G86981


Basic Information

Item Value
gene id G86981
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056710.1
NCBI id CM032079.1
chromosome length 20499150
location 9619682 ~ 9622352 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU128689
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>TU128690
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>TU128691
GGTGCTGCAGCTCGTTTTGAAATACATGGCGCTCACgtaaataagacaaaatattaagcaatatgTACTTGAAAAGGTAACATAATACATCCGTGTTATTTCAATGTTTGATTTAATACAgacacataaatataatttaaggaCACGGACCTTTTCAGGTAGGTagcctttttaaaaagtgaacccaaaaatttgaatgcaatgcaaataattttatttacacgCAAAATGCTTACATGAACGTCATACGAGATTTCAAACCATTCAGAGTACACAAGTTACAGTCTGTTGCTGAAAACCTCAATTTAAAACGCATTAAACATCGTTAAACACATTCAAGCCACTTGAAACAAATCTCACATTACAACGTCaaatttaaagggacagctcaccAATTTACTTACACGTGAtttcaaaaatttaattaaaaaaaaaaaaaagcgtgtgtgtaagagagagagatttagaATACAAAGAGATGTAAAGCATACTCGGTATTGTTTTGTCTCTTCATTTAGATCAATacctaacatttttaaatgtatacctGTTGTGCTCCATCACAGGTTTAAATTAGTGATAGTTTTGAGTAAACAATTAATACTGTAAGAGTCATTACGCTTAACTGAAAAATATCTGTTGCCCCCAAAGTAAACGACCATCAGCTCGCCTATTCGTTTTACGCGGGTTgcaaaaacttaaatatatatagttccCCCGTAAATCTGATAACTGCGTCACGGTGATTTCGTTTTCGTGGTTCACATACTGCTAATGTTAGCTAGCTCAGGCTCGTTTCACTTTAGTCTGGAGTTACGCAACTCCGCTTCCCTTCTGCCCTGTAAACCCGCCCAAGTACACAAGCACCAGACTCCATGTTTGTTCATCTCACCGCCACTGTACCCGCCATATACGACAAGATCCCTCGATCCACCTTCATTTGGGGTTATTTCCAAGCAATGATCCGATTTAATCGAGGAGACCGATTCAACGAcaacatatattcacataaaataaacaatgagtCGACGACTGTAACGTTACACGTATTGGGACCAAAACCAGTTTAAACCACTTTCCGAGTCAATAACACATTTATCCACAAAACTCAACTGTTAAGCCAATTTTCTGGATAAACGTGGTAAAAGATTTGGGTTTGACACGAGTAAATGTTACAACCAAGCTCTTGTTCCATTATCCGATTAGCTTTGTAGATACGACCACTACGAACTAACTCTTTTCGGCTATAAATCTTCTGTTTCAAGCAAGCTatgtttcttatatattttgtttattgtataGTCGGAACACGATTTAAACATTAGAGAAtcgcttatttttttaatgtaaatatatccGCTGCCATCCATGCTCAATGCTAACAGGCTAATATGAACGTGATACAACACATGATCGGTTAAAAAGCCACATCTACGTCTGAAACCATACAAAGACAAGACCGGGATCAAtacaaatagtttaaataaataaataaactgctaATCGTCATGAATGTTCctctaaatatatgtatatctagTTTCTTATACTACTGTATTAATATGTAACTAAGAGGACAAATCAAGCATGAAAAATGTCACTGAACCTATATGaacaatttcaaaaacattgtgttatatacatatacacgcacacacaggtTACATCGTAACCTATAATGTACTTTGTCCATAACTATGTAGCCGAATAATGCTGGTACTTCACCCTAATATGAACCCAAAtactcaataacacaaaaatacacattaaaagcTTTAAAGACGTAAACTAACAGTTTAGACAAAACAACTTTAAACGGGTACCGTTTAATGTTCCCATTCCACAAAGAATGGCGGCTAACAAACTAGCAGAAGCTCACAACAGTCGCTAGGTAACATCAAGTTACATTACTACAAATTCTTGATCACACTCAACAATTACGAGAGCAACAAACTGTATTAGATTAACcttattaaatgatataatttaatttataatactaTGGATTTGCGattatttacaagaaaatagGTAACGAGAAAATGTAAGCTAGCGCCTTTTTGTAAAACAACATGGCCTagatgtaaaaattattattattttttaagagtgGGCTACAATAGCGTTCTAATGATcaaaatagctttaaaaaaacattgaatgtGTAAAACAACAACGTTTCTCGaatgttttaattgaaaatgcaCTGTCTGGAACCCCAGGCTTTCAGCGGAGTTTCCAGCGGATCATACCGAAAAAAGCGCGTGCCGTCCAGCCATTGTTTTTACTCGACCTCGTGGATTCTTGCATTTTCCcgtagaaataaaaaaattaaggaaaATCGTATTAAATATTTCGAGAAATATGAATAAGcgtacaaaataaaagtaaattcataatttaaatggcgcaaaaaacatatttaaaacaaaaataatggcGTTAATCCTCGACGGTAGGTGTAGGCCTCTCACACGAGCTTCTTTTCTAGCACTGTTAGCTGATCCAGAGCGAGACGGACGGAACagca
>TU128692
GAGGGAGTCTTAATAAGTGAGGTGCTCAAATGCAAAcagatttattataattattaatgttgtgCCTACCACAAGGTGGTGCTGCAGCTCGTTTTGAAATACATGGCGCTCACgtaaataagacaaaatattaagcaatatgTACTTGAAAAGGTAACATAATACATCCGTGTTATTTCAATGTTTGATTTAATACAgacacataaatataatttaaggaCACGGACCTTTTCAGGTAGGTagcctttttaaaaagtgaacccaaaaatttgaatgcaatgcaaataattttatttacacgCAAAATGCTTACATGAACGTCATACGAGATTTCAAACCATTCAGAGTACACAAGTTACAGTCTGTTGCTGAAAACCTCAATTTAAAACGCATTAAACATCGTTAAACACATTCAAGCCACTTGAAACAAATCTCACATTACAACGTCaaatttaaagggacagctcaccAATTTACTTACACGTGAtttcaaaaatttaattaaaaaaaaaaaaaagcgtgtgtgtaagagagagagatttagaATACAAAGAGATGTAAAGCATACTCGGTATTGTTTTGTCTCTTCATTTAGATCAATacctaacatttttaaatgtatacctGTTGTGCTCCATCACAGGTTTAAATTAGTGATAGTTTTGAGTAAACAATTAATACTGTAAGAGTCATTACGCTTAACTGAAAAATATCTGTTGCCCCCAAAGTAAACGACCATCAGCTCGCCTATTCGTTTTACGCGGGTTgcaaaaacttaaatatatatagttccCCCGTAAATCTGATAACTGCGTCACGGTGATTTCGTTTTCGTGGTTCACATACTGCTAATGTTAGCTAGCTCAGGCTCGTTTCACTTTAGTCTGGAGTTACGCAACTCCGCTTCCCTTCTGCCCTGTAAACCCGCCCAAGTACACAAGCACCAGACTCCATGTTTGTTCATCTCACCGCCACTGTACCCGCCATATACGACAAGATCCCTCGATCCACCTTCATTTGGGGTTATTTCCAAGCAATGATCCGATTTAATCGAGGAGACCGATTCAACGAcaacatatattcacataaaataaacaatgagtCGACGACTGTAACGTTACACGTATTGGGACCAAAACCAGTTTAAACCACTTTCCGAGTCAATAACACATTTATCCACAAAACTCAACTGTTAAGCCAATTTTCTGGATAAACGTGGTAAAAGATTTGGGTTTGACACGAGTAAATGTTACAACCAAGCTCTTGTTCCATTATCCGATTAGCTTTGTAGATACGACCACTACGAACTAACTCTTTTCGGCTATAAATCTTCTGTTTCAAGCAAGCTatgtttcttatatattttgtttattgtataGTCGGAACACGATTTAAACATTAGAGAAtcgcttatttttttaatgtaaatatatccGCTGCCATCCATGCTCAATGCTAACAGGCTAATATGAACGTGATACAACACATGATCGGTTAAAAAGCCACATCTACGTCTGAAACCATACAAAGACAAGACCGGGATCAAtacaaatagtttaaataaataaataaactgctaATCGTCATGAATGTTCctctaaatatatgtatatctagTTTCTTATACTACTGTATTAATATGTAACTAAGAGGACAAATCAAGCATGAAAAATGTCACTGAACCTATATGaacaatttcaaaaacattgtgttatatacatatacacgcacacacaggtTACATCGTAACCTATAATGTACTTTGTCCATAACTATGTAGCCGAATAATGCTGGTACTTCACCCTAATATGAACCCAAAtactcaataacacaaaaatacacattaaaagcTTTAAAGACGTAAACTAACAGTTTAGACAAAACAACTTTAAACGGGTACCGTTTAATGTTCCCATTCCACAAAGAATGGCGGCTAACAAACTAGCAGAAGCTCACAACAGTCGCTAGGTAACATCAAGTTACATTACTACAAATTCTTGATCACACTCAACAATTACGAGAGCAACAAACTGTATTAGATTAACcttattaaatgatataatttaatttataatactaTGGATTTGCGattatttacaagaaaatagGTAACGAGAAAATGTAAGCTAGCGCCTTTTTGTAAAACAACATGGCCTagatgtaaaaattattattattttttaagagtgGGCTACAATAGCGTTCTAATGATcaaaatagctttaaaaaaacattgaatgtGTAAAACAACAACGTTTCTCGaatgttttaattgaaaatgcaCTGTCTGGAACCCCAGGCTTTCAGCGGAGTTTCCAGCGGATCATACCGAAAAAAGCGCGTGCCGTCCAGCCATTGTTTTTACTCGACCTCGTGGATTCTTGCATTTTCCcgtagaaataaaaaaattaaggaaaATCGTATTAAATATTTCGAGAAATATGAATAAGcgtacaaaataaaagtaaattcataatttaaatggcgcaaaaaacatatttaaaacaaaaataatggcGTTAATCCTCGACGGTAGGTGTAGGCCTCTCACACGAGCTTCTTTTCTAGCACTGTTAGCTGATCCAGAGCGAGACGGACGGAACagca
>TU128693
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU128689 False 2294 lncRNA 0.35 1 9619995 9622288
TU128690 False 2188 lncRNA 0.35 1 9620101 9622288
TU128691 False 2530 lncRNA 0.35 1 9619759 9622288
TU128692 True 2607 lncRNA 0.35 1 9619682 9622288
TU128693 False 2358 lncRNA 0.35 1 9619995 9622352

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
hdlbpb hdlbpb,LOC107733459,LOC107657280,LOC107584388,LOC108430121,LOC108273755 coding upstream 43962 9559680 ~ 9575720 (+)
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si:dkey-219e21.2 LOC107556575,LOC107738991,LOC107665865,LOC107733449,LOC107657266,LOC107584401 coding downstream 26399 9648751 ~ 9653386 (+)
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LOC122355279 cdca9,LOC107733465,LOC107657294,LOC107584382 coding downstream 49169 9671521 ~ 9673314 (+)
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G86959 LOC107657285,LOC107733473,LOC107738963,LOC107665891 non-coding upstream 19000 9596293 ~ 9600682 (+)
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pkd1b LOC107723630,LOC107665861,LOC107556563 other upstream 312851 9285663 ~ 9306831 (+)
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hbbe2 hbbe2,LOC107734191,LOC105910203 other upstream 1421778 8195964 ~ 8197904 (+)
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LOC122355274 shisa9a,LOC107584108,LOC107734251,LOC107669237,LOC107554036,LOC107731434,LOC107692077 other downstream 134895 9757247 ~ 9767228 (+)
LOC122355252 fam20cl,LOC107741571,LOC107664989,LOC107570372,LOC108436593,LOC102782963,LOC108259419 other downstream 242462 9864814 ~ 9874515 (+)
LOC122355255 NA other downstream 260681 9883033 ~ 9899001 (+)
LOC122355192 opn4b,LOC107552747,LOC107739286,LOC107568552,LOC107582762,LOC107700131 other downstream 859140 10481492 ~ 10496277 (+)

Expression


Co-expression Network