clcn2a (clcn2,clcn2a,LOC107732945,LOC107710554,LOC107677884)


Basic Information

Item Value
gene id clcn2a
gene name clcn2,clcn2a,LOC107732945,LOC107710554,LOC107677884
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056700.1
NCBI id CM032069.1
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Function

symbol description
clcn2a Enables chloride channel activity. Predicted to be involved in chloride transport. Predicted to act upstream of or within transmembrane transport. Located in cell junction. Is expressed in several structures, including eye; gill; heart; liver; and pleuroperitoneal region. Human ortholog(s) of this gene implicated in idiopathic generalized epilepsy 11 and primary hyperaldosteronism. Orthologous to human CLCN2 (chloride voltage-gated channel 2).
clcn2 Enables voltage-gated chloride channel activity. Involved in regulation of aldosterone biosynthetic process. Located in plasma membrane. Implicated in idiopathic generalized epilepsy 11 and primary hyperaldosteronism.

NR:

description
PREDICTED: chloride channel protein 2

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KEGG:

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K05011 CLCN2; chloride channel 2

RNA

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glula LOC107563291,LOC107710552,LOC107700548,LOC107732203,LOC107553252 coding upstream 121412 8315131 ~ 8318467 (+)
ptger4c ptger4c,LOC107716941,LOC107700513,LOC107743379,LOC107684935,LOC107564388,LOC107551710 coding upstream 1048844 7388418 ~ 7391035 (+)
dmbx1a dmbx1a,LOC107588924,LOC107743378,LOC107700538,LOC107551711,LOC107684938,LOC108442545 coding upstream 1093224 7340271 ~ 7346655 (+)
atp1b3a atp1b3a,LOC107700561,LOC107563307,LOC107710617,LOC107732952,LOC107677716,LOC107553263 coding downstream 103337 8590241 ~ 8599595 (+)
atr atr,LOC107677746,LOC107700496 coding downstream 143508 8630412 ~ 8651546 (+)
amer3 LOC107710619,LOC107700565,LOC107677756,LOC107732953,LOC107553265,LOC107569737 coding downstream 165013 8651917 ~ 8662323 (+)
LOC122361595 LOC107710620 coding downstream 343916 8830820 ~ 8841734 (+)
LOC122359011 arhgef4,LOC107700563,LOC107710620,LOC107553266,LOC107732940 coding downstream 361423 8848327 ~ 8878100 (+)
G10219 pbx1a,pbx1b,LOC107677498,LOC108272157,LOC107564502 non-coding upstream 177049 8219265 ~ 8262830 (+)
G10198 NA non-coding upstream 349343 8081817 ~ 8090536 (+)
G10200 NA non-coding upstream 350408 8083536 ~ 8089471 (+)
LOC122326720 NA non-coding upstream 408772 8027750 ~ 8031107 (+)
G10188 NA non-coding upstream 483673 7955793 ~ 7956206 (+)
G10226 NA non-coding downstream 35498 8522402 ~ 8528707 (+)
G10271 NA non-coding downstream 73194 8560098 ~ 8561513 (+)
G10284 LOC107710615 non-coding downstream 100473 8587377 ~ 8589074 (+)
LOC122356731 NA non-coding downstream 275935 8762839 ~ 8765451 (+)
G10371 NA non-coding downstream 311687 8798591 ~ 8798996 (+)
G10212 NA other upstream 332102 8106865 ~ 8107777 (+)
G10108 NA other upstream 857494 7504622 ~ 7582385 (+)
gng12a gng12a,LOC107700509,LOC107716954,LOC107551713 other upstream 1139778 7285670 ~ 7300101 (+)
lrrc53 LOC107700485,LOC107588905,LOC107716924 other upstream 1334087 7098303 ~ 7105792 (+)
G9925 LOC107563058,LOC107549254 other upstream 1452760 6986298 ~ 6987119 (+)
olfm3b olfm3b,LOC107700521,LOC107710604,LOC107745696,LOC107680049 other downstream 675707 9162611 ~ 9171915 (+)
arpc5a arpc5a,arpc5,LOC107722639,LOC107693740,LOC107564704,LOC107677751,LOC107718183 other downstream 1259666 9746570 ~ 9751212 (+)
znf414 LOC107722538,LOC107564712,LOC107693731,LOC107691619,LOC107718126 other downstream 1424724 9911628 ~ 9916861 (+)
selenof selenof,sep15,LOC107693704,LOC106598901 other downstream 1671628 10158532 ~ 10161809 (+)
lyrm4 lyrm4,LOC107718092,LOC107688446,LOC107722638,LOC107689406,LOC107688520 other downstream 2175825 10662729 ~ 10665110 (+)

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