kbtbd2 (kbtbd2,LOC107711671,LOC107674719,LOC107660299,LOC107708283,LOC107551836)



Basic Information


Item Value
gene id kbtbd2
gene name kbtbd2,LOC107711671,LOC107674719,LOC107660299,LOC107708283,LOC107551836
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056710.1
NCBI id CM032079.1
chromosome length 20499150
location 5691358 ~ 5699906 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


>XM_043254043.1
CTTTGAGAACCACTGCATCAGGCTGTGGGCCAGGCGGACGCCTGTCCCACCCCCTTCAGTGACACGATTGACGTTGGTTTCTCTTCTACCAGTTTTATGCTCGAGCTGCTAGCATGCAGTTAGCTTTCCTGATCGAAGCAACTTCTTAAATTAGGCTTCCGTAGCTCACGCGGTGTCTAAAGGCCTGAATAAGTCACTTTATCTTTGCTTACGTAGCGTAAACGTTTTTAGTGCATGAGCGATATTCTTTGATCCATTAAAATCGATCTATTCGATTGCGGGAAAGTATTGTTATTTGTATAAGGGGAACAAGAGCTAGCTAGCTGCGTTAGCATGTCAGATTTGCTCATACAGATATATTTAGCTACATACTGCTATAGTAGTGATCAGTGTGTTATATGCGCTTTACTTTTCTTCAAATACTGAAATTATGATCATCGTGTCAGGATGTTTGATGTAGGCGCATAAAGCATCAGGCATCGATCCGGTTAGGGCATAGTATTTTAAGCAGCCCTCTGTCTGTGAAATAGCCTCGTCTTTGTGTTGTGGATCCGGTAGAAACGCACAGCAGCCGGAGTTCCAAGCAGCACATCGGAGACACACTGGACTGCAGGTGACCTGATGTTGACATCTCCCTCTACCTCTAGTCACTTCCTCCCTCAATCCCAGTGTCCTCTGAGACCGCTGAACTCTAGAACCGCtAAGCTGGTTGAAAACTCATGGGATACGAACATGTCGGAGGTTGGAGAGCGTCGGCAAGTCAACACAGATTATGCTGTTTCTGTGCTAGAACAGCTAAAGTTTTTCTACGAGCAGAAGTTGCTGACTGACATCACTTTACTGGTGGAGGAGAACGAGTTCCCCTGCCATAAAATGGTGCTAGCCACCTGCAGCTCTTACTTCAGGGCCATGTTTATGAGTGGACTCAGTGAGAGCAAGCAGACACATGTTCATCTTAGAAATGTTGACCCCATCACACTGCAGACCATCATAACCTATGCTTACACCGGGAACTTAGTCATCAACGACACCACTGTGGAGCCTCTCTATGAGACAGCCTGCTTTCTTCAGGTGGAGGATGTTTTACTGCAGTGTCGAGAATACTTGGTCAAAAAAATCACTGCTGAAAACTGCGTCCGCATGCTAAGCATTGGTGACCTGTTTAGTTGCACAGAGTTGAAGCAAAGTGCTAAGCGCATGGTGGAGCACAAATTTCCTGTTGTCTACCGACAGGAGGCTTTCTTGCAGCTCTCGCACGAGCTGTTGCTGGACCTTCTGAGCAGCGATAATCTCAATGTGGAGAAAGAGGAAACTGTACGTGAGGCGGCCATGCTGTGGCTGGAATACAACATGGAAGCACGTTCTCAGTATTTGTCCTCCGTCCTTAGCCAGATTCGAATTGATGCGCTTTCTGAGGTGACCCAACGTGCCTGGTTCCAAGGTCTTCCACCAAATGACAAATCAGTGGTAGTGCAAGGCCTGTACAAGTCTATGCCAAAGTTTTTTAAGCCCAGACTGGGCATGACCAAGGAAGAAATGCTAATTTTTGTAGAGGCTGAACCACCAGCTGAAAGCCACCCAGTTGTGATAGGTCCACGCCACACAGTGGTCTGTTACAGCCCTCAAGCGGAGAAGGTCTATAAACTGTGTAACCTGCCTGGAGACTTGCAGAAGGTTGGGACATTGGTCACCCCGGACAATGATGTGTTCATTGCTGGTGGACAGATACCACTGAAGAGTGCTCTAGCTACCCACGGAAGCAAAAGTGGCAAGCTGCAGGCTGCCTACTGTTCAGTGGACAGCTTCTACTGGCTGGATGCCCAGCAGAATGCATGGGTGGTCAAAACACCGATGCTATACGCTCGCACTAAACCATCACTGGTGTATTGTCAGGGTTTCATTTATGCTATTGGCGGTGATAATGTAGGTGGAGAGTTGAATAAGCGCACAGTGGAACGCTATGATTGTGAACGGGATGAATGGAGCTTGACTAGCCCTCTTCCCTGCGCTTGGAGTTGGAGCACAGCGGTAACAGCCCGGGACTGCATCTATGTCATGACACATGACCTCATGTACTGCTACTTCCCTCGAGCTGACACTTGGGTGGAAATGGCCATGCGGCAGACTAGTCGCTGCTTTGCTTCAGCGGCTGCATTAGGAGAACTCATCTTCTATATTGGTGGTCTACATGTGGTGGGCAACTCGGGTTTGCGTCTGCCAACAAGCACTATTGATGGCTCCTCGGTTACGGTAGAAATATACGATGTCAACAAAAATGAATGGCGTCTGGCTGCTAACATCCCAGCCAAGCGGTACTCTGATCCATGTGTGCGTGCCGTGGTGCTACTGAATACGCTATGCATCTTTATACGCGAGACACACTTAAACGAGAGGGCAAAATATGCTCTCTATCAGTACGACTTGGAGCGTGACTGCTGGTCCTTGCGGCAGCCAGTGTCAGAACGTGTGCTCTGGGACCTCGGCAAAGATTTTCGCTGTGCCGTGGGTAAATTATACCCATCCTGCCTTGATGAATCTCCCTGGAAGCCACCTACTTACCTCTTCTCTCCTGATGGAGCTGAGGAGTTTGAGGTGGATGAGGACATGGTGTCACTGCCTCATGTATAGTTAATGGCGTAGTCTTTAAAACTAACCTGTAATTTATCCACTCTTCTGGAATAATGCTCTTCTGTTTTGAGAGGAAAGGTGATTAAGCTGATGGACGGTCTTCCCTTAATGCCTGGTGTGCTCATGGAGATCAAATGTTTAATTggcaactaaaatatttcattcagaTTTTGACATATCTCCGACACTTGTAGTGTTGATCATTCTCAAAGCAAGGTTgagaacataaatatttaatttctctcATTGCAAGTTTGGCATTCTGTTATAACAATTTGATGGTATAAACGAATGATGCAATTAAACCTTGTTTGGCTAAAAATGGCAACTGTACACCCAGAGTTCATAAATTTCTCACTCTTCTTTTGTCCAGTTCATCTTTCAGAAGTCAATTGCTCACCTTTCTCCTAAATGTCAACAGGGAAACAAGGTTCAAGGGGATGGCAAGATATTTTATACTGAATGTCTTTAGATGTTTTGATTCGCCGCTGGTTTGGTGACTTGCTTGAcattgattttgttgttgtcattgttTGCATCTGTATTATCATAGTTCATGTTCTCTGTGGTCTGTCTGTTGACCTGTTTTGCATATGACATCATTTGACCTCTTAAAATGGTAGGTTTCATACTTACCACCACAAACACACTAGAGATACCTCAGGGTGCTTTCCAGTCTGGTTTTGTGCTCTGTTTACcatatcatttatttctctCTAGTTcgcaaattaatttgttttttttggcatctTTGTCTCCAagttcctgtgtgtttgtcctCGATTATAGACAAATGCAGGAAATGCCTGCTAGAGTATTCATTTTCCATCATGTTCAGATGTCTGTATGTTTAGAAAGTGGGGAACTGGATTGAAACaggttgaaaaaaataaaaacaatttactcTTGAGTCATCA
>XM_043254044.1
GTGGTTGTGATCCGGATATCTGCGTCCCTTTTCGGCTCCAGATGTGAGCAACTGTTCACTGTACCTGAAAATGTTGGCGTATCACAGTGAGATGTTGATCCCTCATTATAGTAATTAACTACTACATGAAAATGCCGGGACAAAACACATTGAAATTAATATAAGAGATTCTAATAGGTATTTGTATTACGTTGAGTACAGTAAAGTTATAGTTGTTTCTTCGACGTTTTTCATATATAGTGAAATGTGGATGTATGGGTTCATGTGGTGGTATTATTGAACCCATTAAAGCGTGGTTGGTGAGACTGGTTCTACgatcaagcttttttttttttttttttgggaaatgcaGTCTGAACTGATGAGCTTTCACGGGAACGGTTCCCGTCCCGCCAGTTTAAGAACCTTAATGAGAACTGTGGTCGATACCGACAGTTCACTGCTATGTATTGTACCTCCAATAGGTTTGCATTCTCATATTTCCTTCACGTGCTGAGCTGACGTAGATGATTGCGCTAACCGACAACGTCAGATTATTTACGTGCTGTGTGATGTAGCGGCTGATCATCAATACCCGAGTAACCCAAACTATAAATATGTCGTGGACCGTGGTAATATCTAGGGCGacctttttttgttcatataatcACAAACTATGCGacgtttgaaaataaatataatttcaaccgaaatcaaaatatacactttacttattcaaaataaaaaagtacacattaaatcaaaagtcaaggtttttttttctcttatgtatgaatgttttataGTTCTGTATGCTAGTGTTGGAAAGTAATGCCTTTGTAGCAACACATTAATATTGATGTCTCCAGTAATGAGCAggttagcatttattaatgtttttttcagtaaaatgtgAAAGTTTCTGTTCATAATTTAACTTATTACAACTTTGTTGTCTCAGCCCCTTGCTTACGTGAGTCATCAATCCACAAATTAGTTTTCACAATAACAACATCATCATTGCTAGCgtgaaagatgaaaaacaaaattcagccgctgaaataaattttttattttgtctggaGAAAAGACGATGATACAAAATATTgagtgtctatttacactaTAGGCAAATAACCTTCCTTGTTGGTAGAGTCTAAGTTATTAGTGCAAGCTGTTTTGTAATGtactataatactatattatatattataatgtaatatgcagataattgccactatttgcaataagtagtaaagcataaaatcatataaatagaATCTATAGCTagttgcacttagtgtaaataccATATCACTAAAATGCCGCTATTTATACTTAAATGGCATCTATCAGTAAGAAAATATACTATTTTCAGTTAGTAAAACACGATTGCTACACATAACAGTTAATGAGattaatactatatttttacttaaaacttactctaaagtgttttttttgtttaaataaaagaaaattgaaaCATAGAACAAgttgtatttacatttcaagACGTAATTTACAGATCTGTTTCGATATGTACCATGTCAGATATTTTTCACTGTCAATCATTGCATTCTTAGAAGCAATACcacatgtaattacattttgtcagTACAAATATTTTGCTGTGTGTAGGTAGCAGTATAAAtcgttaaatattaaaaataaaactactccCTTCATTTGTGAGCGTGTAATTGGCAGCAAGTGAGTGTTCTGATTCtgctgaatgaaataaaattgttttcagTGGAAATGAAATTGTTTCTCaaatcataaatatatgaaGCATGTCCTGACTCTTGATCGGGCTGCCTCTGGCATAATACCCGCGATAGCCGTAGAGAGTGAATAAGCGTCACCTACTGGATGTTGCGTGCCTATATAGCTGAAACTTGGCAGCCACAAAAATGCCATGAAAGCAGAATACATCACCCATATTCTTTGTTatactttgtttttcattttcaaacagatCAGATGCCAGAAGAGCGTACTATCAGTGTTGGTTGTTCTCCATATGGTTTTTCTTCTCCAGTCACATTTGTCCTTGCGAGTCTCCATGAGTCATCGTGTCACTGTGAAATCGTTCCTACAGTCAATAAGTGTGTGGTCTCACGCGCTGGTCGAATTGTCTGATGTGGTCATTCAGAGGATTATTAAGCTAAAAACCAATTTGAGCTATACTCATGTGGTCTTGAATGGTTTTAAAATCGGACACACTGGACTGCAGGTGACCTGATGTTGACATCTCCCTCTACCTCTAGTCACTTCCTCCCTCAATCCCAGTGTCCTCTGAGACCGCTGAACTCTAGAACCGCtAAGCTGGTTGAAAACTCATGGGATACGAACATGTCGGAGGTTGGAGAGCGTCGGCAAGTCAACACAGATTATGCTGTTTCTGTGCTAGAACAGCTAAAGTTTTTCTACGAGCAGAAGTTGCTGACTGACATCACTTTACTGGTGGAGGAGAACGAGTTCCCCTGCCATAAAATGGTGCTAGCCACCTGCAGCTCTTACTTCAGGGCCATGTTTATGAGTGGACTCAGTGAGAGCAAGCAGACACATGTTCATCTTAGAAATGTTGACCCCATCACACTGCAGACCATCATAACCTATGCTTACACCGGGAACTTAGTCATCAACGACACCACTGTGGAGCCTCTCTATGAGACAGCCTGCTTTCTTCAGGTGGAGGATGTTTTACTGCAGTGTCGAGAATACTTGGTCAAAAAAATCACTGCTGAAAACTGCGTCCGCATGCTAAGCATTGGTGACCTGTTTAGTTGCACAGAGTTGAAGCAAAGTGCTAAGCGCATGGTGGAGCACAAATTTCCTGTTGTCTACCGACAGGAGGCTTTCTTGCAGCTCTCGCACGAGCTGTTGCTGGACCTTCTGAGCAGCGATAATCTCAATGTGGAGAAAGAGGAAACTGTACGTGAGGCGGCCATGCTGTGGCTGGAATACAACATGGAAGCACGTTCTCAGTATTTGTCCTCCGTCCTTAGCCAGATTCGAATTGATGCGCTTTCTGAGGTGACCCAACGTGCCTGGTTCCAAGGTCTTCCACCAAATGACAAATCAGTGGTAGTGCAAGGCCTGTACAAGTCTATGCCAAAGTTTTTTAAGCCCAGACTGGGCATGACCAAGGAAGAAATGCTAATTTTTGTAGAGGCTGAACCACCAGCTGAAAGCCACCCAGTTGTGATAGGTCCACGCCACACAGTGGTCTGTTACAGCCCTCAAGCGGAGAAGGTCTATAAACTGTGTAACCTGCCTGGAGACTTGCAGAAGGTTGGGACATTGGTCACCCCGGACAATGATGTGTTCATTGCTGGTGGACAGATACCACTGAAGAGTGCTCTAGCTACCCACGGAAGCAAAAGTGGCAAGCTGCAGGCTGCCTACTGTTCAGTGGACAGCTTCTACTGGCTGGATGCCCAGCAGAATGCATGGGTGGTCAAAACACCGATGCTATACGCTCGCACTAAACCATCACTGGTGTATTGTCAGGGTTTCATTTATGCTATTGGCGGTGATAATGTAGGTGGAGAGTTGAATAAGCGCACAGTGGAACGCTATGATTGTGAACGGGATGAATGGAGCTTGACTAGCCCTCTTCCCTGCGCTTGGAGTTGGAGCACAGCGGTAACAGCCCGGGACTGCATCTATGTCATGACACATGACCTCATGTACTGCTACTTCCCTCGAGCTGACACTTGGGTGGAAATGGCCATGCGGCAGACTAGTCGCTGCTTTGCTTCAGCGGCTGCATTAGGAGAACTCATCTTCTATATTGGTGGTCTACATGTGGTGGGCAACTCGGGTTTGCGTCTGCCAACAAGCACTATTGATGGCTCCTCGGTTACGGTAGAAATATACGATGTCAACAAAAATGAATGGCGTCTGGCTGCTAACATCCCAGCCAAGCGGTACTCTGATCCATGTGTGCGTGCCGTGGTGCTACTGAATACGCTATGCATCTTTATACGCGAGACACACTTAAACGAGAGGGCAAAATATGCTCTCTATCAGTACGACTTGGAGCGTGACTGCTGGTCCTTGCGGCAGCCAGTGTCAGAACGTGTGCTCTGGGACCTCGGCAAAGATTTTCGCTGTGCCGTGGGTAAATTATACCCATCCTGCCTTGATGAATCTCCCTGGAAGCCACCTACTTACCTCTTCTCTCCTGATGGAGCTGAGGAGTTTGAGGTGGATGAGGACATGGTGTCACTGCCTCATGTATAGTTAATGGCGTAGTCTTTAAAACTAACCTGTAATTTATCCACTCTTCTGGAATAATGCTCTTCTGTTTTGAGAGGAAAGGTGATTAAGCTGATGGACGGTCTTCCCTTAATGCCTGGTGTGCTCATGGAGATCAAATGTTTAATTggcaactaaaatatttcattcagaTTTTGACATATCTCCGACACTTGTAGTGTTGATCATTCTCAAAGCAAGGTTgagaacataaatatttaatttctctcATTGCAAGTTTGGCATTCTGTTATAACAATTTGATGGTATAAACGAATGATGCAATTAAACCTTGTTTGGCTAAAAATGGCAACTGTACACCCAGAGTTCATAAATTTCTCACTCTTCTTTTGTCCAGTTCATCTTTCAGAAGTCAATTGCTCACCTTTCTCCTAAATGTCAACAGGGAAACAAGGTTCAAGGGGATGGCAAGATATTTTATACTGAATGTCTTTAGATGTTTTGATTCGCCGCTGGTTTGGTGACTTGCTTGAcattgattttgttgttgtcattgttTGCATCTGTATTATCATAGTTCATGTTCTCTGTGGTCTGTCTGTTGACCTGTTTTGCATATGACATCATTTGACCTCTTAAAATGGTAGGTTTCATACTTACCACCACAAACACACTAGAGATACCTCAGGGTGCTTTCCAGTCTGGTTTTGTGCTCTGTTTACcatatcatttatttctctCTAGTTcgcaaattaatttgttttttttggcatctTTGTCTCCAagttcctgtgtgtttgtcctCGATTATAGACAAATGCAGGAAATGCCTGCTAGAGTATTCATTTTCCATCATGTTCAGATGTCTGTATGTTTAGAAAGTGGGGAACTGGATTGAAACaggttgaaaaaaataaaaacaatttactcTTGAGTCATCA

Function


symbol description
kbtbd2 Orthologous to human KBTBD2 (kelch repeat and BTB domain containing 2).

NR:

description
PREDICTED: kelch repeat and BTB domain-containing protein 2

GO: NA

KEGG:

id description
K10470 KBTBD2; kelch repeat and BTB domain-containing protein 2

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043254043.1 False 3545 mRNA 0.45 5 5691358 5699906
XM_043254044.1 True 5150 mRNA 0.41 5 5691993 5699906

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
si:ch211-217a12.1 si:ch211-217a12.1,LOC107674759,LOC108431403,LOC106590406 coding upstream 7030 5668900 ~ 5684328 (+)
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LOC122355059 adprh,LOC108411014,LOC108274007,LOC105894051 coding downstream 624587 6324493 ~ 6391831 (+)
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G85687 stat5b,LOC107674616,LOC107556764,LOC107727963,LOC102309899 non-coding upstream 195124 5495107 ~ 5496234 (+)
G85685 NA non-coding upstream 198424 5491714 ~ 5492934 (+)
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G85905 NA non-coding downstream 257988 5957894 ~ 5958234 (+)
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G85971 NA non-coding downstream 401256 6101162 ~ 6118513 (+)
LOC122355060 NA non-coding downstream 630431 6330337 ~ 6336029 (+)
drosha drosha,rnasen,LOC107716466,LOC107727962,LOC107556767 other upstream 244639 5426581 ~ 5446719 (+)
LOC122355392 pnmt,LOC107571312,LOC107676565 other upstream 582312 5081165 ~ 5109046 (+)
G85587 NA other upstream 601720 5088925 ~ 5089638 (+)
G85567 NA other upstream 1238083 4452855 ~ 4453275 (+)
LOC122355720 gnrh2,LOC107750862,LOC107671109 other upstream 1272145 4418247 ~ 4419213 (+)
LOC122355829 tgfb1i1 other downstream 66491 5766397 ~ 5816315 (+)
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G85962 NA other downstream 396042 6095948 ~ 6096732 (+)
G85986 adprh,LOC108411014,LOC107726130,LOC105894051,LOC108274007 other downstream 515013 6214919 ~ 6216567 (+)
G86019 LOC107570179 other downstream 740915 6440821 ~ 6441526 (+)

Expression



Co-expression Network