neurl2 (neurl2,LOC107669209,LOC107734228,LOC107699858,LOC107594180)


Basic Information

Item Value
gene id neurl2
gene name neurl2,LOC107669209,LOC107734228,LOC107699858,LOC107594180
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056710.1
NCBI id CM032079.1
chromosome length 20499150
location 8102699 ~ 8105036 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043254415.1
TGCAGAGCTCTCTTTGCACAGATCTCTATGTACTAAGAAGATAAATGTTGctaagaaaaatatgcaacaCAAGCCCACTCTGTAAGTCCTCGTGAGGAccattcagtatttttttttaaagatgaacagCTAGATCTATAAGATACAGTAGATAGTGAATTGTCAATGAGCAGCAAAAACTCCTCCCAGTCATTACTCTTCACTCACCATATCTGTCAGCTATTTAAAACCACAAAACGACACATGCAGGAGGTCAAAAATAGTCAGCCCTTCCCAAGCCACAGGAGTACCATGGTGGAGCTGTGTGCTAAAAAGATCATGCTTTTAACAAGGACTATCCCTAGAGAAGAGCACAGTAAACACTgagaataatgtaaatattctgCTTGAaaaactgtcaaaatggCAGCGGTTTTGGGTCAGTTTATGGAATTCCATTCAGTGCATGGGACAAATGTGAGACTGGACCCATCGGGGACTCAAGCCACCCGAGTAGAAAGTTTTGCAAATGGCGTCTGCTTCAGTAAAGACCCTTTAAGCCCTGGAGAGATCTTCCTAGTGGAGATTGAAGAGAAAGAACTGGGATGGTGTGGTCATTTAAGGATCGGGCTTACTGCTCATGACCCTCGAACACTGGAAACCGTGCCAGAATATTCTCTGCCTGATCTAGTGGATATGGGAAACAGCTGGGTATTTGCAATAACGAGAAATCATAATAAAGTCATTGAAGAAGAAGCAGAAGGTGGTGAACAGCCAAATGTTGGTGATGACGCAGAAAACAAgcctaaaacatttttcacagaCACTCACCtgtatatagaaaacattggcATACCCAGAGACAAGTTGGTGGGACGCAGTCGACCCGGGAGATTCAGTCACATCCTGGATGATCTGTACAAAACCAACGCTCTACCCCCCACTGCCCGTCGCAGTCGGATTGGGGTTGTCTATGTACCTAAGGGGCAAGGTTATGGCGACATGCACATAATCGTCAATGGTGAAGACATGGGAGCCTCTGCCAAGAGGATCCCCACCAATAAGCCACTTTATGCTGTTGTGGATGTATTTGCAGCTACTAAATGTGTTCGGATTGTCCAGGTGGAATATGGCTTTGCCTCACTGCAGACACTCTGCCGAAAGACAATTCAGAAACACATCGTTCACAGAATGGCTTTGGACTGGTTGGAACTTCCGGAGAAACTTAAACACTATTGCAAATATGAGTGAGCATAACTTATAAAACATCTGAGCAGCAATGCCTTTAAGACTTAATGTGGCtggaatgttgtttttattctccCTTTCAACGAAAAAATTCCACCTTTTCAacgaaaaaaaagttattttgaagcACTTGCACTGTTACTAAATAGTGCTAATACTCATTTTAATGTACTTAAATTGTGAATCTTATACTCTGATACTGTGAGTGAGTCGAAAATGCATGGCTATTGGCCCTGTAAACCTgtcttaataaataatagttcagggctgtccaaactcggtcctggagggtcagtgtcctgcagagtttagctccaaccctaaaactaaaactaaagctcTTACTAGGCATGTTAGAAACATGCAGGAGTGTTGAGGCAGGTTGGACCTAAACTCtgaataagaaatattattagaaatgttatttatgataAAAGCTCTGTGGTATTATTATAGGGGTAAAATATACCATATAATGCAGTGCAACCAGCGTACATtgataaatgtacaaataaatgttaatgtgtaATTACTGATACacacaggattttttttctcgCTCTAATTTTAATCATGTCGAGGCAGTAGACTTTATAGGGTTAAATGCCCATATGCCATATTTAAATGTCAACCTGCTGGTCTTGACATTTCTGTTGCGTTTGTgaatttttcattcaaaacgTATTTTCTTTGCCAACtgtaaattagtaaataaacgTACTTGAATTTTCACTTGTGATCTTTGACCTTTGAACCCCActgttttcattactttttttttaaaaaaaaggttgaggTTGCTGAAACATTCCTGAAACACATTAAAGCATTCATTCTTTAGCCTGTCATAAAATTACTTTATTCGTAATGTATTTGATTAATCTTTTGAATGAATCGATTTAATGAAGCACCTTttctggttt
>XM_043254416.1
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>XM_043254417.1
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>XM_043254418.1
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Function

symbol description
neurl2 Predicted to enable ubiquitin protein ligase activity. Predicted to be involved in protein ubiquitination. Predicted to act upstream of or within intracellular signal transduction. Predicted to be located in cytoplasm. Orthologous to human NEURL2 (neuralized E3 ubiquitin protein ligase 2).

NR:

description
unnamed protein product

GO:

id name namespace
GO:0035556 intracellular signal transduction biological_process
GO:0016567 protein ubiquitination biological_process

KEGG:

id description
K16782 NEURL2; neuralized-like protein 2

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043254415.1 False 2150 mRNA 0.39 3 8102701 8105036
XM_043254416.1 True 2242 mRNA 0.39 2 8102699 8105036
XM_043254417.1 False 2135 mRNA 0.39 3 8102699 8105036
XM_043254418.1 False 2156 mRNA 0.39 3 8102699 8105036

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rnf151 rnf151,LOC107584225,LOC107669188,LOC107594218,LOC107734173,LOC107731429,LOC107699857 coding upstream 13372 8086091 ~ 8089327 (+)
noxo1b LOC107669189,LOC107734176,LOC107584122,LOC107699855,LOC107731427,LOC107594217 coding upstream 17095 8082634 ~ 8085604 (+)
foxl3 si:dkey-7e14.3,LOC107731394,LOC107594215,LOC107669190,LOC107734180,LOC107584227,LOC108431962 coding upstream 50313 8049576 ~ 8052386 (+)
fam20cb fam20c,fam20cb,LOC107669229,LOC107734234,LOC107699871,LOC105888715,LOC107731385 coding upstream 56660 8009380 ~ 8046039 (+)
LOC122355373 trrap,LOC107669193,LOC107699870,LOC107734152 coding upstream 131145 7902114 ~ 7971554 (+)
meiob LOC107584223,LOC107669206,LOC107734178,LOC107731419,LOC107594203 coding downstream 2150 8107186 ~ 8110679 (+)
mlst8 mlst8,LOC107699873 coding downstream 5891 8110927 ~ 8115043 (+)
grid2ipb grid2ip,LOC107584118,LOC107734213,LOC107669204,LOC107731383,LOC107699877 coding downstream 25809 8130845 ~ 8154082 (+)
lcmt1 lcmt1,LOC107734249,LOC107584116,LOC107669194,LOC107731431,LOC107594185 coding downstream 74968 8180004 ~ 8185974 (+)
aqp8a.1 LOC107584217,LOC107734162,LOC107669195,LOC107692108,LOC107731388,LOC107594225 coding downstream 82517 8187553 ~ 8190280 (+)
G86460 NA non-coding upstream 42523 8056931 ~ 8060176 (+)
G86374 NA non-coding upstream 255837 7846558 ~ 7846862 (+)
G86268 NA non-coding upstream 378838 7720392 ~ 7723861 (+)
G86283 NA non-coding upstream 383416 7718984 ~ 7719283 (+)
G86275 NA non-coding upstream 400900 7701343 ~ 7701799 (+)
G86540 NA non-coding downstream 93058 8198094 ~ 8198410 (+)
G86536 NA non-coding downstream 98547 8203583 ~ 8204143 (+)
LOC122355856 NA non-coding downstream 99109 8204145 ~ 8206748 (+)
G86577 NA non-coding downstream 186807 8291843 ~ 8292062 (+)
G86593 NA non-coding downstream 239633 8344669 ~ 8344968 (+)
LOC122355675 NA other upstream 258616 7815823 ~ 7844083 (+)
G86143 NA other upstream 794470 7307924 ~ 7308229 (+)
G86142 NA other upstream 797851 7303138 ~ 7304848 (+)
G86029 NA other upstream 1580128 6521829 ~ 6522571 (+)
G86019 LOC107570179 other upstream 1661173 6440821 ~ 6441526 (+)
msrb1b msrb1b,LOC100705913 other downstream 112 8105148 ~ 8106780 (+)
hbbe2 hbbe2,LOC107734191,LOC105910203 other downstream 90928 8195964 ~ 8197904 (+)
arsg arsg,LOC107734203,LOC107660857,LOC107692046,LOC107554066 other downstream 731412 8836448 ~ 8852449 (+)
pkd1b LOC107723630,LOC107665861,LOC107556563 other downstream 1180627 9285663 ~ 9306831 (+)
mfsd8 mfsd8,LOC107738985,LOC107556570 other downstream 1551633 9656669 ~ 9664139 (+)

Expression


Co-expression Network