efr3a (efr3a,LOC107721726,LOC107749108,LOC107663339)


Basic Information

Item Value
gene id efr3a
gene name efr3a,LOC107721726,LOC107749108,LOC107663339
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056700.1
NCBI id CM032069.1
chromosome length 25613461
location 20854977 ~ 20887544 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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Function

symbol description
efr3a Predicted to be involved in protein localization to plasma membrane. Predicted to be active in plasma membrane. Orthologous to human EFR3A (EFR3 homolog A).

NR:

description
protein EFR3 homolog A

GO: NA

KEGG:

id description
K21842 EFR3; protein EFR3

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G13992 NA non-coding downstream 260636 21148180 ~ 21148512 (+)
G13993 NA non-coding downstream 261677 21149221 ~ 21150007 (+)
LOC122326305 LOC107749119,LOC107602627,LOC107566983,LOC107690079,LOC107721763,LOC107721764,LOC107678697 other upstream 346586 20493174 ~ 20508391 (+)
G13882 LOC107749119,LOC107602627,LOC107721764,LOC107659530,LOC107721763 other upstream 369759 20481664 ~ 20485218 (+)
gbp2 LOC107678697,LOC107602627,LOC107690079,LOC107721763 other upstream 381453 20467268 ~ 20473524 (+)
crlf1a crlf1a,LOC107602622,LOC107678692,LOC107588877,LOC107690059 other upstream 425629 20416203 ~ 20429348 (+)
rem2 LOC107583115,LOC107567555,LOC107668956,LOC107738122,LOC107706340 other upstream 2692835 18138644 ~ 18162142 (+)
G13998 LOC107659744,LOC107749160,LOC107563810,LOC107563823 other downstream 276398 21163942 ~ 21164822 (+)
G14211 NA other downstream 419863 21307407 ~ 21361708 (+)
LOC122354659 LOC107749134,LOC107659944,LOC107600069,LOC107692888,LOC107557869,LOC107721709,LOC101885494 other downstream 593590 21481134 ~ 21482642 (+)
ece2a ece2a,LOC107660439,LOC107600061,LOC107557862 other downstream 645701 21533245 ~ 21621097 (+)
ccl20a.3 LOC107749165,LOC107660500,LOC107557866 other downstream 827139 21714683 ~ 21716290 (+)

Expression


Co-expression Network