st3gal3b (st3gal3b,LOC107551715,LOC107743372)


Basic Information

Item Value
gene id st3gal3b
gene name st3gal3b,LOC107551715,LOC107743372
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056700.1
NCBI id CM032069.1
chromosome length 25613461
location 7415442 ~ 7459592 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
st3gal3b Predicted to enable N-acetyllactosaminide alpha-2,3-sialyltransferase activity. Predicted to be involved in protein glycosylation. Predicted to be located in Golgi apparatus and membrane. Predicted to be integral component of membrane. Is expressed in several structures, including cardiovascular system; corpuscles of Stannius; hypochord; pleuroperitoneal region; and ventral mesoderm. Human ortholog(s) of this gene implicated in autosomal recessive non-syndromic intellectual disability and developmental and epileptic encephalopathy 15. Orthologous to human ST3GAL3 (ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 3).

NR:

description
PREDICTED: CMP-N-acetylneuraminate-beta-1,4-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase-like isoform X1

GO:

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KEGG:

id description
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RNA

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Neighbor

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G9997 NA non-coding downstream 263739 7149801 ~ 7151703 (-)
G9972 NA non-coding downstream 306150 7107227 ~ 7109292 (-)
G9971 NA non-coding downstream 308304 7106911 ~ 7107138 (-)
G9970 NA non-coding downstream 308597 7106618 ~ 7106845 (-)
G10165 NA non-coding upstream 66747 7526339 ~ 7532065 (-)
LOC122328801 NA non-coding upstream 329145 7788737 ~ 7791610 (-)
G10185 NA non-coding upstream 474809 7934401 ~ 7934625 (-)
G10194 NA non-coding upstream 610562 8070154 ~ 8070353 (-)
G10345 NA non-coding upstream 1170814 8630406 ~ 8630606 (-)
dipk1aa fam69a,fam69aa,LOC107716951,LOC107568082,LOC108436064,LOC107694372,LOC107743375,LOC108280758 other downstream 191703 7206542 ~ 7223739 (-)
lhx8a lhx8,lhx8a,LOC107693563,LOC108436043 other downstream 402228 7009583 ~ 7013214 (-)
G9926 LOC107563058,LOC107549254,LOC108267243 other downstream 427329 6986301 ~ 6988113 (-)
G9894 NA other downstream 586440 6828490 ~ 6829002 (-)
G9891 NA other downstream 673269 6741683 ~ 6742173 (-)
G10170 kdm4ab,LOC107564389,LOC107700543,LOC107551714,LOC107684932,LOC107743373 other upstream 32614 7492206 ~ 7493844 (-)
G10178 NA other upstream 324876 7784468 ~ 7785154 (-)
G10196 NA other upstream 611184 8070776 ~ 8071834 (-)
G10213 NA other upstream 647264 8106856 ~ 8107788 (-)
zfyve9a LOC107700554,LOC107563295,LOC107677579,LOC107553256,LOC107732202 other upstream 943735 8403327 ~ 8427904 (-)

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