cpped1 (cpped1,LOC107584109,LOC107669238,LOC107554009)


Basic Information

Item Value
gene id cpped1
gene name cpped1,LOC107584109,LOC107669238,LOC107554009
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056710.1
NCBI id CM032079.1
chromosome length 20499150
location 8334404 ~ 8359992 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU128131
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Function

symbol description
cpped1 Predicted to enable metal ion binding activity; protein serine phosphatase activity; and protein threonine phosphatase activity. Predicted to be located in cytoplasm. Orthologous to human CPPED1 (calcineurin like phosphoesterase domain containing 1).

NR:

description
PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: serine/threonine-protein phosphatase CPPED1

GO:

id name namespace
GO:0008152 metabolic process biological_process
GO:0046872 metal ion binding molecular_function
GO:0016787 hydrolase activity molecular_function

KEGG:

id description
K21814 CPPED1; serine/threonine-protein phosphatase CPPED1

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G86553 NA non-coding downstream 135280 8198918 ~ 8199124 (-)
G86505 LOC107692108,LOC107584217,LOC107734162,LOC107669195,LOC107731388 non-coding downstream 144119 8187641 ~ 8190285 (-)
G86513 NA non-coding downstream 180231 8148747 ~ 8154173 (-)
G86516 NA non-coding downstream 221691 8111193 ~ 8112713 (-)
G86775 NA non-coding upstream 175981 8535973 ~ 8538206 (-)
G86798 NA non-coding upstream 237402 8597394 ~ 8628972 (-)
G86807 NA non-coding upstream 263305 8623297 ~ 8626329 (-)
G86809 LOC107731413,LOC107584098,LOC107734194,LOC107663181 non-coding upstream 267102 8627094 ~ 8630207 (-)
G86825 NA non-coding upstream 315654 8675646 ~ 8747077 (-)
G86203 NA other downstream 945494 7388236 ~ 7388910 (-)
G86108 NA other downstream 1230186 7103880 ~ 7104218 (-)
G86049 LOC101886504,LOC101886427 other downstream 1663157 6670319 ~ 6671247 (-)
LOC122355418 pnmt,LOC107571312,LOC107676565 other downstream 2256336 6051168 ~ 6078068 (-)
G85930 LOC107711793,LOC107755027 other downstream 2322293 5990913 ~ 6012111 (-)
LOC122355061 tnfrsf17,LOC107554040,LOC107692075,LOC107690067,LOC107584106,LOC107734209 other upstream 151411 8511403 ~ 8513265 (-)
G86783 cby1,LOC107554026,LOC107734186,LOC107584208,LOC107690074 other upstream 250560 8610552 ~ 8612445 (-)
plbd1b LOC107578697 other upstream 322451 8682443 ~ 8687548 (-)
trnar-ccu_66 NA other upstream 327506 8687498 ~ 8687570 (-)
LOC122355288 LOC107660874 other upstream 515625 8875617 ~ 8878131 (-)

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