srsf2a (srsf2,LOC107702465,LOC107566380,LOC107684046)


Basic Information

Item Value
gene id srsf2a
gene name srsf2,LOC107702465,LOC107566380,LOC107684046
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056710.1
NCBI id CM032079.1
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Function

symbol description
srsf2 Enables RNA binding activity. Predicted to be involved in mRNA splicing, via spliceosome. Predicted to act upstream of or within regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome. Located in cytosol and nuclear speck. Implicated in acute myeloid leukemia and myelodysplastic syndrome. Biomarker of clear cell renal cell carcinoma and pulmonary neuroendocrine tumor.

NR:

description
PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor 2-like

GO:

id name namespace
GO:0003676 nucleic acid binding molecular_function
GO:0000166 nucleotide binding molecular_function

KEGG:

id description
K12891 SRSF2_8, SFRS2A_B; serine/arginine-rich splicing factor 2/8

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_043253200.1 False 2462 mRNA 0.45 3 13972882 13976511
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XM_043253203.1 False 1778 mRNA 0.46 3 13972882 13976511
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network