LOC122355209


Basic Information

Item Value
gene id LOC122355209
gene name NA
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056710.1
NCBI id CM032079.1
chromosome length 20499150
location 14702568 ~ 14706251 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU130763
AAAAGCCTGGGTTACTAAAGTTCATGCCTGCATTATCACAGCAGCGCAAATTTCTGCTTTTACGGGTCTGAGCGAGCAAGTTCAAGTTCAAGGCGACACGAGGGTCGTGTGTCCGAGGTTTGCAAACGAAAACGAAATTGGATGCAGAGGTATCAGCGCATGAAGGAACCGGGTGTCTGTTGGGGGCGCTGTGGAGCTCTGGAGACACGTGAGAGACACTGCGCACGACATTTTGACGGTTGCCAGTGGAGAAAAAAATCACCAATCAGTGAACGGAGGTGTGTagaaacagccaatcagaatgaaTGCAAGGGTGTTGCTAGGAGATAGGGTGATGTCAGGACAATGCAGTGGGAGGAGCGGAATCCTACACCTGCTGAGGCTGTGATGTCATCACGAGGGGCCGGACTGCGCAGGGTAACTGCAGTTCAGTTGAACAGATACTACACAGAATGCATGGTACTAAAACAATACATATCTGACtacatttaatgcatattttgcatgaatTCTGCAAAGGGAAATTTTTTTACCGAATGGTCACATCCCTATTTAAAGTTGTATTGATAAATTGAATCTACATTATCTGTACTACATTTATATTGCTCGTTCTTCTCATCTTAGGTGCTTTTTATTGAAAGACTCGCTCGTCTATTGGTCAAATTATGcagtaatttattaaaacatttacaaaaggtacaaatattatacaaatctTGCAtgatgcaaaataaacaaataatataattatcacttaaaatgagattttttcaGTCTTTGATGTTGTAATTCCGAATCTTGCTCTTATTCCCTGCAGGACGTGTCTTTTTAGCAGGTGCAAATGTTGTCtggttttgtttcttcttttcctGGAGTGATGCTTTTGTGCCCTCCACACTGACCGGTGGAGCAGGAGGCTGATTAATGTCTGGGTGTCCTCTGTTTGCTGTAGCCTCTCTACCTGAGAGAACAATATGACAAGGGgttaaatctttaattttacaattgTTAACCCCATGTAATGTGGTAGCTGCAAGTCAGTACCggtaatgaaaacatttgttccCTGAAGCTATGAGGCATCACTGTGATCGTGAGAAAAACACTTGACGGAAGAGTGCTTCAgttaaaattatgtaaacagCAAAATGGCATCACTTCGTCCAGATCTATTTAGtggttaaattattaaacaaaaagtataacacaaagaatgaaaataaatcactatatatatatataaaaaacaacaaacctttttatataataaacaatgctataattcaaaaattttaaaatttcctaaatgtttttaaaaaaatttttggtagtgattaaagcaaaaagaaaaaccctAAACATCTGAACGTTTAGAATATTTTGACCTTTTTAAGAAAAGGCATGttaaatttgtgttttacatGTGCGTTTAAAATTTCACATTAATTTTTACAAAGATTTCTTATATCCTCTCATATTCTTATTTGCCACTGACCCAAATAGAGGTCAACGACACAGTAATATCAGATATTAGCATCTTTAATCTTTCTGACAGAGGTGCAAAAACCAAAACACTTTACTTGTACATGTGAGTGATGCTGAAATGCTTTTTAAGTAAATACAGTTTGATATTTGTACCAAATGATGTACTGTGAAGCAACGCAGACACTGAACCTTTGATTGCATGATCACAGAGCTGCCTCTGCAAGTACCTGTTTCAGTGCCAAGGTTTTCAAATGATGCAAATGTCCAGGGTACAGAGAGGTAAAAATCATGTCTGGTATATTTTTAGCCAACTGGActttgttttcaatttttttgatATTTGCCACTCCTCTGAATGGCTTCATCAGGTGTCTGATGAAACTGATGTACCACTATGAAGTGATTAAAGAGTTACAAAAAGAGCTATTATGCCTGTGTTATCTATTCTTATTCAAAATCAGCCTTTCAGGACAGATCTATGCCACTAGAAGACAATGTAAAATGGTCTGGCTTCAAATGGCTTTATGGTCTAATCAGCATTATGACCATAGATTGGGCAACTTTCCTTTGGCCTTGAGTCCAATCATGCTGCTCTGTCGTGATTCCCCTTATTCTAATCAAATCTGATCCTTTGCCTTGACAAACCAAGTGATGAAATTTTACACGCAGAAGAATGTGTGCAGTAATTAGTTTATGTAATTAGCTAAACAGACAATAAATGATTTTCAGTTTAGTTATGACAAAAGAACTACGAAAGTTGCttaatcatgtttttagtttacaaagttgtatttttgttgcAGTTAAACATCTCATTCTGGTAATATGGCAGGCGCAATACAAGacttatgtttaaatataaattgtctGAAGTGGCTTTTCTGCTCACCTTTGTCCTCACTGTCACTTGTAGAGAACGCAGAGGAACTCAAACCTCGATCCAACATCTTCCACATATTCTGTAGGGAATCATCAGTGCCTATAGATGACAACAGAAAGTGCGATGATCCGGGCAGTTGTACTGGAGCTTCAGATTGGCTTTGTGGAGGAGTGTTTTCTTTACTGCCCACAGACTTGAGGAAGGAACAGAGAAAAAGAactcaacaaaacacacacactacttaCAACCAGTTAgagtcatttagatttttaagtattttatgcGTACCAGAAgatgcatatatttttgtattgtaaactaatattgtgaaatattattacaatttaaaacagttttaatatattttaatgttcattaaagttattcctgtgatgacaacaGTAAGTTTTCCACAGCCAATACTGCAGGCTTCTGTATCACatgatttttcaaaaaacattttaatttgctgataaaaactattattttaatcaatgctgaaaacagccGTGCTGCTTAATGCTTTAGTGAATCTttgaatgtaacattttaaatttgaatttcaaCCAAATT
>XR_006252190.1
TACCGccgcagagaaaaaaaagcgtCTAAAAAGCCTGGGTTACTAAAGTTCATGCCTGCATTATCACAGCAGCGCAAATTTCTGCTTTTACGGGTCTGAGCGAGCAAGTTCAAGTTCAAGGCGACACGAGGGTCGTGTGTCCGAGGTTTGCAAACGAAAACGAAATTGGATGCAGAGGTATCAGCGCATGAAGGAACCGGGTGTCTGTTGGGGGCGCTGTGGAGCTCTGGAGACACGTGAGAGACACTGCGCACGACATTTTGACGGTTGCCAGTGGAGAAAAAAATCACCAATCAGTGAACGGAGGTGTGTagaaacagccaatcagaatgaaTGCAAGGGTGTTGCTAGGAGATAGGGTGATGTCAGGACAATGCAGTGGGAGGAGCGGAATCCTACACCTGCTGAGGCTGTGATGTCATCACGAGGGGCCGGACTGCGCAGGGTAACTGCAGTTCAGTTGAACAGATACTACACAGAATGCATGGTACTAAAACAATACATATCTGACtacatttaatgcatattttgcatgaatTCTGCAAAGGGAAATTTTTTTACCGAATGGTCACATCCCTATTTAAAGTTGTATTGATAAATTGAATCTACATTATCTGTACTACATTTATATTGCTCGTTCTTCTCATCTTAGGTGCTTTTTATTGAAAGACTCGCTCGTCTATTGGTCAAATTATGcagtaatttattaaaacatttacaaaagGACGTGTCTTTTTAGCAGGTGCAAATGTTGTCtggttttgtttcttcttttcctGGAGTGATGCTTTTGTGCCCTCCACACTGACCGGTGGAGCAGGAGGCTGATTAATGTCTGGGTGTCCTCTGTTTGCTGTAGCCTCTCTACCTGAGAGAACAATATGACAAGGGgttaaatctttaattttacaattgTTAACCCCATGTAATGTGGTAGCTGCAAGTCAGTACCggtaatgaaaacatttgttccCTGAAGCTATGAGGCATCACTGTGATCGTGAGAAAAACACTTGACGGAAGAGTGCTTCAgttaaaattatgtaaacagCAAAATGGCATCACTTCGTCCAGATCTATTTAGtggttaaattattaaacaaaaagtataacacaaagaatgaaaataaatcactatatatatatataaaaaacaacaaacctttttatataataaacaatgctataattcaaaaattttaaaatttcctaaatgtttttaaaaaaatttttggtagtgattaaagcaaaaagaaaaaccctAAACATCTGAACGTTTAGAATATTTTGACCTTTTTAAGAAAAGGCATGttaaatttgtgttttacatGTGCGTTTAAAATTTCACATTAATTTTTACAAAGATTTCTTATATCCTCTCATATTCTTATTTGCCACTGACCCAAATAGAGGTCAACGACACAGTAATATCAGATATTAGCATCTTTAATCTTTCTGACAGAGGTGCAAAAACCAAAACACTTTACTTGTACATGTGAGTGATGCTGAAATGCTTTTTAAGTAAATACAGTTTGATATTTGTACCAAATGATGTACTGTGAAGCAACGCAGACACTGAACCTTTGATTGCATGATCACAGAGCTGCCTCTGCAAGTACCTGTTTCAGTGCCAAGGTTTTCAAATGATGCAAATGTCCAGGGTACAGAGAGGTAAAAATCATGTCTGGTATATTTTTAGCCAACTGGActttgttttcaatttttttgatATTTGCCACTCCTCTGAATGGCTTCATCAGGTGTCTGATGAAACTGATGTACCACTATGAAGTGATTAAAGAGTTACAAAAAGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU130763 True 2938 TUCP 0.36 2 14702568 14706223
XR_006252190.1 False 1814 lncRNA 0.38 3 14703599 14706251

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
slc16a3b slc16a3,LOC107755502,LOC107581584,LOC107566576,LOC107702479,LOC107722214 coding downstream 11252 14685097 ~ 14691316 (-)
c1qtnf1 LOC107702481,LOC107755506,LOC107566571,LOC107722189,LOC107581674,LOC107684055 coding downstream 31906 14662207 ~ 14670662 (-)
LOC122355870 enpp7.2,LOC107755509,LOC107702441,LOC107581672,LOC107755405,LOC107566788,LOC107722193 coding downstream 459121 14240399 ~ 14243447 (-)
LOC122355813 LOC107755405,LOC107581672,LOC107684149,LOC107722193,LOC107755509,LOC107702441 coding downstream 462922 14235240 ~ 14239646 (-)
si:ch73-256g18.2 NA coding downstream 555841 14143603 ~ 14146727 (-)
LOC122355547 zgc:91940,LOC107755433,LOC107684063,LOC107565788,LOC107722202,LOC107702442,LOC103021303,LOC106578881 coding upstream 22142 14728393 ~ 14730942 (-)
mbtd1 LOC107684067,LOC107565795,LOC107702488,LOC108430745,LOC107755495,LOC103045049,LOC107722179 coding upstream 53747 14759998 ~ 14770723 (-)
tdrkh tdrkh,LOC107755494,LOC107702489,LOC107722206 coding upstream 65629 14771880 ~ 14780197 (-)
tmem94 LOC107755493,LOC107565798,LOC107722205,LOC107581589 coding upstream 76882 14783133 ~ 14802730 (-)
LOC122355340 LOC107702443,LOC107755432,LOC107565781,LOC108429162,LOC107684133 coding upstream 97331 14803582 ~ 14829643 (-)
G88384 NA non-coding downstream 18268 14680917 ~ 14684300 (-)
G88355 NA non-coding downstream 303640 14398360 ~ 14398928 (-)
G88233 NA non-coding downstream 569430 14131919 ~ 14133138 (-)
G88206 NA non-coding downstream 706616 13994372 ~ 13995952 (-)
G88205 NA non-coding downstream 708382 13993660 ~ 13994186 (-)
G88381 NA non-coding upstream 69 14706320 ~ 14709357 (-)
G88403 fasn,LOC107702482,LOC107579490 non-coding upstream 14264 14720515 ~ 14721234 (-)
G88603 NA non-coding upstream 302247 15008498 ~ 15009558 (-)
G88605 cyth2,cyth1,LOC103381773,LOC107717468,LOC100709795 non-coding upstream 304672 15010923 ~ 15013151 (-)
LOC122355054 NA non-coding upstream 407828 15114079 ~ 15117307 (-)
G88365 NA other downstream 58788 14541566 ~ 14643780 (-)
G88250 LOC107702476 other downstream 552563 14148047 ~ 14150005 (-)
srsf2a srsf2,LOC107702465,LOC107566380,LOC107684046 other downstream 726057 13972882 ~ 13976511 (-)
tcf7l2 tcf7l2,LOC107755529,LOC107702422,LOC107750316,LOC107566231,LOC106949585,LOC106589326 other downstream 1011228 13609420 ~ 13691340 (-)
entpd1 LOC107707825,LOC107755533,LOC107581561,LOC107702455,LOC107684037,LOC107566185 other downstream 1162267 13523668 ~ 13540301 (-)
ndufaf8 NA other upstream 587582 15293833 ~ 15295240 (-)
si:dkey-21c1.1 tepsin,si:dkey-21c1.1,LOC107601406,LOC107755426,LOC107684135,LOC107749856,LOC107601412,LOC107581605,LOC107749858 other upstream 594046 15300297 ~ 15306509 (-)
bicral gltscr1l,LOC107690921,LOC107601433,LOC107749855,LOC107684087,LOC107581606 other upstream 604318 15310569 ~ 15319858 (-)
pmp22b pmp22,LOC107561836,LOC107684480,LOC107597829,LOC107692454,LOC107753252 other upstream 1893644 16599895 ~ 16609807 (-)
G88940 sdk2,sdk2b,LOC107721024,LOC107753272,LOC107597834 other upstream 2010168 16716419 ~ 16719298 (-)

Expression


Co-expression Network