bpnt2 (impad1,LOC107663252,LOC107741594)


Basic Information

Item Value
gene id bpnt2
gene name impad1,LOC107663252,LOC107741594
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056700.1
NCBI id CM032069.1
chromosome length 25613461
location 6856244 ~ 6879649 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043260277.1
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>XM_043260303.1
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Function

symbol description
impad1 Golgi-resident PAP phosphatase

NR:

description
inositol monophosphatase 3

GO:

id name namespace
GO:0046854 phosphatidylinositol phosphorylation biological_process
GO:0006021 inositol biosynthetic process biological_process
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0046872 metal ion binding molecular_function
GO:0052832 inositol monophosphate 3-phosphatase activity molecular_function
GO:0052833 inositol monophosphate 4-phosphatase activity molecular_function
GO:0008934 inositol monophosphate 1-phosphatase activity molecular_function

KEGG:

id description
K15759 IMPAD1, IMPA3; Golgi-resident PAP phosphatase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043260277.1 True 3036 mRNA 0.40 7 6856244 6879649
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XM_043260312.1 False 1742 mRNA 0.43 6 6856263 6878523

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122361319 NA coding upstream 14151 6840626 ~ 6842093 (+)
slc35d1b slc35d1b,LOC107690965,LOC107573325,LOC107745697,LOC108415103 coding upstream 367544 6474022 ~ 6488700 (+)
fgf12a fgf12a,fgf12,LOC107549734,LOC108436038,LOC105006885,LOC108280711,LOC106598267,LOC106568709,LOC103365152 coding upstream 518672 6257551 ~ 6337572 (+)
mb21d2 mb21d2,LOC107705301,LOC107572431,LOC107673980,LOC105899163 coding upstream 600671 6249048 ~ 6255573 (+)
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G9925 LOC107563058,LOC107549254 other downstream 106649 6986298 ~ 6987119 (+)
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gng12a gng12a,LOC107700509,LOC107716954,LOC107551713 other downstream 406021 7285670 ~ 7300101 (+)
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G10212 NA other downstream 1227216 8106865 ~ 8107777 (+)

Expression


Co-expression Network