACTCTGGATAGTTATTTGGACGGTGTGTGTTACAGTCCGGATAGTTGTAGCCAGCTGTGTCAGATGTTAGCGGATCTAGTTCTCAGTAAGCTAAAAGATGTAAATCCGCCACGATATAAACTCGTGTGCCAGGTGGTGGTCGGGCAGAGTGATAAACAAGGTATAAAGGTGGCCAGCCGTAGCCTGATGAACCCCAACACTGACAACTACACATCTGCTGTTTACCATAATCACTCACTGTTTGCTGTGGCTTTAGTACACGGCATGTACTTTGAATGAAGGCTAAATCAACAGAGCTAAATATCAGTTTACTAAATGCATACTTTAAgtctctttaaaaatatctttacatttttaaagaaaggtcgcataatttaaaataacatttttctattttaaaaagcaaagttGATTTTCTAGTAAACATAAATTTAGAACgtatatacaaattattttatatccattcttgtatattatgtattttgattttatgcTAAGACGCaagcaataacattttatgttctgtcttttcttatgttatgtaaaaacagctacacacacacagtttgtttgcaaaaaaacattttaattttttcagaaGTTGTTCTTTAATATACGCAATTGTTTaatttcttgtatttttattttgcacctAACCCAGTTGCAGtttaattgagattaattagaatgtgcaattacattttttttttcttcaaaacggttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaggagttaTAAATTTTTGCAAATTTATATTACACAGAGACACAATGTTACAGGGATGTAATTCTTTTCCCTCAATGTGCCAATGTTTTCCTCAATGTGTCATTAAAAATTGCCAGGAAAAGAagccataaaaataataataataataataattttaaattataaatactacTAATTATAAatgctactaataataataataaaccgaACTGTtacttaaaattgtaattaaaaatgtttgtctttaaaatcttaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaatgtatattttcaataAACTTTATTCCCCCCCACTCTCCCAATACATAAAAAGTGATCATACTGAACATTTCCCAGTGTTGACACCGTACAATTATgttacatcaataaataaaaaactataaataaaaaaataaa

Function

NR:

description
PREDICTED: tctex1 domain-containing protein 1-like

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU18641 False 1078 lncRNA 0.37 2 16483160 16507897
XM_043263640.1 False 1697 mRNA 0.35 2 16507766 16512019
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XM_043263654.1 False 1776 mRNA 0.36 3 16507766 16512008

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
brinp2 brinp2,LOC107658350,LOC107562711,LOC107722070,LOC107720848,LOC107700985 coding downstream 458510 15948412 ~ 16024650 (-)
cenpl cenpl,LOC107720853,LOC107599910,LOC107657424,LOC107722063,LOC107700989,LOC107557192 coding downstream 623069 15856239 ~ 15860091 (-)
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ptch2 ptch2,LOC107557169,LOC107700991,LOC107720855,LOC107599897,LOC107722076,LOC107657459 coding downstream 686863 15769765 ~ 15796297 (-)
atp6v0b atp6v0b,LOC102788333 coding downstream 801134 15676203 ~ 15682026 (-)
nmnat2 nmnat2,LOC107658365,LOC107563562,LOC107678925,LOC107557267 coding upstream 176606 16688625 ~ 16698623 (-)
LOC122356645 LOC107709317 coding upstream 335672 16847691 ~ 16849363 (-)
LOC122324462 LOC107709317 coding upstream 339918 16851937 ~ 16852961 (-)
LOC122327065 NA coding upstream 344096 16856115 ~ 16856779 (-)
LOC122327073 LOC107709317 coding upstream 345442 16857461 ~ 16858067 (-)
G12585 NA non-coding downstream 37936 16444963 ~ 16445224 (-)
G12567 NA non-coding downstream 183416 16299172 ~ 16299744 (-)
LOC122356097 NA non-coding downstream 728738 15718628 ~ 15754422 (-)
LOC122359617 NA non-coding downstream 929556 15547035 ~ 15553604 (-)
G12313 ccr9a,LOC107579348,LOC107733890,LOC107657446,LOC107730785,LOC107557055,LOC107700981 non-coding downstream 1242334 15237959 ~ 15240826 (-)
G12620 NA non-coding upstream 30464 16542483 ~ 16542771 (-)
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G12708 NA non-coding upstream 271125 16783144 ~ 16784555 (-)
G12830 NA non-coding upstream 277236 16789255 ~ 16789724 (-)
LOC122356677 NA non-coding upstream 282329 16794348 ~ 16795778 (-)
pappa2 pappa2,LOC107722077,LOC107568983,LOC107678935,LOC107726923,LOC107658303,LOC107558342 other downstream 214325 16224723 ~ 16268835 (-)
ccdc24 ccdc24,LOC107657456,LOC107599905 other downstream 903454 15559663 ~ 15579706 (-)
smarcd3a smarcd3a,smarcd3,LOC107657439,LOC107599876,LOC107709803,LOC107556978,LOC107718026,LOC103039772 other downstream 1329171 15133971 ~ 15153989 (-)
faim2a faim2a,LOC107718029,LOC107701017,LOC107556958,LOC107657438,LOC107709826 other downstream 1355669 15120587 ~ 15127491 (-)
adcyap1b adcyap1b,adcyap1,LOC107713980,LOC107686049,LOC107751550,LOC107664073 other downstream 1872894 14578995 ~ 14610266 (-)
G12658 lamc1,LOC107678923,LOC107726890,LOC107557259,LOC107722047 other upstream 159557 16671576 ~ 16673710 (-)
G12839 NA other upstream 294242 16806261 ~ 16806738 (-)
G12841 NA other upstream 310606 16822625 ~ 16823073 (-)
LOC122327046 NA other upstream 312983 16825002 ~ 16825808 (-)
LOC122327057 NA other upstream 314066 16826085 ~ 16826547 (-)

Expression


Co-expression Network