lrp2b (LOC107753462,LOC107669174,LOC107584197)



Basic Information


Item Value
gene id lrp2b
gene name LOC107753462,LOC107669174,LOC107584197
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056710.1
NCBI id CM032079.1
chromosome length 20499150
location 7403552 ~ 7472715 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043253219.1
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Function


NR:

description
glucoside xylosyltransferase 2-like isoform X4

GO: NA

KEGG:

id description
K06233 LRP2; low density lipoprotein-related protein 2

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043253219.1 True 14233 mRNA 0.48 79 7403552 7472715

Neighbor


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kif20bb kif20bb,LOC107669226,LOC107753438,LOC107584147 coding downstream 82298 7555013 ~ 7566171 (+)
pank1b pank1b,LOC107753437,LOC107669213,LOC107683711,LOC107758439,LOC107594157,LOC108413682 coding downstream 115586 7588301 ~ 7597004 (+)
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G86268 NA non-coding downstream 247677 7720392 ~ 7723861 (+)
G86374 NA non-coding downstream 373843 7846558 ~ 7846862 (+)
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G85986 adprh,LOC108411014,LOC107726130,LOC105894051,LOC108274007 other upstream 1186985 6214919 ~ 6216567 (+)
LOC122355675 NA other downstream 343108 7815823 ~ 7844083 (+)
msrb1b msrb1b,LOC100705913 other downstream 632433 8105148 ~ 8106780 (+)
hbbe2 hbbe2,LOC107734191,LOC105910203 other downstream 723249 8195964 ~ 8197904 (+)
arsg arsg,LOC107734203,LOC107660857,LOC107692046,LOC107554066 other downstream 1363733 8836448 ~ 8852449 (+)
pkd1b LOC107723630,LOC107665861,LOC107556563 other downstream 1812948 9285663 ~ 9306831 (+)

Expression



Co-expression Network